Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HX34

Protein Details
Accession A0A1B9HX34    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-558EGYKGKRSPDIRKFKKWQDAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
640-647GAGKKSLR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 13.333, mito_nucl 11.666, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
Amino Acid Sequences MLRITTLLRPAVRSRSLFGFKSIFRPLSTATSSPPAATAYPKAWVNSIIAQQKGFGHAAITVEDEKLTIFPDYSYLSKHLSRVAELQDRVAAENSRTGKTRIIGEYPDLKELLEYIYNPTLRNNLTYPNLKKWIKTDGDISDGTMVPWHLLDLFDLLSSRRITGNNAKELTYTFLVMHHISKDQKLMDIFGKLLDRNLLAGFGANTLKEVKWQREDEVDAPVFEPVLLSNAAKPMARLNPSSSASPISPSKSSTSSFDNHTTLISSRGKTPIHPKTAKLDKFEVALGKSLEPPFESLFKDGSVWYASRKLDGVRCLTFLDFLVPTNSSEAMELVSVHFVSRTGKPFNSLSKLEEQLQPLSKLPVLRKWLDVDPLLVEERPDGVVKRLILDGEVCVMRPKTSEELATSQARDDGSVADSMWIANDPFVEDFSSTVSQMRRSDTINHPSYFLFDVLSYSELNAKTSLQGHEGLGKKFGARLRDIKFVGAWLSDCLDEKGVKEKMFKDLKQIKVAGVADVEVMVDRAAREGWEGIILRKDEGYKGKRSPDIRKFKKWQDAEYKVESLDISPMRLAVNGVFGEHNALANVWINHDGHSVSVGSGFTADQRMRYAKYPEQIIGKYITVEYFGESDSMERDKKANGAGKKSLRFPRIKMVWEEGKRGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.46
3 0.5
4 0.47
5 0.47
6 0.45
7 0.41
8 0.45
9 0.48
10 0.41
11 0.36
12 0.37
13 0.35
14 0.36
15 0.38
16 0.33
17 0.3
18 0.33
19 0.32
20 0.3
21 0.28
22 0.23
23 0.2
24 0.22
25 0.23
26 0.19
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.25
31 0.26
32 0.25
33 0.26
34 0.32
35 0.33
36 0.32
37 0.31
38 0.32
39 0.31
40 0.32
41 0.27
42 0.2
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.16
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.1
59 0.13
60 0.14
61 0.17
62 0.18
63 0.21
64 0.23
65 0.25
66 0.28
67 0.27
68 0.29
69 0.31
70 0.35
71 0.39
72 0.37
73 0.37
74 0.34
75 0.33
76 0.32
77 0.29
78 0.23
79 0.17
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.28
86 0.29
87 0.34
88 0.32
89 0.32
90 0.32
91 0.34
92 0.41
93 0.39
94 0.38
95 0.32
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.13
101 0.12
102 0.14
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.22
107 0.24
108 0.23
109 0.26
110 0.23
111 0.23
112 0.28
113 0.37
114 0.4
115 0.43
116 0.51
117 0.49
118 0.5
119 0.48
120 0.51
121 0.46
122 0.43
123 0.42
124 0.35
125 0.38
126 0.36
127 0.33
128 0.26
129 0.23
130 0.21
131 0.16
132 0.13
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.19
150 0.28
151 0.35
152 0.39
153 0.39
154 0.39
155 0.37
156 0.37
157 0.36
158 0.27
159 0.21
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.13
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.21
170 0.19
171 0.21
172 0.21
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.16
178 0.18
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.15
196 0.19
197 0.22
198 0.29
199 0.31
200 0.32
201 0.34
202 0.37
203 0.32
204 0.34
205 0.3
206 0.23
207 0.22
208 0.2
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.12
222 0.17
223 0.19
224 0.2
225 0.21
226 0.26
227 0.28
228 0.29
229 0.25
230 0.22
231 0.2
232 0.22
233 0.21
234 0.18
235 0.17
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.22
243 0.25
244 0.27
245 0.25
246 0.23
247 0.21
248 0.2
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.17
253 0.18
254 0.22
255 0.23
256 0.25
257 0.34
258 0.36
259 0.42
260 0.43
261 0.43
262 0.47
263 0.56
264 0.57
265 0.51
266 0.46
267 0.38
268 0.37
269 0.36
270 0.3
271 0.21
272 0.19
273 0.16
274 0.14
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.17
298 0.2
299 0.23
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.19
304 0.17
305 0.14
306 0.12
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.07
327 0.09
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.27
335 0.25
336 0.24
337 0.25
338 0.27
339 0.27
340 0.27
341 0.25
342 0.24
343 0.25
344 0.23
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.2
351 0.23
352 0.23
353 0.24
354 0.26
355 0.26
356 0.26
357 0.24
358 0.19
359 0.15
360 0.15
361 0.14
362 0.11
363 0.1
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.12
386 0.12
387 0.14
388 0.15
389 0.16
390 0.18
391 0.22
392 0.23
393 0.21
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.12
399 0.09
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.09
418 0.1
419 0.09
420 0.12
421 0.13
422 0.16
423 0.18
424 0.2
425 0.19
426 0.21
427 0.27
428 0.32
429 0.4
430 0.41
431 0.4
432 0.39
433 0.37
434 0.37
435 0.32
436 0.24
437 0.16
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.09
443 0.08
444 0.12
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.16
451 0.17
452 0.14
453 0.16
454 0.15
455 0.21
456 0.25
457 0.23
458 0.22
459 0.22
460 0.2
461 0.22
462 0.24
463 0.22
464 0.22
465 0.3
466 0.32
467 0.39
468 0.39
469 0.37
470 0.34
471 0.31
472 0.28
473 0.2
474 0.17
475 0.1
476 0.11
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.11
482 0.12
483 0.19
484 0.21
485 0.23
486 0.26
487 0.27
488 0.35
489 0.42
490 0.42
491 0.45
492 0.5
493 0.53
494 0.55
495 0.55
496 0.46
497 0.44
498 0.44
499 0.34
500 0.25
501 0.2
502 0.14
503 0.13
504 0.12
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.05
509 0.04
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.11
517 0.12
518 0.13
519 0.17
520 0.18
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.2
525 0.29
526 0.32
527 0.35
528 0.4
529 0.46
530 0.51
531 0.57
532 0.63
533 0.65
534 0.71
535 0.72
536 0.77
537 0.79
538 0.82
539 0.85
540 0.79
541 0.78
542 0.78
543 0.77
544 0.73
545 0.69
546 0.61
547 0.51
548 0.47
549 0.38
550 0.27
551 0.26
552 0.2
553 0.16
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.15
559 0.09
560 0.12
561 0.11
562 0.12
563 0.12
564 0.11
565 0.14
566 0.14
567 0.13
568 0.1
569 0.1
570 0.09
571 0.13
572 0.13
573 0.12
574 0.15
575 0.15
576 0.16
577 0.17
578 0.16
579 0.13
580 0.14
581 0.12
582 0.09
583 0.11
584 0.1
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.14
590 0.15
591 0.15
592 0.19
593 0.23
594 0.25
595 0.31
596 0.36
597 0.37
598 0.42
599 0.45
600 0.45
601 0.48
602 0.46
603 0.43
604 0.39
605 0.34
606 0.29
607 0.26
608 0.22
609 0.17
610 0.16
611 0.15
612 0.13
613 0.13
614 0.12
615 0.11
616 0.11
617 0.13
618 0.17
619 0.17
620 0.18
621 0.19
622 0.21
623 0.24
624 0.31
625 0.36
626 0.39
627 0.45
628 0.53
629 0.6
630 0.63
631 0.69
632 0.7
633 0.71
634 0.7
635 0.67
636 0.68
637 0.67
638 0.67
639 0.64
640 0.63
641 0.64
642 0.62