Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7Z3S5

Protein Details
Accession C7Z3S5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-397QKEFTRASDDQRRQRKKDIMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-429KRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039907  NOB1  
IPR017117  Nob1_euk  
IPR036283  NOB1_Zf-like_sf  
IPR014881  NOB1_Zn-bd  
IPR033411  Ribonuclease_PIN  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004521  F:RNA endonuclease activity  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0043248  P:proteasome assembly  
KEGG nhe:NECHADRAFT_46258  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08772  NOB1_Zn_bind  
PF17146  PIN_6  
CDD cd09876  PIN_Nob1-like  
Amino Acid Sequences MASSEELKPIHSLVLDTGPLIKNDPPANTLRAKAEQLYTLPCIISEIKDAATRSRVETTLLPFVTLRSPKPDSVKVIREFARKTGDLAVLSKPDIEVLALGYELEIERNGGDWRLRSEPGQKGMNGRPPNKPVEGEEAKEPEATLESEVEKLTLEQPRTEEKSEEKSETVPATEPEVEKQPEATEQQTEVEKQTEAKQESEQQFEQQDTPSEDDSDASDDEGGWITPSNLKKKQAATSGSTPSAPVQKTLQAAVLTSDYAMQNVALRMGLNLVAPSLARITHLKNWVLRCHGCFKITKDMTRQFCPSCGQPTLMRASCSTDQFGNFTIHLKKNFQWNNRGNVYSVPKPVHGSANGRLPKNAGGKNNWGNGLILSEDQKEFTRASDDQRRQRKKDIMDQDYLPDLLSGHRSGGNGKIRVGAGRSVNSKRKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.21
5 0.2
6 0.2
7 0.22
8 0.22
9 0.24
10 0.27
11 0.29
12 0.27
13 0.3
14 0.34
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.36
21 0.35
22 0.33
23 0.32
24 0.33
25 0.3
26 0.27
27 0.24
28 0.2
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.16
35 0.2
36 0.21
37 0.22
38 0.25
39 0.25
40 0.25
41 0.28
42 0.27
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.34
47 0.32
48 0.29
49 0.25
50 0.26
51 0.31
52 0.3
53 0.28
54 0.27
55 0.31
56 0.34
57 0.41
58 0.45
59 0.45
60 0.5
61 0.57
62 0.53
63 0.56
64 0.57
65 0.57
66 0.54
67 0.51
68 0.5
69 0.41
70 0.4
71 0.38
72 0.35
73 0.3
74 0.3
75 0.28
76 0.23
77 0.23
78 0.21
79 0.16
80 0.13
81 0.12
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.11
100 0.15
101 0.18
102 0.19
103 0.21
104 0.28
105 0.32
106 0.36
107 0.38
108 0.36
109 0.38
110 0.43
111 0.49
112 0.49
113 0.47
114 0.48
115 0.49
116 0.52
117 0.48
118 0.44
119 0.38
120 0.4
121 0.38
122 0.34
123 0.33
124 0.31
125 0.29
126 0.28
127 0.25
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.12
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.24
145 0.28
146 0.29
147 0.26
148 0.25
149 0.33
150 0.35
151 0.34
152 0.29
153 0.26
154 0.27
155 0.26
156 0.23
157 0.16
158 0.13
159 0.15
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.18
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.16
181 0.21
182 0.21
183 0.22
184 0.22
185 0.29
186 0.31
187 0.34
188 0.3
189 0.25
190 0.24
191 0.24
192 0.23
193 0.16
194 0.16
195 0.13
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.09
214 0.12
215 0.18
216 0.22
217 0.25
218 0.29
219 0.32
220 0.37
221 0.39
222 0.39
223 0.37
224 0.39
225 0.4
226 0.37
227 0.33
228 0.29
229 0.23
230 0.26
231 0.21
232 0.17
233 0.15
234 0.17
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.06
266 0.08
267 0.12
268 0.17
269 0.23
270 0.25
271 0.29
272 0.32
273 0.35
274 0.39
275 0.38
276 0.35
277 0.36
278 0.36
279 0.34
280 0.35
281 0.35
282 0.4
283 0.41
284 0.42
285 0.44
286 0.5
287 0.52
288 0.53
289 0.53
290 0.43
291 0.43
292 0.41
293 0.36
294 0.34
295 0.3
296 0.29
297 0.26
298 0.28
299 0.33
300 0.32
301 0.3
302 0.25
303 0.3
304 0.3
305 0.31
306 0.29
307 0.23
308 0.22
309 0.23
310 0.24
311 0.2
312 0.17
313 0.19
314 0.24
315 0.27
316 0.29
317 0.32
318 0.32
319 0.41
320 0.48
321 0.51
322 0.55
323 0.56
324 0.61
325 0.62
326 0.6
327 0.51
328 0.49
329 0.5
330 0.44
331 0.43
332 0.37
333 0.34
334 0.36
335 0.37
336 0.36
337 0.33
338 0.33
339 0.33
340 0.4
341 0.44
342 0.42
343 0.4
344 0.37
345 0.4
346 0.43
347 0.44
348 0.4
349 0.39
350 0.47
351 0.54
352 0.56
353 0.5
354 0.43
355 0.38
356 0.32
357 0.29
358 0.21
359 0.15
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.2
369 0.19
370 0.28
371 0.37
372 0.45
373 0.53
374 0.64
375 0.73
376 0.73
377 0.8
378 0.8
379 0.77
380 0.79
381 0.8
382 0.76
383 0.71
384 0.67
385 0.61
386 0.55
387 0.47
388 0.36
389 0.26
390 0.19
391 0.15
392 0.17
393 0.15
394 0.14
395 0.16
396 0.17
397 0.19
398 0.27
399 0.34
400 0.32
401 0.33
402 0.35
403 0.34
404 0.36
405 0.37
406 0.34
407 0.3
408 0.34
409 0.4
410 0.45