Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4U1S9

Protein Details
Accession A0A1E4U1S9    Localization Confidence High Confidence Score 23.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59VFVPVNKHKDNKKGSKNIRLETTKHydrophilic
242-261NWQDDFKKFKRDQKRGKIVNHydrophilic
289-314EIKNAASKKKSKAKERRKKGALTDTSHydrophilic
404-429ADSVSKSKLAARRKKIKEENVDKLTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-308ASKKKSKAKERRKKG
411-419KLAARRKKI
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MSGRKWVDKKKDRTYALVHRSHEDPLYYDGDASERVFVPVNKHKDNKKGSKNIRLETTKDLAVELENEKIRENEGEAALYGITYDDSSYDYMQHLRPIGNNDGIFIAKQEAQDEGKNRSRHKDIVLKSNAEELIPQEALPSKENMKIDYQNMQNIPDMISGFKPDMDPRLREVLTALDDEAYLDEEHDTDDNDIFADLLKEGPAQEGEEDVQDFDEWDMDNYEDEYKDYDSDNENNKGAAENWQDDFKKFKRDQKRGKIVNDWDSDDDFGSDDDDNEEEEEDVLAQLPEIKNAASKKKSKAKERRKKGALTDTSSFSMSSSALFRTEGLRIIDDKYELMAKKQALDNDSEHSEQDEEYQPFDMAAERADFEVMLDDFLENYELEGNGRRLVKKNNEIQRIKDAADSVSKSKLAARRKKIKEENVDKLTSGINSLKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.77
4 0.74
5 0.66
6 0.6
7 0.58
8 0.54
9 0.47
10 0.38
11 0.3
12 0.27
13 0.27
14 0.24
15 0.22
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.17
20 0.16
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.18
25 0.25
26 0.33
27 0.4
28 0.45
29 0.52
30 0.58
31 0.65
32 0.74
33 0.76
34 0.77
35 0.8
36 0.81
37 0.85
38 0.86
39 0.82
40 0.81
41 0.75
42 0.68
43 0.64
44 0.58
45 0.49
46 0.41
47 0.36
48 0.27
49 0.23
50 0.22
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.21
58 0.18
59 0.19
60 0.18
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.06
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.14
79 0.15
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.21
84 0.25
85 0.27
86 0.29
87 0.28
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.2
92 0.16
93 0.14
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.22
101 0.26
102 0.32
103 0.36
104 0.39
105 0.43
106 0.46
107 0.46
108 0.49
109 0.51
110 0.48
111 0.54
112 0.56
113 0.51
114 0.47
115 0.47
116 0.41
117 0.32
118 0.28
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.14
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.19
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.24
134 0.26
135 0.3
136 0.29
137 0.3
138 0.3
139 0.3
140 0.26
141 0.23
142 0.22
143 0.16
144 0.15
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.27
157 0.26
158 0.25
159 0.25
160 0.2
161 0.19
162 0.17
163 0.15
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.16
219 0.2
220 0.21
221 0.21
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.26
234 0.23
235 0.3
236 0.32
237 0.41
238 0.47
239 0.57
240 0.68
241 0.73
242 0.81
243 0.79
244 0.79
245 0.78
246 0.73
247 0.71
248 0.62
249 0.53
250 0.44
251 0.38
252 0.34
253 0.26
254 0.2
255 0.12
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.12
279 0.16
280 0.24
281 0.28
282 0.34
283 0.42
284 0.51
285 0.59
286 0.67
287 0.74
288 0.78
289 0.82
290 0.86
291 0.89
292 0.86
293 0.85
294 0.82
295 0.81
296 0.77
297 0.72
298 0.64
299 0.56
300 0.51
301 0.45
302 0.36
303 0.26
304 0.2
305 0.14
306 0.12
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.15
315 0.15
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.19
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.18
324 0.16
325 0.17
326 0.2
327 0.2
328 0.23
329 0.26
330 0.28
331 0.25
332 0.28
333 0.28
334 0.27
335 0.3
336 0.27
337 0.24
338 0.22
339 0.21
340 0.17
341 0.19
342 0.22
343 0.19
344 0.19
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.08
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.09
371 0.13
372 0.14
373 0.18
374 0.22
375 0.26
376 0.3
377 0.39
378 0.48
379 0.53
380 0.61
381 0.66
382 0.73
383 0.73
384 0.72
385 0.72
386 0.66
387 0.58
388 0.51
389 0.43
390 0.35
391 0.38
392 0.37
393 0.3
394 0.31
395 0.3
396 0.27
397 0.32
398 0.37
399 0.41
400 0.48
401 0.56
402 0.62
403 0.71
404 0.81
405 0.85
406 0.88
407 0.89
408 0.89
409 0.88
410 0.84
411 0.78
412 0.67
413 0.58
414 0.5
415 0.39
416 0.33