Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TR62

Protein Details
Accession A0A1E4TR62    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-111GAPTTLINTKRNNKNSKRSLVILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
564-576RGKAPPGKRRRTR
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MLLQDDGVILSGRSKLEEQKQEGDDDDNRDDHDDDRVDTRSAPIDVNLSLPLKFQQKIIQDLIQNDGLLVLGKGLGLETITANLLHVLGAPTTLINTKRNNKNSKRSLVILLNAYESENEKISQELLELSWLDSFEDLNLNESNSTKNPFVVVGGENVTVDKRGKIYQKGGIISVRSRVFVVDLLSGIIDPNLITGIVLLHAERISETSNESFILTLYRENNGWGFIKALSDQPESFNIGFQPLYNKLKDLKLNKVFLWPRFHIDVTSSLLPKTQNNKVSKKDTRNIVIEINVKMTESMKQIQIAILACIDACISEIRRHNPTLSTEYWTSENALDDEFVRVIRGSLDPVWHRVSWTTKQLVYDLTTLKDLLFKLLSLDSIKFYEFIFQIVESNKPSVNVSKLNQSPWLMLDEATTIITYAKQRVFQVIKEKQKETDKIESTYLLEEQPKWEQLALLLDDINQERQLIDNLELGPVLIMCSSNTVCRQLRTYLTKMKENISDDGHGNKSYSGRKMMIQRIKEYLDWKRAVSKINKSVHQQTIINQQRQQNKKEEELITSKTFTRGKAPPGKRRRTRGNAAVASVNRLHRADLAKENEDIDLVLLDRLDGEIIEVDFDKSQHETEDYDDIVVTGSKVTTWDYDYIDRKDQIIIEAFNNNTDDILLQEIMPSYIIMYEPDLSFIRRVEVYQAVNKDRPAKTFFMYYGNSVEEQKHLNNIRKEKESFTKLIREKGKLANTFSAEEDNKKFQNIRKDQVYNTRIAGGSTFKDPNKETRVIVDMREFSGSSLPNLLHRIGIRVFPCMLTVGDYIISPKICIERKSIPDLISSFKSGRLYQQCEQMFRHYELPTLLIEFEENKSFSLDPFSELRTRLTNNFSGKGTSDPITSKLLQQDIQSKLIMLLLAFPKLKIIWSSSPYQTAQIILELKAKQDEPDPSIAVSVGLDDHDDAVDGPPQYNDAAIDLIQNIPGINNVNYHLIIRKIRNIRELVNMPEEELGEIIGKEAARKATNFFVKNCLKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.24
3 0.33
4 0.42
5 0.46
6 0.51
7 0.53
8 0.52
9 0.51
10 0.49
11 0.44
12 0.4
13 0.38
14 0.31
15 0.3
16 0.31
17 0.3
18 0.26
19 0.28
20 0.24
21 0.22
22 0.25
23 0.27
24 0.25
25 0.25
26 0.27
27 0.24
28 0.24
29 0.23
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.2
34 0.21
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.21
39 0.23
40 0.24
41 0.24
42 0.28
43 0.32
44 0.38
45 0.41
46 0.41
47 0.4
48 0.41
49 0.43
50 0.38
51 0.32
52 0.26
53 0.21
54 0.16
55 0.13
56 0.11
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.12
81 0.15
82 0.19
83 0.28
84 0.38
85 0.48
86 0.57
87 0.67
88 0.73
89 0.8
90 0.85
91 0.85
92 0.8
93 0.74
94 0.72
95 0.66
96 0.6
97 0.53
98 0.45
99 0.38
100 0.32
101 0.29
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.18
131 0.17
132 0.21
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.16
140 0.14
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.19
151 0.25
152 0.32
153 0.37
154 0.4
155 0.45
156 0.45
157 0.45
158 0.43
159 0.39
160 0.34
161 0.36
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.07
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.14
212 0.14
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.16
217 0.17
218 0.19
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.24
223 0.23
224 0.21
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.17
230 0.19
231 0.23
232 0.22
233 0.24
234 0.26
235 0.31
236 0.38
237 0.38
238 0.43
239 0.46
240 0.49
241 0.48
242 0.54
243 0.54
244 0.52
245 0.54
246 0.46
247 0.43
248 0.43
249 0.42
250 0.33
251 0.3
252 0.28
253 0.25
254 0.26
255 0.22
256 0.19
257 0.21
258 0.22
