FuNGI

A0A1E3PBY3

Protein Details

Accession

A0A1E3PBY3

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
421-446	DVDEDGKKVKKPKKPTKKAAAAAAAA	Hydrophilic
465-490	GGEEPPKKKRGSYKKKNKTDANTNNN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
427-445	KKVKKPKKPTKKAAAAAAA
462-482	LPGGGEEPPKKKRGSYKKKNK

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSVTSAQEKAKRTYNEMKAGIPVNGIPVNGTRQQYLQQQQQQQHRPSPLAQQQRQAQLNGNAHGLAGVRSPNQRRVYNFAETSEEILKKYENFDPSLEFHIHENHYRFGNQDGIISKNSQLVKDFLEYVAREEIPHAIVEVLRDAGIRFYEGCIILKVYDHRNTIEVESINETTKNKELKKVPRSFKTLLKPTQLSLFYDLLYQTDSALQRFSDHLGVSMEAEILSLTKRKLDLSVPSNPYHIPEPFRPQSEYPKINKETGEIIHNHRLESTDPESKAFKPYKDLHDDLPQQNSEYEQFMLLMNDKANHALGDSGSDPSQFTRLRFVEQWRIKKEKLKQQSMSANLTSRQFSSQNGNLTPAQQHQLQQQQRLMQLQQQRMQGMSPLQQQQHLLNQQKAMAQQQLQQQQQQQPQQAPQQNKDVDEDGKKVKKPKKPTKKAAAAAAAAAATAGKTLPGYSGKTLPGGGEEPPKKKRGSYKKKNKTDANTNNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.64
3	0.62
4	0.58
5	0.54
6	0.53
7	0.46
8	0.37
9	0.28
10	0.23
11	0.22
12	0.2
13	0.17
14	0.16
15	0.21
16	0.25
17	0.27
18	0.23
19	0.24
20	0.29
21	0.37
22	0.42
23	0.47
24	0.5
25	0.56
26	0.62
27	0.71
28	0.75
29	0.73
30	0.73
31	0.68
32	0.63
33	0.58
34	0.61
35	0.59
36	0.61
37	0.58
38	0.59
39	0.61
40	0.66
41	0.66
42	0.58
43	0.56
44	0.53
45	0.54
46	0.48
47	0.42
48	0.33
49	0.29
50	0.28
51	0.22
52	0.14
53	0.11
54	0.11
55	0.14
56	0.22
57	0.27
58	0.35
59	0.41
60	0.45
61	0.47
62	0.52
63	0.54
64	0.54
65	0.51
66	0.44
67	0.43
68	0.39
69	0.38
70	0.37
71	0.32
72	0.25
73	0.24
74	0.24
75	0.2
76	0.23
77	0.25
78	0.22
79	0.24
80	0.24
81	0.27
82	0.27
83	0.31
84	0.28
85	0.23
86	0.21
87	0.25
88	0.27
89	0.29
90	0.3
91	0.28
92	0.29
93	0.28
94	0.28
95	0.24
96	0.27
97	0.21
98	0.22
99	0.21
100	0.22
101	0.23
102	0.23
103	0.22
104	0.22
105	0.23
106	0.2
107	0.2
108	0.19
109	0.2
110	0.21
111	0.21
112	0.16
113	0.19
114	0.18
115	0.19
116	0.2
117	0.18
118	0.16
119	0.16
120	0.17
121	0.13
122	0.13
123	0.11
124	0.08
125	0.08
126	0.09
127	0.09
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.1
138	0.1
139	0.11
140	0.1
141	0.11
142	0.1
143	0.12
144	0.14
145	0.17
146	0.22
147	0.22
148	0.23
149	0.23
150	0.25
151	0.24
152	0.24
153	0.19
154	0.16
155	0.17
156	0.18
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.16
161	0.21
162	0.26
163	0.24
164	0.3
165	0.38
166	0.47
167	0.56
168	0.64
169	0.66
170	0.67
171	0.73
172	0.69
173	0.68
174	0.67
175	0.65
176	0.61
177	0.59
178	0.53
179	0.46
180	0.49
181	0.42
182	0.34
183	0.3
184	0.25
185	0.19
186	0.19
187	0.18
188	0.12
189	0.12
190	0.11
191	0.07
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.12
220	0.18
221	0.2
222	0.29
223	0.31
224	0.31
225	0.32
226	0.3
227	0.29
228	0.26
229	0.23
230	0.18
231	0.17
232	0.24
233	0.26
234	0.28
235	0.29
236	0.28
237	0.36
238	0.4
239	0.44
240	0.39
241	0.45
242	0.45
243	0.45
244	0.44
245	0.36
246	0.31
247	0.26
248	0.26
249	0.2
250	0.22
251	0.27
252	0.27
253	0.26
254	0.23
255	0.23
256	0.21
257	0.23
258	0.23
259	0.21
260	0.21
261	0.23
262	0.25
263	0.25
264	0.31
265	0.29
266	0.25
267	0.27
268	0.32
269	0.37
270	0.41
271	0.42
272	0.38
273	0.43
274	0.49
275	0.44
276	0.43
277	0.36
278	0.3
279	0.29
280	0.27
281	0.2
282	0.15
283	0.13
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.14
307	0.14
308	0.14
309	0.21
310	0.21
311	0.25
312	0.29
313	0.33
314	0.38
315	0.44
316	0.52
317	0.51
318	0.56
319	0.55
320	0.59
321	0.63
322	0.62
323	0.65
324	0.67
325	0.63
326	0.65
327	0.7
328	0.67
329	0.63
330	0.54
331	0.46
332	0.39
333	0.38
334	0.31
335	0.25
336	0.23
337	0.2
338	0.2
339	0.24
340	0.26
341	0.29
342	0.29
343	0.31
344	0.28
345	0.29
346	0.29
347	0.25
348	0.24
349	0.21
350	0.22
351	0.25
352	0.34
353	0.36
354	0.4
355	0.41
356	0.42
357	0.42
358	0.43
359	0.39
360	0.35
361	0.38
362	0.4
363	0.42
364	0.41
365	0.39
366	0.36
367	0.35
368	0.32
369	0.27
370	0.25
371	0.26
372	0.29
373	0.29
374	0.31
375	0.32
376	0.32
377	0.37
378	0.4
379	0.4
380	0.37
381	0.37
382	0.37
383	0.38
384	0.38
385	0.33
386	0.3
387	0.26
388	0.28
389	0.34
390	0.4
391	0.41
392	0.43
393	0.47
394	0.5
395	0.55
396	0.57
397	0.55
398	0.51
399	0.54
400	0.59
401	0.59
402	0.58
403	0.55
404	0.57
405	0.54
406	0.51
407	0.49
408	0.43
409	0.42
410	0.39
411	0.4
412	0.39
413	0.43
414	0.46
415	0.52
416	0.57
417	0.61
418	0.68
419	0.75
420	0.77
421	0.82
422	0.88
423	0.9
424	0.92
425	0.89
426	0.86
427	0.81
428	0.7
429	0.59
430	0.49
431	0.38
432	0.27
433	0.21
434	0.12
435	0.06
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.09
442	0.12
443	0.16
444	0.19
445	0.23
446	0.24
447	0.25
448	0.26
449	0.23
450	0.22
451	0.2
452	0.21
453	0.27
454	0.33
455	0.39
456	0.45
457	0.5
458	0.49
459	0.54
460	0.61
461	0.63
462	0.67
463	0.71
464	0.76
465	0.82
466	0.91
467	0.94
468	0.93
469	0.92
470	0.92

A0A1E3PBY3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer