Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YIT1

Protein Details
Accession C7YIT1    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-148IVQISGKSSRKPRKPRAPKTTTKKKEEPTQNAAHydrophilic
171-194GVAATKPKATKPRKKQTGTMSNHFHydrophilic
306-329AAIPEKSPKKKAPKKKARTITELAHydrophilic
363-391TEQTKKPKGKANPRKRVSKVSKKKAAPPKBasic
666-687VGTDVKKPRGRPRKNSPSASEPHydrophilic
694-715AQPPETPKRLRGRPRKNSLASSHydrophilic
727-755APAPKKPAAAPKSPKRKKRAANPVIEIPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-141KSSRKPRKPRAPKTTTKKKE
155-185GGKGKKASKANKKGDEGVAATKPKATKPRKK
310-323EKSPKKKAPKKKAR
367-391KKPKGKANPRKRVSKVSKKKAAPPK
671-746KKPRGRPRKNSPSASEPQEPPPSAQPPETPKRLRGRPRKNSLASSVGTASPTKAKTAPAPKKPAAAPKSPKRKKRA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG nhe:NECHADRAFT_98986  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASPDAFQSSPLRETRRERVQIESSSPALPPLQDLLSQKPSRPPIRSGSKAIPIPDHAPSSFISARHLLTSTEATHDVVSTSSTTANRASAEPSGAGFIPNDTHASVPPQDDDIVIVQISGKSSRKPRKPRAPKTTTKKKEEPTQNAADAESQNGGKGKKASKANKKGDEGVAATKPKATKPRKKQTGTMSNHFPPVAEPDLPAKSKKDGVHEPLHLEQAPARRLDWTPPAQKTVINIDSDSSAFKQLASSETGQPMPAFKNLVGGYACLETAPQVLTFASDEDSSFLKKRKLIELVNTKETNPSAAIPEKSPKKKAPKKKARTITELATAAYKVPTQPDPDPPTASILEHFQAAGNASTSTTEQTKKPKGKANPRKRVSKVSKKKAAPPKPVLLSPGAALAQVANQDFVFGTSSQLAREESPTVLRDLQSALMQSNQVDDIDFATPINSDAIDPPEQRTSLWDAAARDTEGDLFDVEVINLTEDSPHLLEETHDANPFGYFRGDNRTSAPDSVAENPTSDDHVSFANLSDLMPSPTRNPRQEDDEGSPFFSDSDLSASIEMQRPAPAQTQPRQETLAPAANHLDEEADVREQPPRPNFEGYTDVQLAKEIKTFGFKPIKRRSAMIALLDQCWQSKIRIGQAGVHTSTKGTSSAPKSTKTGSSVSVGTDVKKPRGRPRKNSPSASEPQEPPPSAQPPETPKRLRGRPRKNSLASSVGTASPTKAKTAPAPKKPAAAPKSPKRKKRAANPVIEIPDSNSDFGSDLDSSPGSSVDEMFSPPQLDLSLSTGDDTELSLTATQSDQEVVLFEYIAKAIRSAPRATDPMEPSWHEKILLYDPIVLEDLAAWLNTGELSRVGYDEEVNPNDVKKWCESQSICCLWRVNLRGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.55
3 0.62
4 0.66
5 0.62
6 0.64
7 0.66
8 0.64
9 0.62
10 0.57
11 0.49
12 0.42
13 0.4
14 0.33
15 0.27
16 0.22
17 0.18
18 0.17
19 0.16
20 0.19
21 0.22
22 0.27
23 0.36
24 0.38
25 0.39
26 0.44
27 0.52
28 0.56
29 0.58
30 0.56
31 0.56
32 0.65
33 0.67
34 0.66
35 0.64
36 0.64
37 0.63
38 0.6
39 0.54
40 0.48
41 0.46
42 0.43
43 0.39
44 0.31
45 0.29
46 0.27
47 0.3
48 0.29
49 0.26
50 0.26
51 0.25
52 0.26
53 0.26
54 0.27
55 0.2
56 0.2
57 0.23
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.16
65 0.13
66 0.13
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.2
77 0.18
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.11
90 0.12
91 0.12
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.19
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.14
108 0.15
109 0.2
110 0.31
111 0.42
112 0.51
113 0.61
114 0.71
115 0.78
116 0.87
117 0.92
118 0.93
119 0.93
120 0.93
121 0.93
122 0.93
123 0.92
124 0.9
125 0.87
126 0.84
127 0.84
128 0.84
129 0.82
130 0.79
131 0.76
132 0.69
133 0.61
134 0.54
135 0.47
136 0.37
137 0.29
138 0.24
139 0.17
140 0.15
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.23
145 0.26
146 0.31
147 0.41
148 0.49
149 0.57
150 0.68
151 0.74
152 0.77
153 0.77
154 0.75
155 0.68
156 0.61
157 0.53
158 0.47
159 0.42
160 0.36
161 0.32
162 0.3
163 0.29
164 0.3
165 0.38
166 0.44
167 0.49
168 0.59
169 0.7
170 0.77
171 0.8
172 0.83
173 0.83
174 0.83
175 0.8
176 0.76
177 0.73
178 0.65
179 0.62
180 0.54
181 0.43
182 0.33
183 0.31
184 0.28
185 0.2
186 0.18
187 0.2
188 0.25
189 0.27
190 0.28
191 0.25
192 0.24
193 0.3
194 0.32
195 0.35
196 0.38
197 0.43
198 0.48
199 0.48
200 0.49
201 0.45
202 0.45
203 0.38
204 0.31
205 0.27
206 0.27
207 0.27
208 0.23
209 0.21
210 0.21
211 0.22
212 0.26
213 0.3
214 0.32
215 0.38
216 0.39
217 0.42
218 0.4
219 0.4
220 0.38
221 0.38
222 0.34
223 0.27
224 0.25
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.21
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.16
238 0.17
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.12
248 0.18
249 0.17
250 0.2
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.11
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.22
277 0.25
278 0.3
279 0.36
280 0.37
281 0.43
282 0.5
283 0.52
284 0.56
285 0.54
286 0.48
287 0.43
288 0.4
289 0.32
290 0.22
291 0.18
292 0.14
293 0.17
294 0.18
295 0.18
296 0.26
297 0.33
298 0.37
299 0.42
300 0.47
301 0.54
302 0.63
303 0.72
304 0.76
305 0.78
306 0.83
307 0.88
308 0.9
309 0.86
310 0.84
311 0.77
312 0.68
313 0.62
314 0.53
315 0.43
316 0.33
317 0.27
318 0.19
319 0.16
320 0.13
321 0.08
322 0.1
323 0.12
324 0.15
325 0.17
326 0.25
327 0.3
328 0.32
329 0.33
330 0.31
331 0.32
332 0.28
333 0.26
334 0.18
335 0.15
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.14
352 0.23
353 0.31
354 0.37
355 0.42
356 0.49
357 0.56
358 0.65
359 0.73
360 0.76
361 0.78
362 0.78
363 0.82
364 0.78
365 0.8
366 0.79
367 0.79
368 0.78
369 0.78
370 0.81
371 0.75
372 0.8
373 0.8
374 0.79
375 0.77
376 0.72
377 0.68
378 0.62
379 0.59
380 0.52
381 0.42
382 0.33
383 0.23
384 0.19
385 0.12
386 0.1
387 0.09
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.08
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.14
445 0.13
446 0.15
447 0.17
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.16
452 0.17
453 0.17
454 0.15
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.07
459 0.06
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.16
491 0.17
492 0.17
493 0.19
494 0.22
495 0.23
496 0.23
497 0.23
498 0.16
499 0.17
500 0.2
501 0.19
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.13
508 0.1
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.13
523 0.21
524 0.27
525 0.3
526 0.34
527 0.35
528 0.41
529 0.44
530 0.45
531 0.41
532 0.4
533 0.37
534 0.33
535 0.3
536 0.23
537 0.2
538 0.16
539 0.11
540 0.06
541 0.08
542 0.07
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.1
547 0.13
548 0.13
549 0.12
550 0.12
551 0.13
552 0.15
553 0.17
554 0.19
555 0.23
556 0.28
557 0.37
558 0.38
559 0.39
560 0.4
561 0.37
562 0.36
563 0.33
564 0.34
565 0.25
566 0.23
567 0.23
568 0.2
569 0.2
570 0.17
571 0.13
572 0.06
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.13
579 0.15
580 0.21
581 0.24
582 0.28
583 0.31
584 0.34
585 0.35
586 0.34
587 0.36
588 0.32
589 0.32
590 0.29
591 0.25
592 0.22
593 0.23
594 0.21
595 0.16
596 0.17
597 0.13
598 0.12
599 0.16
600 0.17
601 0.23
602 0.32
603 0.34
604 0.42
605 0.51
606 0.58
607 0.55
608 0.56
609 0.52
610 0.5
611 0.51
612 0.43
613 0.38
614 0.33
615 0.32
616 0.32
617 0.27
618 0.2
619 0.18
620 0.17
621 0.12
622 0.15
623 0.17
624 0.21
625 0.25
626 0.26
627 0.3
628 0.32
629 0.36
630 0.33
631 0.31
632 0.26
633 0.21
634 0.21
635 0.17
636 0.14
637 0.11
638 0.16
639 0.2
640 0.29
641 0.31
642 0.33
643 0.35
644 0.37
645 0.39
646 0.36
647 0.33
648 0.27
649 0.27
650 0.25
651 0.23
652 0.25
653 0.22
654 0.21
655 0.25
656 0.26
657 0.31
658 0.35
659 0.4
660 0.46
661 0.56
662 0.65
663 0.68
664 0.76
665 0.8
666 0.85
667 0.86
668 0.81
669 0.78
670 0.75
671 0.71
672 0.67
673 0.58
674 0.55
675 0.55
676 0.5
677 0.44
678 0.43
679 0.41
680 0.37
681 0.36
682 0.35
683 0.37
684 0.44
685 0.5
686 0.48
687 0.51
688 0.58
689 0.66
690 0.71
691 0.74
692 0.77
693 0.79
694 0.85
695 0.88
696 0.84
697 0.8
698 0.74
699 0.69
700 0.58
701 0.5
702 0.42
703 0.33
704 0.28
705 0.24
706 0.2
707 0.2
708 0.2
709 0.2
710 0.19
711 0.21
712 0.28
713 0.39
714 0.47
715 0.51
716 0.59
717 0.58
718 0.63
719 0.65
720 0.67
721 0.61
722 0.61
723 0.62
724 0.64
725 0.73
726 0.76
727 0.81
728 0.79
729 0.84
730 0.83
731 0.84
732 0.85
733 0.83
734 0.84
735 0.81
736 0.8
737 0.74
738 0.65
739 0.54
740 0.46
741 0.42
742 0.34
743 0.28
744 0.2
745 0.17
746 0.17
747 0.17
748 0.17
749 0.12
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.1
757 0.09
758 0.09
759 0.09
760 0.1
761 0.11
762 0.12
763 0.13
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.12
768 0.11
769 0.11
770 0.13
771 0.13
772 0.12
773 0.13
774 0.12
775 0.12
776 0.11
777 0.1
778 0.08
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.08
783 0.09
784 0.09
785 0.09
786 0.09
787 0.09
788 0.08
789 0.08
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.08
795 0.08
796 0.09
797 0.1
798 0.1
799 0.09
800 0.14
801 0.19
802 0.23
803 0.25
804 0.28
805 0.32
806 0.35
807 0.37
808 0.4
809 0.38
810 0.39
811 0.42
812 0.41
813 0.41
814 0.43
815 0.41
816 0.34
817 0.31
818 0.3
819 0.31
820 0.32
821 0.27
822 0.26
823 0.25
824 0.26
825 0.26
826 0.21
827 0.16
828 0.11
829 0.11
830 0.09
831 0.08
832 0.07
833 0.06
834 0.06
835 0.07
836 0.07
837 0.06
838 0.07
839 0.08
840 0.09
841 0.09
842 0.11
843 0.11
844 0.13
845 0.16
846 0.23
847 0.23
848 0.25
849 0.26
850 0.25
851 0.3
852 0.31
853 0.3
854 0.29
855 0.34
856 0.35
857 0.43
858 0.45
859 0.47
860 0.54
861 0.58
862 0.55
863 0.52
864 0.51
865 0.45
866 0.51
867 0.49
868 0.5
869 0.51
870 0.59
871 0.66