259 0.25
260 0.29
261 0.31
262 0.36
263 0.43
264 0.5
265 0.55
266 0.63
267 0.67
268 0.7
269 0.69
270 0.68
271 0.67
272 0.63
273 0.59
274 0.51
275 0.46
276 0.41
277 0.35
278 0.3
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.17
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.19
291 0.16
292 0.13
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.07
302 0.12
303 0.17
304 0.21
305 0.25
306 0.27
307 0.28
308 0.29
309 0.32
310 0.33
311 0.3
312 0.31
313 0.28
314 0.28
315 0.28
316 0.25
317 0.22
318 0.18
319 0.17
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.21
338 0.2
339 0.2
340 0.21
341 0.25
342 0.25
343 0.3
344 0.3
345 0.28
346 0.29
347 0.29
348 0.28
349 0.25
350 0.24
351 0.19
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.14
385 0.16
386 0.19
387 0.19
388 0.25
389 0.27
390 0.28
391 0.3
392 0.28
393 0.25
394 0.21
395 0.22
396 0.15
397 0.13
398 0.12
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.07
406 0.08
407 0.11
408 0.12
409 0.14
410 0.15
411 0.21
412 0.23
413 0.24
414 0.33
415 0.37
416 0.45
417 0.47
418 0.48
419 0.47
420 0.52
421 0.54
422 0.49
423 0.5
424 0.44
425 0.41
426 0.41
427 0.36
428 0.31
429 0.27
430 0.22
431 0.15
432 0.13
433 0.11
434 0.13
435 0.14
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.05
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.08
471 0.13
472 0.14
473 0.15
474 0.17
475 0.18
476 0.23
477 0.27
478 0.31
479 0.33
480 0.35
481 0.38
482 0.37
483 0.37
484 0.36
485 0.33
486 0.31
487 0.25
488 0.24
489 0.21
490 0.22
491 0.21
492 0.17
493 0.15
494 0.13
495 0.15
496 0.17
497 0.18
498 0.17
499 0.17
500 0.2
501 0.27
502 0.35
503 0.37
504 0.36
505 0.37
506 0.37
507 0.37
508 0.36
509 0.33
510 0.3
511 0.31
512 0.3
513 0.28
514 0.3
515 0.31
516 0.35
517 0.36
518 0.38
519 0.4
520 0.44
521 0.47
522 0.45
523 0.5
524 0.47
525 0.45
526 0.38
527 0.31
528 0.38
529 0.42
530 0.41
531 0.38
532 0.41
533 0.46
534 0.5
535 0.52
536 0.5
537 0.46
538 0.46
539 0.48
540 0.44
541 0.39
542 0.38
543 0.38
544 0.3
545 0.29
546 0.26
547 0.24
548 0.25
549 0.21
550 0.24
551 0.23
552 0.3
553 0.39
554 0.47
555 0.53
556 0.62
557 0.71
558 0.72
559 0.77
560 0.8
561 0.78
562 0.77
563 0.75
564 0.74
565 0.65
566 0.6
567 0.56
568 0.45
569 0.4
570 0.34
571 0.27
572 0.19
573 0.18
574 0.16
575 0.16
576 0.18
577 0.19
578 0.23
579 0.26
580 0.26
581 0.26
582 0.26
583 0.23
584 0.2
585 0.17
586 0.1
587 0.06
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.04
600 0.04
601 0.05
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.1
611 0.12
612 0.12
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.08
618 0.06
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.06
624 0.06
625 0.08
626 0.1
627 0.12
628 0.18
629 0.22
630 0.25
631 0.27
632 0.27
633 0.26
634 0.25
635 0.23
636 0.2
637 0.18
638 0.16
639 0.14
640 0.16
641 0.15
642 0.15
643 0.15
644 0.13
645 0.11
646 0.1
647 0.08
648 0.06
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.07
663 0.07
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.11
