Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4U0E2

Protein Details
Accession A0A1E4U0E2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
647-666GFKKSFGKDSKPRPRRITVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
656-660SKPRP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040458  Vid27  
IPR013863  VID27_C  
IPR040979  Vid27_N  
IPR040768  Vid27_PH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08553  VID27  
PF17748  VID27_N  
PF17747  VID27_PH  
Amino Acid Sequences MNIIKKLLDSSSSSAGSKDLDELITIPTAQLFLRRLPQSPKGELECIYNDCVASIRRTSVAFNYQLVIQKSCQEGESENDEYDGEDDSNSFDDDLKDEWNFLIDCSLNFAQETDVDKNLIYISWKDVNGDLGDKFQLIIDKKLVKAATIDAFIEILYRCEYERKYNKSSDDCTYKQLINEFENYTDQNNDVDSSDEEHDFFEDATDGKDDKDLEKKLIQGTLVVEEIAELRLFDPETASFKLYIEKATVKVLELNNWEYWLSVEDSDNGKAILGTSVNSQMNPVFNFDNLCFIFNYFHDNTALSWLLRFDSFEKLSSFQEGLTRSLWESMNKIKWIKVKDDERDYVLDAFNNLVLEDELEDSTKNDNANEEEEEESEQEEIESRVSNIRSGVTKQEAEDDEDEDEDEAAQRKYLATTKDTKNSQLKVGYKNNRTYVSRGDKLGVFVTNEDDELKFNTTINIKNPTTKNIVNPSKMMLHMEDRAMILQDPNDKSNLYKMDLEYGKIVEEYKVKDDLKVVDFNPLNKFAQLGSEQTFLGISSNGLFKIDPRVSGDKLVESEFKQYASKNDFSTMATTENGYIAVASNKGDIRLYDRLGINAKTQLPALGDPIVGLDVSRDGRWLLATCKTYLLLIDNKIKTGKNSGELGFKKSFGKDSKPRPRRITVSPEHAAFMSTTSGNPLSFTKAHFNAGIDAKEQTIVTSTGPYVVTWSLKKILQGDKDNTYLIKRYNSDVMNDNFKFGSDKNIIIALQDDVAMVNKGSFRKPTRESLGYKKNSIVKGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.21
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.11
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.14
18 0.15
19 0.17
20 0.26
21 0.29
22 0.33
23 0.39
24 0.49
25 0.51
26 0.53
27 0.57
28 0.53
29 0.53
30 0.49
31 0.47
32 0.42
33 0.38
34 0.35
35 0.29
36 0.24
37 0.21
38 0.23
39 0.2
40 0.2
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.24
46 0.27
47 0.32
48 0.3
49 0.29
50 0.28
51 0.3
52 0.35
53 0.35
54 0.32
55 0.26
56 0.28
57 0.3
58 0.29
59 0.26
60 0.22
61 0.22
62 0.24
63 0.29
64 0.26
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.21
69 0.2
70 0.17
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.15
90 0.12
91 0.12
92 0.18
93 0.19
94 0.17
95 0.16
96 0.17
97 0.14
98 0.17
99 0.22
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.15
107 0.13
108 0.11
109 0.15
110 0.2
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.22
116 0.23
117 0.18
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.16
124 0.16
125 0.19
126 0.22
127 0.26
128 0.26
129 0.31
130 0.3
131 0.25
132 0.24
133 0.25
134 0.22
135 0.2
136 0.2
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.15
147 0.17
148 0.26
149 0.35
150 0.42
151 0.47
152 0.52
153 0.58
154 0.6
155 0.62
156 0.59
157 0.59
158 0.53
159 0.51
160 0.5
161 0.44
162 0.39
163 0.39
164 0.35
165 0.29
166 0.31
167 0.28
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.22
172 0.19
173 0.17
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.12
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.21
199 0.21
200 0.23
201 0.25
202 0.28
203 0.28
204 0.29
205 0.26
206 0.2
207 0.2
208 0.18
209 0.16
210 0.13
211 0.1
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.18
236 0.15
237 0.2
238 0.19
239 0.21
240 0.22
241 0.24
242 0.21
243 0.22
244 0.21
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.13
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.17
276 0.15
277 0.16
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.19
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.13
298 0.14
299 0.16
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.19
304 0.18
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.13
315 0.14
316 0.18
317 0.21
318 0.24
319 0.24
320 0.25
321 0.29
322 0.31
323 0.34
324 0.36
325 0.39
326 0.42
327 0.47
328 0.46
329 0.43
330 0.41
331 0.37
332 0.31
333 0.24
334 0.18
335 0.12
336 0.11
337 0.09
338 0.08
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.18
383 0.18
384 0.19
385 0.18
386 0.16
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.09
391 0.08
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.14
403 0.22
404 0.25
405 0.32
406 0.33
407 0.38
408 0.4
409 0.4
410 0.4
411 0.39
412 0.39
413 0.41
414 0.49
415 0.51
416 0.51
417 0.55
418 0.55
419 0.53
420 0.5
421 0.45
422 0.45
423 0.44
424 0.4
425 0.36
426 0.34
427 0.3
428 0.3
429 0.29
430 0.21
431 0.13
432 0.11
433 0.12
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.08
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.12
444 0.13
445 0.16
446 0.18
447 0.24
448 0.22
449 0.29
450 0.3
451 0.32
452 0.34
453 0.34
454 0.35
455 0.38
456 0.43
457 0.38
458 0.38
459 0.36
460 0.33
461 0.31
462 0.28
463 0.19
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.14
468 0.13
469 0.12
470 0.12
471 0.1
472 0.08
473 0.08
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.16
479 0.16
480 0.21
481 0.21
482 0.18
483 0.19
484 0.18
485 0.24
486 0.25
487 0.25
488 0.21
489 0.19
490 0.17
491 0.15
492 0.15
493 0.1
494 0.13
495 0.14
496 0.15
497 0.21
498 0.21
499 0.21
500 0.23
501 0.25
502 0.25
503 0.27
504 0.24
505 0.26
506 0.27
507 0.29
508 0.3
509 0.29
510 0.27
511 0.23
512 0.23
513 0.15
514 0.17
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.11
523 0.11
524 0.08
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.16
533 0.16
534 0.16
535 0.21
536 0.25
537 0.26
538 0.29
539 0.29
540 0.22
541 0.23
542 0.24
543 0.21
544 0.18
545 0.21
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.19
550 0.23
551 0.27
552 0.29
553 0.25
554 0.27
555 0.27
556 0.26
557 0.27
558 0.22
559 0.18
560 0.15
561 0.15
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.09
566 0.07
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.09
572 0.1
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.15
577 0.19
578 0.2
579 0.23
580 0.23
581 0.25
582 0.28
583 0.29
584 0.26
585 0.26
586 0.26
587 0.22
588 0.21
589 0.2
590 0.18
591 0.17
592 0.17
593 0.13
594 0.12
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.08
599 0.07
600 0.05
601 0.07
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.11
608 0.13
609 0.13
610 0.18
611 0.2
612 0.21
613 0.22
614 0.22
615 0.2
616 0.19
617 0.21
618 0.19
619 0.22
620 0.3
621 0.29
622 0.3
623 0.33
624 0.34
625 0.31
626 0.34
627 0.33
628 0.29
629 0.33
630 0.33
631 0.39
632 0.4
633 0.44
634 0.39
635 0.37
636 0.35
637 0.33
638 0.38
639 0.34
640 0.42
641 0.45
642 0.54
643 0.64
644 0.7
645 0.78
646 0.78
647 0.82
648 0.78
649 0.77
650 0.76
651 0.73
652 0.72
653 0.67
654 0.61
655 0.53
656 0.47
657 0.39
658 0.29
659 0.22
660 0.16
661 0.12
662 0.11
663 0.13
664 0.14
665 0.13
666 0.15
667 0.15
668 0.18
669 0.19
670 0.22
671 0.26
672 0.27
673 0.3
674 0.3
675 0.3
676 0.3
677 0.32
678 0.31
679 0.24
680 0.23
681 0.21
682 0.21
683 0.19
684 0.14
685 0.12
686 0.12
687 0.11
688 0.13
689 0.13
690 0.14
691 0.14
692 0.14
693 0.14
694 0.16
695 0.19
696 0.18
697 0.22
698 0.23
699 0.24
700 0.27
701 0.31
702 0.37
703 0.41
704 0.48
705 0.5
706 0.51
707 0.52
708 0.5
709 0.45
710 0.41
711 0.37
712 0.33
713 0.34
714 0.32
715 0.34
716 0.4
717 0.4
718 0.4
719 0.43
720 0.43
721 0.45
722 0.44
723 0.42
724 0.34
725 0.33
726 0.32
727 0.25
728 0.3
729 0.23
730 0.24
731 0.23
732 0.26
733 0.25
734 0.23
735 0.24
736 0.16
737 0.13
738 0.12
739 0.11
740 0.08
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.09
745 0.13
746 0.16
747 0.19
748 0.27
749 0.32
750 0.4
751 0.45
752 0.53
753 0.58
754 0.63
755 0.66
756 0.69
757 0.74
758 0.71
759 0.69
760 0.66
761 0.65
762 0.61