Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E4TVP1

Protein Details
Accession A0A1E4TVP1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-98FVSNSRKKFKKNDKRIQELCIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.333, cyto 9, cyto_mito 6.499, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
CDD cd11370  RNase_PH_RRP41  
Amino Acid Sequences MEVYSPEGLRADGRRWNEVRNFKCHINTHQNSSDGSSYVEMGNTKVVCLVSGPMESPSSGRKPNSSSNLTVSISMPSFVSNSRKKFKKNDKRIQELCIFLVKTFEQIVIMKNYPRTIISISIVVLSQDGGLLPSCVNAITLALIDAGISMYDYVSSINVGLYDTTPLLDLNHLEENDLSFLTLGVVGKSEKISLLLLEDKLSLDNLEKLLAIGIVGCHRIRDIMDQEIRRHGNLRLSKITNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.38
3 0.45
4 0.5
5 0.57
6 0.58
7 0.59
8 0.6
9 0.56
10 0.62
11 0.59
12 0.59
13 0.6
14 0.59
15 0.6
16 0.6
17 0.57
18 0.5
19 0.49
20 0.41
21 0.3
22 0.27
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.15
27 0.12
28 0.11
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.16
45 0.18
46 0.23
47 0.23
48 0.26
49 0.3
50 0.38
51 0.44
52 0.44
53 0.41
54 0.4
55 0.43
56 0.4
57 0.36
58 0.29
59 0.24
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.18
67 0.23
68 0.29
69 0.37
70 0.42
71 0.48
72 0.57
73 0.67
74 0.7
75 0.75
76 0.79
77 0.8
78 0.85
79 0.81
80 0.76
81 0.69
82 0.59
83 0.49
84 0.42
85 0.33
86 0.23
87 0.22
88 0.17
89 0.14
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.09
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.02
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.19
209 0.21
210 0.27
211 0.35
212 0.39
213 0.42
214 0.49
215 0.5
216 0.45
217 0.44
218 0.39
219 0.41
220 0.43
221 0.48
222 0.48