Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TRX5

Protein Details
Accession A0A1E4TRX5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22SKSESKIKTFRGPRNFRLRLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11.333, cyto_nucl 5.333, cyto 5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013791  RNA3'-term_phos_cycl_insert  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR016443  RNA3'_term_phos_cyc_type_2  
IPR020719  RNA3'_term_phos_cycl-like_CS  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
IPR036553  RPTC_insert  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
PF05189  RTC_insert  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01287  RTC  
CDD cd00875  RNA_Cyclase_Class_I  
Amino Acid Sequences MSKSESKIKTFRGPRNFRLRLVLATLSGKAIKIEKIRSNDLNPGLKDYEVSFLRLLESVTNGSVIEISYTGTTVIYKPGLIIGGNLIHQCPDSKPVGYFLESMLYLAPFSKKKFSIIFKGITSSKIDASIESIRWGIIPIMEKFGVREVSIHTLKRGSPPLGGGEVHLICNTLLSSPLTLHALEVPKISSVRGVAYCTRVSPSIVNRMIDEVRKVLKPIGCEVNITADVWRGENSGKSPGFGLTLAAESKKNNWRFISEDIGSNGELPEDVANSCCLKLLKEISESGCCGRNQLVFAMVYMCIGKEDIGRLKVHKAQIDDDLIWKLRDIKEVLGAEFYFKDSDDQDQNQLIATVKGIGFTNSSKKIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.81
4 0.73
5 0.72
6 0.65
7 0.57
8 0.53
9 0.45
10 0.36
11 0.33
12 0.31
13 0.25
14 0.23
15 0.2
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.25
20 0.32
21 0.37
22 0.43
23 0.5
24 0.53
25 0.54
26 0.56
27 0.57
28 0.57
29 0.5
30 0.49
31 0.44
32 0.38
33 0.36
34 0.29
35 0.28
36 0.22
37 0.24
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.16
82 0.19
83 0.21
84 0.22
85 0.21
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.15
90 0.12
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.12
95 0.12
96 0.15
97 0.2
98 0.21
99 0.24
100 0.31
101 0.35
102 0.4
103 0.42
104 0.43
105 0.38
106 0.42
107 0.39
108 0.34
109 0.32
110 0.24
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.13
115 0.16
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.11
126 0.1
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.17
137 0.2
138 0.2
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.25
144 0.2
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.13
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.22
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.23
197 0.21
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.18
205 0.21
206 0.24
207 0.21
208 0.22
209 0.21
210 0.21
211 0.2
212 0.18
213 0.15
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.16
237 0.24
238 0.27
239 0.31
240 0.32
241 0.34
242 0.36
243 0.39
244 0.4
245 0.33
246 0.31
247 0.28
248 0.28
249 0.25
250 0.21
251 0.17
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.16
266 0.19
267 0.21
268 0.23
269 0.26
270 0.27
271 0.29
272 0.29
273 0.27
274 0.27
275 0.24
276 0.23
277 0.23
278 0.22
279 0.21
280 0.2
281 0.21
282 0.16
283 0.17
284 0.16
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.12
294 0.17
295 0.2
296 0.22
297 0.24
298 0.3
299 0.35
300 0.39
301 0.38
302 0.35
303 0.35
304 0.38
305 0.41
306 0.36
307 0.32
308 0.32
309 0.29
310 0.27
311 0.25
312 0.26
313 0.23
314 0.28
315 0.27
316 0.25
317 0.31
318 0.33
319 0.33
320 0.3
321 0.28
322 0.25
323 0.23
324 0.23
325 0.16
326 0.14
327 0.16
328 0.14
329 0.2
330 0.24
331 0.26
332 0.29
333 0.3
334 0.3
335 0.28
336 0.28
337 0.23
338 0.17
339 0.15
340 0.14
341 0.12
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.16
346 0.19
347 0.27