Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YHT8

Protein Details
Accession C7YHT8    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSSKPSARRRQPQRFALPNGKEVHydrophilic
600-626EKKGCRVRYSCKCSKKAFEKANVDEKQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 18, mito 4, E.R. 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010640  Low_temperature_requirement_A  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG nhe:NECHADRAFT_31792  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06772  LtrA  
Amino Acid Sequences MSSKPSARRRQPQRFALPNGKEVIVSLPEDYDNLRKKYGSQDEIQVEVVLHGSTEHCNYLRETRDHHEGRRAKLRERHGPAFDEWEDVQSQLDTFNSEIDRLSTNTNGLSANFNKFGYGAELRTYNDDETPDLDTSASDTVSIASSWSQARLGETTKLFKKPVVKQWFHKGLLWRASENTEIMAIELFFDLLYVGIIHINGEHVWAEPTGKELLRFAITFIMSWKIWADVTLVLSWFETDDVMTRLEILFEIACLLGFTTNMTYAFYDNEEHNTYTMLVSFYLAARFRTLAHYVATGFLLPMIRGVMVCEAINVLIPSVLWIASIHVEMPSRLGLIWVALALDMWGQGIITGLFRYGRMAGENSGIGRFLAQVFEFYPAVNIEHRVERTNAFVSLVFGYSVVGVMFQSYGGYHVNTFLGKAVLGLVQAFVFNWIYFDVDGSNIDVHAIRRSIISSSVWNYAHLPFIMGYILASAGLSKLVLATDAGGANAEQLSDHYSHRAEDEVANGIRFFYCHGLAIAMLFMGVIAYCHEHRKPATLRWSKNTRLANRFAVCIVMFLLPIAKSLNSLNLISITLGLTVWVLLVELFGKSCRNDPFIGEKKGCRVRYSCKCSKKAFEKANVDEKQDVSVAEVLELGAREKTAVAEVQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.88
4 0.81
5 0.74
6 0.68
7 0.58
8 0.47
9 0.39
10 0.33
11 0.25
12 0.22
13 0.18
14 0.16
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.23
19 0.29
20 0.3
21 0.32
22 0.31
23 0.34
24 0.44
25 0.51
26 0.47
27 0.43
28 0.49
29 0.5
30 0.51
31 0.49
32 0.39
33 0.29
34 0.24
35 0.21
36 0.12
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.1
41 0.11
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.2
46 0.27
47 0.33
48 0.34
49 0.37
50 0.4
51 0.5
52 0.53
53 0.55
54 0.58
55 0.57
56 0.61
57 0.66
58 0.65
59 0.63
60 0.66
61 0.7
62 0.71
63 0.73
64 0.73
65 0.67
66 0.66
67 0.6
68 0.59
69 0.5
70 0.44
71 0.35
72 0.3
73 0.26
74 0.22
75 0.2
76 0.13
77 0.13
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.17
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.14
96 0.19
97 0.19
98 0.22
99 0.23
100 0.23
101 0.22
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.23
111 0.24
112 0.19
113 0.19
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.2
118 0.17
119 0.15
120 0.14
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.11
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.12
138 0.14
139 0.16
140 0.19
141 0.2
142 0.26
143 0.3
144 0.34
145 0.33
146 0.34
147 0.4
148 0.44
149 0.52
150 0.56
151 0.57
152 0.59
153 0.69
154 0.74
155 0.67
156 0.63
157 0.59
158 0.55
159 0.57
160 0.53
161 0.44
162 0.37
163 0.37
164 0.34
165 0.28
166 0.21
167 0.14
168 0.12
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.18
376 0.18
377 0.16
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.09
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.13
441 0.13
442 0.16
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.22
447 0.21
448 0.21
449 0.18
450 0.16
451 0.11
452 0.11
453 0.1
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.05
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.04
479 0.04
480 0.07
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.14
489 0.13
490 0.15
491 0.18
492 0.18
493 0.18
494 0.17
495 0.16
496 0.14
497 0.13
498 0.13
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.09
507 0.06
508 0.05
509 0.04
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.07
516 0.08
517 0.13
518 0.14
519 0.19
520 0.2
521 0.29
522 0.33
523 0.39
524 0.49
525 0.54
526 0.59
527 0.64
528 0.71
529 0.67
530 0.7
531 0.71
532 0.69
533 0.67
534 0.66
535 0.66
536 0.59
537 0.56
538 0.48
539 0.41
540 0.32
541 0.26
542 0.21
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.12
547 0.09
548 0.1
549 0.11
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.15
554 0.16
555 0.16
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.15
560 0.15
561 0.1
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.06
566 0.05
567 0.05
568 0.04
569 0.04
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.05
574 0.06
575 0.07
576 0.1
577 0.11
578 0.17
579 0.21
580 0.24
581 0.25
582 0.29
583 0.38
584 0.44
585 0.52
586 0.51
587 0.5
588 0.55
589 0.63
590 0.62
591 0.57
592 0.55
593 0.57
594 0.64
595 0.7
596 0.71
597 0.72
598 0.78
599 0.8
600 0.84
601 0.83
602 0.83
603 0.83
604 0.83
605 0.82
606 0.81
607 0.84
608 0.77
609 0.71
610 0.65
611 0.56
612 0.48
613 0.39
614 0.31
615 0.24
616 0.23
617 0.19
618 0.15
619 0.14
620 0.12
621 0.12
622 0.13
623 0.11
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.11