FuNGI

A0A1B9HT67

Protein Details

Accession

A0A1B9HT67

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-266	DSNRNRGKKAFRRRPPPSQVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
249-260	RNRGKKAFRRRP

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR036167 tRNA_intron_Endo_cat-like_sf IPR006677 tRNA_intron_Endonuc_cat-like IPR006676 tRNA_splic IPR016589 tRNA_splic_SEN2
Gene Ontology	GO:0000214 C:tRNA-intron endonuclease complex GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000213 F:tRNA-intron endonuclease activity GO:0006388 P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation
Pfam	View protein in Pfam PF01974 tRNA_int_endo
CDD	cd22363 tRNA-intron_lyase_C

Amino Acid Sequences

MPSTPSLQNNSNNGKNAARLRNQANQKKYSNPLPILINSSNSSDKNSSTLKSSIINSYIPSFSNLNKKEIINLPNCIGTFDNITRSIWIEDEKSKLILFNRGFFGKGNLSRSEPSWKQRKLDLLKGGSTLAAEQMREARRQARKQFKIDRAAAMLNAAKQAEAILTSSTKASTSTDLNNFSSSPLSQDNLEEYIGEEGELEIDDQRRSNSPTPSTSTTITATTEDTIIDPMKLTAQTFLIRPTRPDSNRNRGKKAFRRRPPPSQVPLPTTTESTSLTSNSTAISQLPPIVPLTASKEEEEEEEEEEEDLFDESLVEDMEHLQLSLEEALFLSLGLGVLKVFDPISQTYIPNGPSLLSLLLTPSTSPFSNTLSTKTPMLPDDPLLVSYIAYHHFRSLGWVVKDGIKFCCDWLLYRKGPAFSHSAFACIVIPVYEDLEEKEISPYGNQDWYEEKLSWKWINTIMRVNALVQKTVIAVYVTIPSLKSFDSSLKFENGYLNPEKIDFKKLLQRYTVREVSLTRFGPSRRRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.53
4	0.54
5	0.52
6	0.54
7	0.56
8	0.61
9	0.7
10	0.73
11	0.72
12	0.71
13	0.69
14	0.69
15	0.7
16	0.7
17	0.68
18	0.62
19	0.58
20	0.54
21	0.52
22	0.52
23	0.46
24	0.41
25	0.33
26	0.35
27	0.35
28	0.31
29	0.34
30	0.29
31	0.28
32	0.29
33	0.31
34	0.29
35	0.29
36	0.3
37	0.27
38	0.29
39	0.3
40	0.3
41	0.29
42	0.29
43	0.26
44	0.27
45	0.27
46	0.23
47	0.24
48	0.21
49	0.23
50	0.32
51	0.33
52	0.33
53	0.36
54	0.35
55	0.39
56	0.44
57	0.47
58	0.41
59	0.42
60	0.4
61	0.39
62	0.39
63	0.34
64	0.28
65	0.21
66	0.22
67	0.21
68	0.23
69	0.21
70	0.22
71	0.21
72	0.22
73	0.21
74	0.17
75	0.18
76	0.18
77	0.2
78	0.23
79	0.23
80	0.22
81	0.22
82	0.23
83	0.23
84	0.28
85	0.27
86	0.27
87	0.3
88	0.29
89	0.3
90	0.27
91	0.29
92	0.28
93	0.31
94	0.31
95	0.29
96	0.32
97	0.33
98	0.34
99	0.39
100	0.37
101	0.41
102	0.47
103	0.5
104	0.49
105	0.53
106	0.6
107	0.58
108	0.61
109	0.61
110	0.55
111	0.52
112	0.49
113	0.45
114	0.35
115	0.29
116	0.2
117	0.15
118	0.13
119	0.11
120	0.11
121	0.17
122	0.2
123	0.21
124	0.23
125	0.28
126	0.36
127	0.45
128	0.54
129	0.59
130	0.64
131	0.72
132	0.8
133	0.79
134	0.79
135	0.73
136	0.66
137	0.58
138	0.51
139	0.41
140	0.33
141	0.27
142	0.18
143	0.17
144	0.14
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.12
161	0.17
162	0.21
163	0.24
164	0.25
165	0.25
166	0.24
167	0.22
168	0.21
169	0.15
170	0.14
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.13
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.04
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.05
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.11
194	0.16
195	0.21
196	0.24
197	0.26
198	0.29
199	0.33
200	0.36
201	0.37
202	0.33
203	0.3
204	0.26
205	0.24
206	0.21
207	0.17
208	0.14
209	0.12
210	0.11
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.14
226	0.17
227	0.17
228	0.19
229	0.21
230	0.28
231	0.3
232	0.38
233	0.42
234	0.48
235	0.58
236	0.62
237	0.65
238	0.63
239	0.71
240	0.72
241	0.75
242	0.74
243	0.74
244	0.79
245	0.79
246	0.82
247	0.81
248	0.8
249	0.74
250	0.71
251	0.66
252	0.6
253	0.56
254	0.49
255	0.41
256	0.34
257	0.29
258	0.22
259	0.2
260	0.17
261	0.14
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.13
280	0.15
281	0.16
282	0.15
283	0.15
284	0.16
285	0.16
286	0.17
287	0.13
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.07
330	0.08
331	0.12
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.17
336	0.17
337	0.15
338	0.15
339	0.12
340	0.11
341	0.11
342	0.1
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.09
351	0.09
352	0.11
353	0.12
354	0.14
355	0.18
356	0.19
357	0.21
358	0.23
359	0.24
360	0.24
361	0.24
362	0.24
363	0.21
364	0.23
365	0.21
366	0.18
367	0.19
368	0.18
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.13
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.17
382	0.19
383	0.23
384	0.22
385	0.24
386	0.25
387	0.29
388	0.31
389	0.29
390	0.27
391	0.21
392	0.21
393	0.19
394	0.22
395	0.17
396	0.19
397	0.24
398	0.3
399	0.3
400	0.35
401	0.38
402	0.37
403	0.37
404	0.37
405	0.36
406	0.29
407	0.32
408	0.27
409	0.25
410	0.22
411	0.22
412	0.19
413	0.13
414	0.12
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.13
429	0.14
430	0.14
431	0.19
432	0.18
433	0.19
434	0.21
435	0.24
436	0.27
437	0.25
438	0.26
439	0.24
440	0.31
441	0.32
442	0.31
443	0.3
444	0.34
445	0.39
446	0.4
447	0.45
448	0.4
449	0.4
450	0.39
451	0.38
452	0.37
453	0.32
454	0.29
455	0.21
456	0.2
457	0.17
458	0.17
459	0.16
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.12
467	0.11
468	0.13
469	0.13
470	0.13
471	0.12
472	0.18
473	0.22
474	0.26
475	0.29
476	0.31
477	0.32
478	0.31
479	0.37
480	0.32
481	0.34
482	0.34
483	0.32
484	0.29
485	0.3
486	0.34
487	0.3
488	0.34
489	0.3
490	0.31
491	0.39
492	0.44
493	0.48
494	0.51
495	0.55
496	0.57
497	0.64
498	0.63
499	0.54
500	0.52
501	0.49
502	0.46
503	0.48
504	0.42
505	0.35
506	0.35
507	0.38

A0A1B9HT67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer