Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YSE8

Protein Details
Accession C7YSE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-259DRDERPRSQSRSQSRSRSRSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-150LRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5, mito 1, plas 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG nhe:NECHADRAFT_41250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKNKDTVQADARRFLDERGSNATMAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVSFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELAPSDAVMHEYLHYGGDEFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRDGVALTYMDEFVDDLLVKDRVCGTSLWKMPKRETLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEDESEGENGTREESGELSDRDEMDVDRDERPRSQSRSQSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.41
3 0.41
4 0.34
5 0.35
6 0.36
7 0.36
8 0.32
9 0.32
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.04
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.25
133 0.31
134 0.4
135 0.48
136 0.53
137 0.61
138 0.68
139 0.69
140 0.67
141 0.63
142 0.58
143 0.51
144 0.41
145 0.33
146 0.26
147 0.21
148 0.12
149 0.09
150 0.06
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.13
164 0.2
165 0.25
166 0.33
167 0.38
168 0.4
169 0.42
170 0.5
171 0.52
172 0.48
173 0.47
174 0.44
175 0.42
176 0.4
177 0.39
178 0.32
179 0.26
180 0.24
181 0.2
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.25
224 0.27
225 0.3
226 0.37
227 0.42
228 0.44
229 0.52
230 0.57
231 0.64
232 0.7
233 0.76
234 0.8
235 0.82
236 0.85
237 0.86
238 0.87
239 0.87