669 0.12
670 0.11
671 0.12
672 0.13
673 0.16
674 0.18
675 0.22
676 0.26
677 0.28
678 0.3
679 0.32
680 0.37
681 0.34
682 0.35
683 0.35
684 0.33
685 0.3
686 0.31
687 0.3
688 0.28
689 0.27
690 0.25
691 0.23
692 0.21
693 0.2
694 0.19
695 0.18
696 0.15
697 0.16
698 0.15
699 0.21
700 0.25
701 0.32
702 0.38
703 0.44
704 0.48
705 0.51
706 0.53
707 0.51
708 0.54
709 0.51
710 0.48
711 0.45
712 0.49
713 0.46
714 0.52
715 0.53
716 0.48
717 0.47
718 0.51
719 0.54
720 0.49
721 0.49
722 0.46
723 0.43
724 0.41
725 0.37
726 0.35
727 0.28
728 0.29
729 0.29
730 0.28
731 0.27
732 0.28
733 0.31
734 0.3
735 0.4
736 0.42
737 0.46
738 0.49
739 0.52
740 0.54
741 0.61
742 0.59
743 0.5
744 0.45
745 0.4
746 0.32
747 0.28
748 0.26
749 0.18
750 0.17
751 0.19
752 0.23
753 0.2
754 0.25
755 0.26
756 0.33
757 0.37
758 0.38
759 0.34
760 0.32
761 0.37
762 0.34
763 0.34
764 0.32
765 0.27
766 0.25
767 0.26
768 0.22
769 0.18
770 0.2
771 0.19
772 0.14
773 0.15
774 0.14
775 0.15
776 0.18
777 0.17
778 0.16
779 0.16
780 0.19
781 0.18
782 0.22
783 0.2
784 0.21
785 0.21
786 0.19
787 0.19
788 0.16
789 0.15
790 0.13
791 0.13
792 0.11
793 0.1
794 0.1
795 0.11
796 0.12
797 0.12
798 0.09
799 0.11
800 0.17
801 0.2
802 0.22
803 0.27
804 0.33
805 0.38
806 0.44
807 0.47
808 0.41
809 0.41
810 0.41
811 0.39
812 0.33
813 0.32
814 0.26
815 0.25
816 0.28
817 0.24
818 0.32
819 0.36
820 0.4
821 0.4
822 0.49
823 0.49
824 0.5
825 0.51
826 0.49
827 0.45
828 0.41
829 0.43
830 0.35
831 0.34
832 0.3
833 0.29
834 0.23
835 0.19
836 0.17
837 0.11
838 0.12
839 0.11
840 0.13
841 0.15
842 0.15
843 0.14
844 0.16
845 0.16
846 0.16
847 0.2
848 0.18
849 0.18
850 0.19
851 0.23
852 0.24
853 0.25
854 0.28
855 0.26
856 0.29
857 0.31
858 0.34
859 0.37
860 0.38
861 0.4
862 0.39
863 0.36
864 0.34
865 0.32
866 0.3
867 0.25
868 0.23
869 0.21
870 0.23
871 0.26
872 0.26
873 0.27
874 0.28
875 0.3
876 0.29
877 0.31
878 0.37
879 0.35
880 0.37
881 0.33
882 0.28
883 0.26
884 0.24
885 0.21
886 0.13
887 0.14
888 0.14
889 0.17
890 0.17
891 0.17
892 0.18
893 0.18
894 0.19
895 0.16
896 0.2
897 0.23
898 0.26
899 0.32
900 0.33
901 0.38
902 0.37
903 0.37
904 0.32
905 0.27
906 0.24
907 0.23
908 0.22
909 0.19
910 0.24
911 0.22
912 0.23
913 0.25
914 0.25
915 0.22
916 0.25
917 0.29
918 0.27
919 0.31
920 0.31
921 0.27
922 0.27
923 0.26
924 0.21
925 0.15
926 0.12
927 0.08
928 0.07
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.07
935 0.08
936 0.12
937 0.12
938 0.12
939 0.12
940 0.13
941 0.13
942 0.13
943 0.12
944 0.09
945 0.1
946 0.09
947 0.11
948 0.11
949 0.11
950 0.11
951 0.11
952 0.09
953 0.08
954 0.1
955 0.12
956 0.12
957 0.14
958 0.15
959 0.18
960 0.18
961 0.2
962 0.21
963 0.24
964 0.3
965 0.33
966 0.4
967 0.46
968 0.51
969 0.57
970 0.57
971 0.55
972 0.57
973 0.57
974 0.53
975 0.51
976 0.46
977 0.4
978 0.37
979 0.34
980 0.25
981 0.2
982 0.15
983 0.1
984 0.1
985 0.09
986 0.1
987 0.1
988 0.11
989 0.14
990 0.19
991 0.21
992 0.22
993 0.26
994 0.33
995 0.42
996 0.44
997 0.43
998 0.48