FuNGI

C7YQ28

Protein Details

Accession

C7YQ28

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
212-231	AAPAGRKRKKRWDVASAPAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
216-222	GRKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 17, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	nhe:NECHADRAFT_100028 -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFETIKKLQQERNAAAAAKKGSRTFDAGNQRTDDTKQKLIDSADNDLYDRDGPDKFAGYHTSLPMGDDDEEMEGADNTRRLVGQYTASRDMIDEFARGSGVEEDDILAGKGEKSGRIVDRETDYQKRRFNRTLTPTRADPFAKDRKDGAGENGSSYREVMEARELEREEERVRQAIRAKQEGKVDDDDAKPMLTDGDKDSAEAESADAAPAGRKRKKRWDVASAPAETDKSEADDAAKPKRSRWDQAPAISAPGAEAPKKRSRWDQAPSATPMGNQGLATPVHQSSAPALPTTFGTDISGRNLPLSDEELDILLPGENEGYKVLDPPPGYEPVRAPAHKLMATPAAQTGFMMQDPEQVRLSGKPMPAEIPGVGDLQFFKAEDMAYFGKLTDGSDENALTVEELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDNARQFGAGPLFDQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVECIGPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTDGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETVEKIVASLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSVEDVVMLNGFGSVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGIAQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIVEAIEAIRMAVGPGLVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQGADAMVPYYPNLDEDKVDRPELAIVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.51
3	0.55
4	0.55
5	0.51
6	0.46
7	0.45
8	0.42
9	0.38
10	0.38
11	0.36
12	0.36
13	0.37
14	0.4
15	0.39
16	0.42
17	0.49
18	0.49
19	0.51
20	0.49
21	0.48
22	0.46
23	0.46
24	0.46
25	0.41
26	0.44
27	0.42
28	0.41
29	0.43
30	0.44
31	0.47
32	0.41
33	0.41
34	0.38
35	0.36
36	0.35
37	0.3
38	0.29
39	0.24
40	0.22
41	0.18
42	0.15
43	0.17
44	0.19
45	0.21
46	0.2
47	0.22
48	0.25
49	0.26
50	0.29
51	0.28
52	0.29
53	0.26
54	0.26
55	0.23
56	0.22
57	0.19
58	0.15
59	0.14
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.11
64	0.09
65	0.09
66	0.12
67	0.12
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.13
72	0.16
73	0.18
74	0.23
75	0.28
76	0.34
77	0.37
78	0.37
79	0.36
80	0.33
81	0.33
82	0.28
83	0.23
84	0.17
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.12
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.11
102	0.12
103	0.13
104	0.15
105	0.21
106	0.25
107	0.29
108	0.31
109	0.32
110	0.37
111	0.42
112	0.46
113	0.49
114	0.52
115	0.55
116	0.61
117	0.64
118	0.67
119	0.68
120	0.67
121	0.67
122	0.71
123	0.74
124	0.74
125	0.72
126	0.68
127	0.62
128	0.62
129	0.53
130	0.47
131	0.45
132	0.47
133	0.45
134	0.44
135	0.43
136	0.43
137	0.46
138	0.44
139	0.41
140	0.39
141	0.36
142	0.36
143	0.37
144	0.32
145	0.28
146	0.27
147	0.21
148	0.14
149	0.14
150	0.12
151	0.16
152	0.17
153	0.18
154	0.23
155	0.23
156	0.25
157	0.26
158	0.28
159	0.24
160	0.27
161	0.29
162	0.29
163	0.29
164	0.32
165	0.37
166	0.39
167	0.44
168	0.48
169	0.48
170	0.47
171	0.53
172	0.51
173	0.49
174	0.46
175	0.41
176	0.37
177	0.36
178	0.33
179	0.27
180	0.25
181	0.19
182	0.16
183	0.15
184	0.11
185	0.12
186	0.13
187	0.17
188	0.17
189	0.17
190	0.17
191	0.16
192	0.16
193	0.14
194	0.11
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.1
201	0.14
202	0.24
203	0.3
204	0.38
205	0.46
206	0.57
207	0.67
208	0.74
209	0.78
210	0.79
211	0.79
212	0.8
213	0.79
214	0.69
215	0.61
216	0.52
217	0.44
218	0.33
219	0.27
220	0.18
221	0.14
222	0.13
223	0.11
224	0.13
225	0.18
226	0.21
227	0.28
228	0.37
229	0.35
230	0.38
231	0.48
232	0.51
233	0.54
234	0.57
235	0.6
236	0.58
237	0.62
238	0.63
239	0.53
240	0.49
241	0.42
242	0.34
243	0.24
244	0.2
245	0.18
246	0.16
247	0.19
248	0.23
249	0.31
250	0.35
251	0.39
252	0.44
253	0.51
254	0.57
255	0.61
256	0.64
257	0.61
258	0.64
259	0.63
260	0.57
261	0.49
262	0.39
263	0.36
264	0.28
265	0.23
266	0.17
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.16
278	0.16
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.18
284	0.15
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.14
289	0.17
290	0.19
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.14
296	0.16
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.11
302	0.11
303	0.09
304	0.07
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.09
314	0.1
315	0.13
316	0.13
317	0.16
318	0.18
319	0.22
320	0.23
321	0.24
322	0.24
323	0.26
324	0.32
325	0.3
326	0.31
327	0.29
328	0.32
329	0.32
330	0.31
331	0.27
332	0.25
333	0.25
334	0.22
335	0.2
336	0.16
337	0.15
338	0.14
339	0.13
340	0.09
341	0.09
342	0.1
343	0.08
344	0.14
345	0.16
346	0.18
347	0.18
348	0.17
349	0.18
350	0.17
351	0.2
352	0.18
353	0.18
354	0.17
355	0.17
356	0.18
357	0.18
358	0.19
359	0.16
360	0.13
361	0.13
362	0.12
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.1
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.15
396	0.15
397	0.17
398	0.2
399	0.24
400	0.26
401	0.35
402	0.41
403	0.43
404	0.49
405	0.49
406	0.47
407	0.48
408	0.48
409	0.45
410	0.45
411	0.42
412	0.42
413	0.45
414	0.44
415	0.42
416	0.48
417	0.5
418	0.45
419	0.43
420	0.41
421	0.45
422	0.52
423	0.51
424	0.42
425	0.33
426	0.31
427	0.3
428	0.29
429	0.22
430	0.14
431	0.11
432	0.1
433	0.11
434	0.11
435	0.1
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.09
445	0.1
446	0.12
447	0.12
448	0.13
449	0.16
450	0.17
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.18
456	0.2
457	0.17
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.18
463	0.13
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.15
468	0.17
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.18
473	0.16
474	0.14
475	0.13
476	0.13
477	0.14
478	0.13
479	0.12
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.06
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.09
495	0.1
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.12
503	0.1
504	0.07
505	0.07
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.06
518	0.07
519	0.09
520	0.1
521	0.11
522	0.13
523	0.14
524	0.15
525	0.15
526	0.14
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.08
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.06
551	0.08
552	0.11
553	0.16
554	0.2
555	0.23
556	0.28
557	0.37
558	0.45
559	0.52
560	0.55
561	0.58
562	0.6
563	0.65
564	0.62
565	0.57
566	0.5
567	0.45
568	0.44
569	0.37
570	0.33
571	0.26
572	0.24
573	0.19
574	0.17
575	0.13
576	0.08
577	0.06
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.1
599	0.12
600	0.12
601	0.13
602	0.13
603	0.12
604	0.11
605	0.12
606	0.13
607	0.11
608	0.1
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.08
636	0.13
637	0.22
638	0.24
639	0.25
640	0.31
641	0.34
642	0.36
643	0.36
644	0.37
645	0.32
646	0.3
647	0.3
648	0.24
649	0.2
650	0.18
651	0.15
652	0.08
653	0.05
654	0.04
655	0.03
656	0.04
657	0.03
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.04
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.09
681	0.09
682	0.1
683	0.12
684	0.13
685	0.13
686	0.14
687	0.16
688	0.13
689	0.15
690	0.14
691	0.13
692	0.16
693	0.19
694	0.19
695	0.17
696	0.17
697	0.16
698	0.15
699	0.14
700	0.11
701	0.07
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.05
706	0.04
707	0.05
708	0.04
709	0.05
710	0.06
711	0.05
712	0.07
713	0.08
714	0.1
715	0.1
716	0.1
717	0.1
718	0.11
719	0.12
720	0.16
721	0.2
722	0.18
723	0.2
724	0.28
725	0.34
726	0.4
727	0.48
728	0.5
729	0.5
730	0.58
731	0.57
732	0.5
733	0.46
734	0.4
735	0.36
736	0.31
737	0.27
738	0.2
739	0.21
740	0.2
741	0.16
742	0.15
743	0.1
744	0.09
745	0.08
746	0.07
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.07
754	0.09
755	0.15
756	0.14
757	0.15
758	0.15
759	0.14
760	0.15
761	0.16
762	0.18
763	0.18
764	0.19
765	0.2
766	0.22
767	0.22
768	0.22
769	0.23
770	0.21
771	0.19
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.17
