FuNGI

A0A1E4TWM0

Protein Details

Accession

A0A1E4TWM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
875-895	DSAKKHFKRTLKYIDEQKKID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35 IPR042491 Vps35_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MSVRSSSSSVNISPEEQAKILENSIAVIKQQILLMRKFLDVTNKKTRLMDALKHASTFLSELRTNLLTPKQYYELYILVFDGLNYLSVYLKENHLNNHLANLYELVQYAGNIVPRLYLMITVGTVYMSIPDAPIKEIMKDMIDMCRGVQHPIRGLFLRYYLTQRTKDLLPVKVTAISEHSGKLEDSIQFIITNFIEMNKLWVRLQHQGHSSERNKRIKERQELQILVGSNLVRLSQLDHIDSLYYKDHILPTVLEQITQCRDVIAQEYLLDVIIQVFPDDFQLATLDDFLNATLNLNPEVSLKKILITLINRLVGYKKREEIDDVSEKLKTIQLNTDEERGVDDITNDIDLFGKVWNYVQKLIEQKPSIHLEDLSTILDALTKLSITYYPSNYENLSQIYGYAIEVQKNFETNNSIKSKESSELVNANWRLLALSPIYNLSNLLDLLNIEHYYEFLESQHNLKKIVAIEIIEKILKNDVKITEINSIHKMFQLLSFIIESKHDDNNSGKSSAAMKRKLNKSLLFGNDETDSLKSASISVASDNHSSIDNIETVIQQENLAKILHFIYNVNPFINFELLVTAKSYLSKGGLKIKFTYPTLINITLRLIRKLKLMKLIDLKKNDVLLKIKTMFKFISSSVNELYELHQQITLTSINTNISTLCLNLNLMTAQLADEIGLCDISNEFFIQSFVIYEESIVDSRLQYQSILSMIGKLHQCHNLITISPENYDNLITKTALYGSKLLKKTDQCRAVYLASHLWWIVEENQDNESEEEILQPIKKDGKRVLECLQKSLRIADSCLDNSVSLELFTEILNRCLYYFIHGNEVITTKYINGLIELIQNNIKSFENSTNENGTNKSTGNDNEDENDEDDDDIEDSAKKHFKRTLKYIDEQKKIDERFQEIVY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.28
3	0.25
4	0.25
5	0.24
6	0.24
7	0.23
8	0.2
9	0.17
10	0.15
11	0.17
12	0.17
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.13
17	0.15
18	0.19
19	0.22
20	0.23
21	0.27
22	0.27
23	0.27
24	0.27
25	0.27
26	0.33
27	0.35
28	0.42
29	0.49
30	0.51
31	0.53
32	0.53
33	0.53
34	0.51
35	0.52
36	0.5
37	0.49
38	0.54
39	0.53
40	0.51
41	0.49
42	0.4
43	0.34
44	0.29
45	0.22
46	0.18
47	0.18
48	0.18
49	0.22
50	0.23
51	0.22
52	0.25
53	0.29
54	0.28
55	0.3
56	0.34
57	0.33
58	0.33
59	0.34
60	0.33
61	0.29
62	0.25
63	0.23
64	0.18
65	0.15
66	0.15
67	0.12
68	0.1
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.12
76	0.13
77	0.16
78	0.21
79	0.24
80	0.27
81	0.31
82	0.34
83	0.31
84	0.34
85	0.31
86	0.26
87	0.24
88	0.21
89	0.18
90	0.16
91	0.15
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.1
102	0.12
103	0.1
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.08
110	0.07
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.11
120	0.15
121	0.15
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.16
126	0.17
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.17
131	0.16
132	0.21
133	0.2
134	0.23
135	0.25
136	0.25
137	0.29
138	0.3
139	0.34
140	0.29
141	0.31
142	0.28
143	0.26
144	0.26
145	0.22
146	0.25
147	0.29
148	0.34
149	0.35
150	0.36
151	0.37
152	0.36
153	0.42
154	0.43
155	0.4
156	0.37
157	0.36
158	0.35
159	0.35
160	0.34
161	0.27
162	0.25
163	0.21
164	0.19
165	0.18
166	0.17
167	0.15
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.14
172	0.15
173	0.15
174	0.15
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.1
183	0.1
184	0.15
185	0.15
186	0.17
187	0.16
188	0.2
189	0.23
190	0.3
191	0.33
192	0.34
193	0.35
194	0.39
195	0.42
196	0.48
197	0.51
198	0.53
199	0.59
200	0.62
201	0.62
202	0.66
203	0.72
204	0.72
205	0.76
206	0.73
207	0.72
208	0.72
209	0.68
210	0.61
211	0.55
212	0.46
213	0.36
214	0.31
215	0.22
216	0.14
217	0.13
218	0.12
219	0.08
220	0.07
221	0.1
222	0.12
223	0.13
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.15
228	0.15
229	0.15
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.14
237	0.12
238	0.13
239	0.21
240	0.2
241	0.19
242	0.18
243	0.21
244	0.23
245	0.23
246	0.2
247	0.12
248	0.13
249	0.13
250	0.15
251	0.13
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.09
257	0.08
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.16
294	0.16
295	0.19
296	0.21
297	0.22
298	0.21
299	0.21
300	0.24
301	0.25
302	0.28
303	0.27
304	0.27
305	0.27
306	0.28
307	0.31
308	0.3
309	0.32
310	0.33
311	0.31
312	0.28
313	0.27
314	0.27
315	0.24
316	0.23
317	0.17
318	0.13
319	0.16
320	0.19
321	0.23
322	0.24
323	0.26
324	0.24
325	0.23
326	0.22
327	0.18
328	0.15
329	0.11
330	0.09
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.07
343	0.1
344	0.11
345	0.14
346	0.14
347	0.18
348	0.24
349	0.27
350	0.32
351	0.3
352	0.29
353	0.31
354	0.34
355	0.31
356	0.26
357	0.23
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.13
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.06
373	0.08
374	0.11
375	0.12
376	0.14
377	0.15
378	0.17
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.14
383	0.13
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.07
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.12
395	0.13
396	0.13
397	0.1
398	0.14
399	0.13
400	0.2
401	0.21
402	0.22
403	0.21
404	0.23
405	0.24
406	0.21
407	0.21
408	0.15
409	0.15
410	0.16
411	0.16
412	0.21
413	0.19
414	0.17
415	0.16
416	0.15
417	0.13
418	0.11
419	0.12
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.07
444	0.07
445	0.11
446	0.15
447	0.15
448	0.16
449	0.16
450	0.18
451	0.17
452	0.18
453	0.15
454	0.11
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.1
459	0.1
460	0.08
461	0.11
462	0.11
463	0.1
464	0.13
465	0.12
466	0.15
467	0.15
468	0.17
469	0.2
470	0.2
471	0.22
472	0.23
473	0.23
474	0.21
475	0.21
476	0.2
477	0.13
478	0.13
479	0.13
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.11
487	0.11
488	0.13
489	0.13
490	0.15
491	0.16
492	0.21
493	0.22
494	0.2
495	0.18
496	0.16
497	0.21
498	0.25
499	0.3
500	0.32
501	0.34
502	0.42
503	0.48
504	0.53
505	0.53
506	0.49
507	0.46
508	0.47
509	0.45
510	0.41
511	0.36
512	0.31
513	0.27
514	0.24
515	0.21
516	0.15
517	0.13
518	0.09
519	0.09
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.11
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.07
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.09
553	0.11
554	0.17
555	0.18
556	0.17
557	0.16
558	0.16
559	0.16
560	0.16
561	0.13
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.08
572	0.1
573	0.12
574	0.14
575	0.23
576	0.25
577	0.27
578	0.29
579	0.31
580	0.33
581	0.32
582	0.33
583	0.24
584	0.26
585	0.28
586	0.28
587	0.25
588	0.22
589	0.23
590	0.24
591	0.24
592	0.25
593	0.23
594	0.21
595	0.27
596	0.31
597	0.32
598	0.36
599	0.37
600	0.38
601	0.46
602	0.53
603	0.53
604	0.52
605	0.51
606	0.44
607	0.46
608	0.42
609	0.37
610	0.32
611	0.27
612	0.3
613	0.31
614	0.34
615	0.31
616	0.33
617	0.29
618	0.27
619	0.27
620	0.23
621	0.27
622	0.23
623	0.25
624	0.23
625	0.23
626	0.22
627	0.21
628	0.22
629	0.2
630	0.19
631	0.17
632	0.17
633	0.16
634	0.16
635	0.18
636	0.16
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.1
642	0.11
643	0.08
644	0.09
645	0.08
646	0.09
647	0.08
648	0.07
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.07
653	0.07
654	0.07
655	0.06
656	0.06
657	0.06
658	0.05
659	0.04
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.09
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.12
687	0.13
688	0.13
689	0.11
690	0.11
691	0.12
692	0.12
693	0.13
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.15
698	0.18
699	0.18
700	0.22
701	0.25
702	0.26
703	0.25
704	0.27
705	0.24
706	0.21
707	0.23
708	0.24
709	0.2
710	0.2
711	0.2
712	0.19
713	0.18
714	0.19
715	0.17
716	0.15
717	0.15
718	0.14
719	0.13
720	0.13
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.18
725	0.22
726	0.3
727	0.33
728	0.35
729	0.39
730	0.45
731	0.5
732	0.55
733	0.58
734	0.51
735	0.51
736	0.53
737	0.48
738	0.42
739	0.38
740	0.32
741	0.24
742	0.24
743	0.2
744	0.16
745	0.14
746	0.15
747	0.14
748	0.17
749	0.18
750	0.18
751	0.2
752	0.21
753	0.22
754	0.2
755	0.18
756	0.14
757	0.12
758	0.12
759	0.11
760	0.13
761	0.13
762	0.13
763	0.16
764	0.23
765	0.25
766	0.3
767	0.36
768	0.44
769	0.48
770	0.52
771	0.57
772	0.58
773	0.57
774	0.59
775	0.57
776	0.49
777	0.46
778	0.44
779	0.42
780	0.34
781	0.34
782	0.3
783	0.3
784	0.28
785	0.29
786	0.26
787	0.2
788	0.19
789	0.19
790	0.16
791	0.11
792	0.1
793	0.09
794	0.09
795	0.09
796	0.13
797	0.13
798	0.15
799	0.16
800	0.15
801	0.15
802	0.16
803	0.16
804	0.16
805	0.21
806	0.2
807	0.25
808	0.26
809	0.26
810	0.26
811	0.27
812	0.23
813	0.18
814	0.17
815	0.11
816	0.14
817	0.14
818	0.12
819	0.12
820	0.12
821	0.12
822	0.18
823	0.19
824	0.19
825	0.2
826	0.21
827	0.21
828	0.22
829	0.22
830	0.17
831	0.2
832	0.25
833	0.27
834	0.3
835	0.34
836	0.38
837	0.39
838	0.39
839	0.37
840	0.33
841	0.31
842	0.28
843	0.25
844	0.24
845	0.25
846	0.29
847	0.3
848	0.29
849	0.29
850	0.31
851	0.33
852	0.29
853	0.27
854	0.21
855	0.19
856	0.17
857	0.15
858	0.13
859	0.1
860	0.1
861	0.1
862	0.11
863	0.17
864	0.24
865	0.24
866	0.3
867	0.38
868	0.45
869	0.53
870	0.62
871	0.67
872	0.68
873	0.76
874	0.8
875	0.82
876	0.82
877	0.74
878	0.72
879	0.7
880	0.65
881	0.62
882	0.57
883	0.53

A0A1E4TWM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer