Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YHM2

Protein Details
Accession C7YHM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MPKAATEERSKRKRSSTQEKPTKRRRSSSASDESEHydrophilic
242-262YYVPRPKKKAHPLRNVTQHKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-26RSKRKRSSTQEKPTKRRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030692  C:Noc4p-Nop14p complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG nhe:NECHADRAFT_65701  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPKAATEERSKRKRSSTQEKPTKRRRSSSASDESEDPNAKILLMEQGILESRKNYNDITVLLSTANDFKKGEPESMLATVALCRIFVRLLTQGALIAKKSLSEKDLVVVGWLKEQFGEFKKTLLAMLRDEELAPTALTLCMRTLKAEGQFMYDKEEYIFPRAFHRDIMESLLVSENEDASKVYIEEFAEQYDDIRYFTFSSVKYIVEKHSDDNASSELFDRCFALLSALDGVPESADELEDYYVPRPKKKAHPLRNVTQHKKQGQEAWLAIMTLAEEKEQRKRILDIISTVIAPWFTKPELLADFLTNSYDVGGSMSLLALSGVFYLISERNLDYPSFYTKLYSLLDRDILHSKHRSRFFRLLDTFLGSTHLPAALVASFIKRLARLSLNAPPSAIVFVTPWIYNLLKRHPTCTFMIHREERDPEVKKHMSEHGAEDPFLPEEADPMETQAIDSCLWELVQLQSHYHPNVATITKVISEQFTKVSYNIEDFLDHSYATLLEAEMTKNVRKAPVVEFHIPKKVFLPHEAGDAEPDSLLVKLWDFEGSPQTTEVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.81
3 0.82
4 0.83
5 0.88
6 0.92
7 0.93
8 0.94
9 0.94
10 0.92
11 0.89
12 0.86
13 0.84
14 0.82
15 0.82
16 0.81
17 0.76
18 0.7
19 0.65
20 0.59
21 0.56
22 0.5
23 0.4
24 0.32
25 0.26
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.16
30 0.14
31 0.15
32 0.12
33 0.13
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.14
38 0.17
39 0.19
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.23
45 0.25
46 0.22
47 0.2
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.19
52 0.19
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.24
57 0.26
58 0.27
59 0.23
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.25
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.19
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.2
93 0.17
94 0.16
95 0.17
96 0.15
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.14
101 0.15
102 0.18
103 0.19
104 0.25
105 0.21
106 0.22
107 0.23
108 0.23
109 0.24
110 0.24
111 0.22
112 0.18
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.19
117 0.17
118 0.14
119 0.12
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.17
132 0.19
133 0.23
134 0.22
135 0.23
136 0.25
137 0.24
138 0.29
139 0.25
140 0.22
141 0.2
142 0.23
143 0.2
144 0.22
145 0.24
146 0.18
147 0.24
148 0.28
149 0.27
150 0.25
151 0.26
152 0.24
153 0.23
154 0.26
155 0.2
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.12
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.22
195 0.21
196 0.25
197 0.25
198 0.23
199 0.23
200 0.22
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.05
228 0.06
229 0.07
230 0.12
231 0.13
232 0.16
233 0.19
234 0.24
235 0.34
236 0.44
237 0.54
238 0.59
239 0.69
240 0.73
241 0.78
242 0.83
243 0.83
244 0.78
245 0.75
246 0.73
247 0.66
248 0.62
249 0.56
250 0.51
251 0.44
252 0.41
253 0.34
254 0.27
255 0.23
256 0.19
257 0.17
258 0.11
259 0.09
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.06
264 0.08
265 0.14
266 0.19
267 0.2
268 0.2
269 0.22
270 0.25
271 0.27
272 0.26
273 0.22
274 0.2
275 0.19
276 0.18
277 0.16
278 0.12
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.02
312 0.03
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.14
333 0.17
334 0.16
335 0.19
336 0.21
337 0.21
338 0.24
339 0.3
340 0.34
341 0.39
342 0.46
343 0.48
344 0.5
345 0.57
346 0.56
347 0.59
348 0.56
349 0.51
350 0.45
351 0.43
352 0.36
353 0.27
354 0.26
355 0.16
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.12
372 0.15
373 0.16
374 0.2
375 0.26
376 0.28
377 0.27
378 0.27
379 0.23
380 0.21
381 0.2
382 0.15
383 0.09
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.12
391 0.15
392 0.18
393 0.25
394 0.32
395 0.33
396 0.37
397 0.36
398 0.4
399 0.39
400 0.42
401 0.41
402 0.37
403 0.45
404 0.45
405 0.46
406 0.46
407 0.47
408 0.44
409 0.45
410 0.45
411 0.4
412 0.44
413 0.44
414 0.41
415 0.41
416 0.43
417 0.39
418 0.36
419 0.38
420 0.37
421 0.35
422 0.34
423 0.31
424 0.27
425 0.23
426 0.21
427 0.17
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.14
448 0.15
449 0.16
450 0.19
451 0.24
452 0.25
453 0.25
454 0.23
455 0.19
456 0.23
457 0.22
458 0.19
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.17
463 0.16
464 0.14
465 0.15
466 0.16
467 0.18
468 0.18
469 0.19
470 0.19
471 0.21
472 0.2
473 0.21
474 0.21
475 0.19
476 0.18
477 0.17
478 0.21
479 0.18
480 0.16
481 0.14
482 0.12
483 0.11
484 0.12
485 0.11
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.12
491 0.16
492 0.18
493 0.2
494 0.22
495 0.24
496 0.25
497 0.28
498 0.31
499 0.37
500 0.41
501 0.47
502 0.5
503 0.52
504 0.59
505 0.55
506 0.5
507 0.45
508 0.46
509 0.41
510 0.4
511 0.42
512 0.34
513 0.39
514 0.39
515 0.35
516 0.3
517 0.28
518 0.24
519 0.17
520 0.16
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.1
529 0.1
530 0.13
531 0.2
532 0.21
533 0.22