776	0.16
777	0.14
778	0.12
779	0.08
780	0.06
781	0.04
782	0.04
783	0.03
784	0.03
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.05
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.07
800	0.06
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.05
808	0.05
809	0.06
810	0.06
811	0.05
812	0.05
813	0.04
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.03
819	0.03
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.08
824	0.09
825	0.12
826	0.12
827	0.13
828	0.14
829	0.2
830	0.3
831	0.29
832	0.31
833	0.3
834	0.33
835	0.33
836	0.32
837	0.29
838	0.22
839	0.22
840	0.21
841	0.22
842	0.25
843	0.26
844	0.27
845	0.3
846	0.32
847	0.37
848	0.41
849	0.39
850	0.33
851	0.33
852	0.32
853	0.29
854	0.26
855	0.19
856	0.15
857	0.12
858	0.12
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.1
870	0.11
871	0.09
872	0.09
873	0.08
874	0.08
875	0.09
876	0.08
877	0.07
878	0.06
879	0.05
880	0.04
881	0.05
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.03
904	0.03
905	0.04
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.06
910	0.09
911	0.1
912	0.1
913	0.11
914	0.12
915	0.13
916	0.16
917	0.17
918	0.21
919	0.23
920	0.24
921	0.26
922	0.28
923	0.33
924	0.37
925	0.46
926	0.45
927	0.51
928	0.53
929	0.59
930	0.62
931	0.64
932	0.61
933	0.61
934	0.57
935	0.53
936	0.5
937	0.42
938	0.35
939	0.28
940	0.23
941	0.14
942	0.11
943	0.08
944	0.08
945	0.08
946	0.09
947	0.1
948	0.11
949	0.14
950	0.17
951	0.2
952	0.22
953	0.23
954	0.23
955	0.26
956	0.25
957	0.24
958	0.24
959	0.22
960	0.21
961	0.19
962	0.18
963	0.19
964	0.19
965	0.19
966	0.15
967	0.18
968	0.22
969	0.22
970	0.24
971	0.22
972	0.27
973	0.33
974	0.43
975	0.49
976	0.5
977	0.59
978	0.65
979	0.72
980	0.67
981	0.6
982	0.51
983	0.41
984	0.36
985	0.28
986	0.2
987	0.11
988	0.13
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.1
995	0.1
996	0.07
997	0.07
998	0.08
999	0.1
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.16
1005	0.19
1006	0.26
1007	0.29
1008	0.35
1009	0.37
1010	0.42
1011	0.42
1012	0.43
1013	0.4
1014	0.32
1015	0.28
1016	0.2
1017	0.17
1018	0.11
1019	0.09
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.05
1023	0.04
1024	0.04
1025	0.04
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.06
1029	0.09
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.23
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.25
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.26
1049	0.2
1050	0.17
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.13
1059	0.12
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.19
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.2
1087	0.2
1088	0.22
1089	0.27
1090	0.3
1091	0.27
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.26
1095	0.25
1096	0.23
1097	0.18
1098	0.11
1099	0.1
1100	0.08
1101	0.06
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.04
1106	0.04
1107	0.04
1108	0.03
1109	0.04
1110	0.05
1111	0.05
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.07
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.1
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.1
1123	0.14
1124	0.21
1125	0.23
1126	0.24
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.22
1130	0.24
1131	0.21
1132	0.14
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.08
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.12
1156	0.16
1157	0.17
1158	0.25
1159	0.31
1160	0.36
1161	0.43
1162	0.49
1163	0.52
1164	0.59
1165	0.65
1166	0.66
1167	0.7
1168	0.7
1169	0.68
1170	0.66
1171	0.65
1172	0.58
1173	0.55
1174	0.47
1175	0.36
1176	0.32
1177	0.27
1178	0.22
1179	0.14
1180	0.11
1181	0.08
1182	0.07
1183	0.07
1184	0.07
1185	0.08
1186	0.09
1187	0.11
1188	0.14
1189	0.15
1190	0.17
1191	0.2
1192	0.27
1193	0.29
1194	0.3
1195	0.28
1196	0.26

C7YQ28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer