FuNGI

C7YSE6

Protein Details

Accession

C7YSE6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-39	AEDGDTPKRENKRPKKQGGKARQHQHSNID	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-31	KRENKRPKKQGGKAR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	nhe:NECHADRAFT_80709 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MATKREFQEAEDGDTPKRENKRPKKQGGKARQHQHSNIDPTWGQKYVFSGSGNATTVPAGEESEFEDDSEAMAYLSSVRQEANGIPHLLVAPKVQIGPQLPADFERDDDADQNDEGPTDRSIYETGIGDSRGYYEDGAYVGLPEYDEEGDYEEGEAPEYEDDDFDEERAIHEAYFTSLMDQYLHLRSVLHTKPPSNALSRLSPSQATTAAPFGHQSSPIGVWSRLLRTTDPHPLQLALMSKDTILRILRVLLGGKFLRRGYTLPERTSRWLWALLARLPDKGELNYAEIGWVRDLGRRAVLLGRSLAEMAALREELAEGGLGAHEAVDRSSSDEDVMVDAEELEVEGAVSPEQDEDDTTPPEVEADKGQPPKADTPKPQPANPAPKPDTEEGEIDDEEDDVAMDIASESEAEDGEVAPQPKEDLEEAKARLLAQLDNGPASDDPDAEAEAEKEAAKQRSRANLRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.39
3	0.36
4	0.43
5	0.45
6	0.51
7	0.6
8	0.7
9	0.78
10	0.87
11	0.91
12	0.92
13	0.93
14	0.93
15	0.93
16	0.92
17	0.91
18	0.9
19	0.87
20	0.83
21	0.8
22	0.77
23	0.74
24	0.65
25	0.6
26	0.52
27	0.47
28	0.46
29	0.4
30	0.32
31	0.25
32	0.27
33	0.25
34	0.27
35	0.24
36	0.22
37	0.22
38	0.25
39	0.25
40	0.22
41	0.19
42	0.15
43	0.15
44	0.13
45	0.11
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.11
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.09
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.06
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.1
68	0.12
69	0.16
70	0.19
71	0.19
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.18
76	0.17
77	0.13
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.14
83	0.15
84	0.18
85	0.21
86	0.21
87	0.2
88	0.21
89	0.24
90	0.2
91	0.19
92	0.18
93	0.15
94	0.15
95	0.17
96	0.17
97	0.15
98	0.15
99	0.15
100	0.12
101	0.11
102	0.12
103	0.11
104	0.1
105	0.1
106	0.1
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.14
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.07
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.06
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.05
148	0.06
149	0.08
150	0.08
151	0.07
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.1
156	0.1
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.11
169	0.11
170	0.12
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.18
175	0.19
176	0.23
177	0.25
178	0.26
179	0.28
180	0.31
181	0.33
182	0.29
183	0.3
184	0.26
185	0.27
186	0.28
187	0.27
188	0.25
189	0.23
190	0.2
191	0.19
192	0.17
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.1
205	0.12
206	0.13
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.14
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.15
215	0.18
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.24
220	0.23
221	0.22
222	0.22
223	0.2
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.09
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.07
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.13
247	0.16
248	0.26
249	0.3
250	0.3
251	0.34
252	0.35
253	0.38
254	0.39
255	0.34
256	0.26
257	0.22
258	0.2
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.21
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.19
267	0.17
268	0.15
269	0.15
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.11
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.1
281	0.12
282	0.11
283	0.12
284	0.11
285	0.12
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.08
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.04
315	0.05
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.03
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.08
343	0.11
344	0.12
345	0.12
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.11
352	0.13
353	0.19
354	0.22
355	0.24
356	0.25
357	0.27
358	0.35
359	0.41
360	0.45
361	0.45
362	0.52
363	0.61
364	0.63
365	0.62
366	0.62
367	0.63
368	0.67
369	0.65
370	0.65
371	0.57
372	0.56
373	0.59
374	0.53
375	0.48
376	0.4
377	0.36
378	0.28
379	0.29
380	0.25
381	0.2
382	0.18
383	0.14
384	0.11
385	0.1
386	0.08
387	0.04
388	0.05
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.12
408	0.15
409	0.15
410	0.14
411	0.17
412	0.23
413	0.24
414	0.26
415	0.27
416	0.24
417	0.25
418	0.23
419	0.2
420	0.17
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.18
425	0.18
426	0.16
427	0.18
428	0.15
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.12
433	0.11
434	0.12
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.1
439	0.12
440	0.19
441	0.25
442	0.28
443	0.33
444	0.39
445	0.48
446	0.55
447	0.59
448	0.6
449	0.61
450	0.61
451	0.62
452	0.59
453	0.51
454	0.45
455	0.38
456	0.31
457	0.22
458	0.19
459	0.13
460	0.1
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.12
469	0.14
470	0.16
471	0.24
472	0.23
473	0.21

C7YSE6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer