FuNGI

A0A1B9I5H9

Protein Details

Accession

A0A1B9I5H9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
396-416	IEGNRSKYKEVKKKAVEKFVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
511-518	KKKTVKGR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MSDHRILEYEEEDDDLFGNHSTNEAIPVNVNTAEPISTLTTSTSTFGGEQLSNKNRYTVSSPARTSNAQAGPSTGKVYKNVDDRLRELQETRRSGRDYERTNAIGVRSLRALCMSVVKASSARIWDIGDLEYPLIKPLLDDMPIEQLQEVETNSPHIKKDTDWLYEIFMLQDFPLFHERCQDRHGSPRKSGWRRMYKKAKEDFAVRQIQAADRVAARYKQLEEEKASKRIVVMDRIIPDKKPSARGSGWGRGKFGGSGTGGLSSSTPKPQNAIAKARLEAQRARVAMTHASGKYIPPAPQKSKNELNQLFKNPYLPQGFSQAAQQAMHAPRIPPPKSLVPKRQTQRASSPNSPTSPIPGSYPTNQINHIRQTLPSHLADRASQSIDSNTTEDRFRIEGNRSKYKEVKKKAVEKFVIPEIEKEKPTSVVVDFFASNPMLNKGNVAGVKRKEREEREKSDTKMTQIGASPYNKITSFQDGSSIAIPVKSTITPHQNTQNASTGSDVNNVLFRKKKTVKGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.11
3	0.11
4	0.09
5	0.09
6	0.08
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.13
11	0.13
12	0.13
13	0.15
14	0.16
15	0.18
16	0.17
17	0.17
18	0.13
19	0.14
20	0.13
21	0.11
22	0.12
23	0.12
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.14
29	0.16
30	0.14
31	0.13
32	0.12
33	0.13
34	0.15
35	0.15
36	0.17
37	0.26
38	0.32
39	0.36
40	0.36
41	0.38
42	0.35
43	0.37
44	0.38
45	0.38
46	0.39
47	0.44
48	0.46
49	0.47
50	0.5
51	0.48
52	0.46
53	0.45
54	0.41
55	0.35
56	0.32
57	0.31
58	0.3
59	0.3
60	0.31
61	0.26
62	0.24
63	0.26
64	0.3
65	0.33
66	0.37
67	0.43
68	0.46
69	0.46
70	0.48
71	0.52
72	0.51
73	0.47
74	0.43
75	0.44
76	0.47
77	0.49
78	0.49
79	0.47
80	0.46
81	0.47
82	0.53
83	0.53
84	0.5
85	0.48
86	0.51
87	0.45
88	0.44
89	0.43
90	0.35
91	0.32
92	0.28
93	0.25
94	0.22
95	0.21
96	0.2
97	0.19
98	0.19
99	0.13
100	0.16
101	0.15
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.15
106	0.15
107	0.17
108	0.14
109	0.14
110	0.13
111	0.14
112	0.13
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.1
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.07
123	0.06
124	0.09
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.17
130	0.17
131	0.17
132	0.14
133	0.12
134	0.12
135	0.13
136	0.12
137	0.08
138	0.08
139	0.11
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.17
145	0.17
146	0.24
147	0.26
148	0.27
149	0.28
150	0.27
151	0.28
152	0.27
153	0.26
154	0.19
155	0.13
156	0.1
157	0.08
158	0.1
159	0.08
160	0.1
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.26
165	0.27
166	0.27
167	0.3
168	0.32
169	0.27
170	0.37
171	0.47
172	0.43
173	0.45
174	0.52
175	0.59
176	0.61
177	0.68
178	0.68
179	0.69
180	0.71
181	0.77
182	0.8
183	0.77
184	0.79
185	0.77
186	0.72
187	0.64
188	0.63
189	0.57
190	0.54
191	0.52
192	0.42
193	0.37
194	0.34
195	0.31
196	0.28
197	0.24
198	0.17
199	0.11
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.18
207	0.2
208	0.22
209	0.24
210	0.31
211	0.34
212	0.36
213	0.35
214	0.3
215	0.28
216	0.3
217	0.29
218	0.24
219	0.22
220	0.21
221	0.23
222	0.26
223	0.27
224	0.22
225	0.21
226	0.23
227	0.23
228	0.26
229	0.26
230	0.28
231	0.28
232	0.34
233	0.37
234	0.41
235	0.45
236	0.4
237	0.39
238	0.33
239	0.33
240	0.27
241	0.22
242	0.16
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.12
253	0.13
254	0.13
255	0.14
256	0.17
257	0.24
258	0.27
259	0.31
260	0.31
261	0.32
262	0.32
263	0.37
264	0.36
265	0.33
266	0.3
267	0.28
268	0.28
269	0.26
270	0.27
271	0.22
272	0.2
273	0.18
274	0.18
275	0.19
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.16
281	0.18
282	0.2
283	0.23
284	0.3
285	0.34
286	0.43
287	0.48
288	0.51
289	0.56
290	0.57
291	0.61
292	0.59
293	0.6
294	0.56
295	0.57
296	0.53
297	0.45
298	0.43
299	0.33
300	0.33
301	0.29
302	0.25
303	0.21
304	0.24
305	0.24
306	0.21
307	0.23
308	0.19
309	0.17
310	0.16
311	0.15
312	0.16
313	0.17
314	0.19
315	0.18
316	0.16
317	0.21
318	0.3
319	0.31
320	0.27
321	0.3
322	0.37
323	0.44
324	0.53
325	0.57
326	0.53
327	0.61
328	0.64
329	0.68
330	0.64
331	0.6
332	0.61
333	0.59
334	0.62
335	0.59
336	0.61
337	0.57
338	0.54
339	0.51
340	0.42
341	0.38
342	0.33
343	0.27
344	0.23
345	0.22
346	0.24
347	0.24
348	0.31
349	0.29
350	0.29
351	0.32
352	0.35
353	0.36
354	0.37
355	0.37
356	0.32
357	0.3
358	0.33
359	0.34
360	0.33
361	0.3
362	0.27
363	0.25
364	0.26
365	0.24
366	0.24
367	0.22
368	0.19
369	0.18
370	0.17
371	0.17
372	0.18
373	0.18
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.16
378	0.15
379	0.16
380	0.16
381	0.16
382	0.19
383	0.26
384	0.31
385	0.38
386	0.48
387	0.48
388	0.53
389	0.59
390	0.65
391	0.67
392	0.69
393	0.72
394	0.71
395	0.78
396	0.81
397	0.83
398	0.76
399	0.69
400	0.65
401	0.6
402	0.56
403	0.46
404	0.43
405	0.37
406	0.39
407	0.37
408	0.34
409	0.29
410	0.26
411	0.26
412	0.25
413	0.21
414	0.19
415	0.19
416	0.19
417	0.18
418	0.16
419	0.18
420	0.15
421	0.14
422	0.13
423	0.15
424	0.15
425	0.14
426	0.15
427	0.13
428	0.18
429	0.2
430	0.22
431	0.27
432	0.32
433	0.42
434	0.45
435	0.51
436	0.55
437	0.62
438	0.7
439	0.71
440	0.73
441	0.72
442	0.76
443	0.72
444	0.73
445	0.67
446	0.59
447	0.55
448	0.48
449	0.43
450	0.39
451	0.39
452	0.36
453	0.35
454	0.34
455	0.3
456	0.33
457	0.29
458	0.28
459	0.28
460	0.29
461	0.3
462	0.27
463	0.3
464	0.26
465	0.28
466	0.27
467	0.25
468	0.17
469	0.16
470	0.16
471	0.13
472	0.15
473	0.13
474	0.16
475	0.22
476	0.31
477	0.33
478	0.38
479	0.46
480	0.49
481	0.51
482	0.52
483	0.53
484	0.45
485	0.43
486	0.39
487	0.33
488	0.3
489	0.31
490	0.27
491	0.2
492	0.24
493	0.25
494	0.28
495	0.32
496	0.34
497	0.4
498	0.47

A0A1B9I5H9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer