Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HSA4

Protein Details
Accession A0A1B9HSA4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-155YSSRPSKKSTTTKAPARPKPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 6, cyto_pero 6, cysk 5, mito_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSGFFGFDTSLPERGAQNQGKPQQQQGFSGFQVPGTNDAFALGGAGEEEDLAVYTWGESTGGGLLEGGDEMNDETFGDDLGGITNNFQFSSQPAPQPSKGYGQSTATGKIASTQSRYKPKAAYDPFAFSEDDFYSSRPSKKSTTTKAPARPKPSTAQSGSVENLWNKPAVSSPAWGTAPSAMTRPTPPSSASLPSQGPPAPGHIKSLEEIEAEMAQMAMPSTSSAAPTQQKVFSLEEIERQMMEQTVEPPRQATPQQPLPPREATPTQVPGLAASGYSSQQALLDSMFPELGKGVPASGLGQGTPSFVSDQTGSHEPPRPSPEELARMEELHQRITAKIESMAKYNNLMGSSDKDFITRIQLSQLATADPYVSDFYAQVFSALKRSRMISEGQGENPTVVQVGAGLGLGVGGPVGNRFGKMGQNTMTKLSTQVKKLVENRAQHQKVANTAALQGALGRVTRGNAAAPRPVLAIPTSNKPENRPTSHLNEQTGIHRAALTKKQIMFALEELYDAILELEQMRRDAPPPTAMEEIELWHNRCQAKVDIIWRRLMVMEPLDISNPHPFISLINPIKGQKLFPRLLRHLPQNQTITLLSLLVATYTQLDVVARAPPPPVADSSLLTKADRLDRAKREAETDNFLQFVIPGVDMIVNRCGLGLVAGMLAISAQRSEVWRVAATRPGIALYTALLSKAQSVIRTPIPDPMNPQQSQPVDPAELDQWTKTFTYFLHVLLPHLPDLFPSSLAQKAAFGPGAYLLGGENPLAEREGLEMEKREAEVWGFVAVLAVNAQEEDQTALVGALREKILHTVQAARHPSTTKERAEMKLRNVNMFLNGLGLDASMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.35
3 0.34
4 0.39
5 0.45
6 0.52
7 0.58
8 0.6
9 0.64
10 0.62
11 0.59
12 0.58
13 0.53
14 0.5
15 0.43
16 0.45
17 0.37
18 0.29
19 0.3
20 0.26
21 0.25
22 0.22
23 0.22
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.12
28 0.12
29 0.07
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.05
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.04
56 0.04
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.08
69 0.07
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.12
77 0.2
78 0.23
79 0.27
80 0.32
81 0.37
82 0.4
83 0.43
84 0.44
85 0.43
86 0.44
87 0.42
88 0.4
89 0.37
90 0.39
91 0.38
92 0.37
93 0.31
94 0.26
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.24
99 0.26
100 0.31
101 0.39
102 0.49
103 0.53
104 0.53
105 0.53
106 0.55
107 0.61
108 0.59
109 0.58
110 0.51
111 0.53
112 0.5
113 0.47
114 0.42
115 0.32
116 0.3
117 0.23
118 0.23
119 0.18
120 0.17
121 0.21
122 0.26
123 0.31
124 0.29
125 0.33
126 0.34
127 0.44
128 0.53
129 0.55
130 0.61
131 0.66
132 0.72
133 0.78
134 0.83
135 0.82
136 0.81
137 0.77
138 0.7
139 0.69
140 0.66
141 0.65
142 0.57
143 0.55
144 0.48
145 0.47
146 0.43
147 0.37
148 0.34
149 0.28
150 0.27
151 0.22
152 0.21
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.18
158 0.18
159 0.19
160 0.24
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.19
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.14
169 0.15
170 0.18
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.23
175 0.25
176 0.26
177 0.28
178 0.28
179 0.27
180 0.27
181 0.26
182 0.28
183 0.25
184 0.24
185 0.21
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.27
190 0.24
191 0.24
192 0.23
193 0.25
194 0.2
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.13
213 0.16
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.22
221 0.22
222 0.2
223 0.21
224 0.22
225 0.21
226 0.18
227 0.16
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.12
233 0.18
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.23
239 0.24
240 0.24
241 0.26
242 0.33
243 0.41
244 0.46
245 0.48
246 0.49
247 0.5
248 0.46
249 0.44
250 0.38
251 0.34
252 0.32
253 0.32
254 0.28
255 0.26
256 0.25
257 0.2
258 0.19
259 0.15
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.18
302 0.25
303 0.24
304 0.28
305 0.32
306 0.31
307 0.31
308 0.33
309 0.33
310 0.33
311 0.34
312 0.33
313 0.29
314 0.27
315 0.26
316 0.28
317 0.25
318 0.19
319 0.19
320 0.16
321 0.15
322 0.17
323 0.16
324 0.12
325 0.14
326 0.18
327 0.18
328 0.19
329 0.2
330 0.18
331 0.19
332 0.19
333 0.17
334 0.12
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.18
345 0.16
346 0.14
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.18
375 0.2
376 0.17
377 0.21
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.18
383 0.16
384 0.13
385 0.08
386 0.06
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.02
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.19
414 0.16
415 0.18
416 0.23
417 0.23
418 0.22
419 0.27
420 0.27
421 0.32
422 0.36
423 0.42
424 0.42
425 0.41
426 0.44
427 0.49
428 0.48
429 0.44
430 0.42
431 0.35
432 0.31
433 0.31
434 0.26
435 0.16
436 0.16
437 0.15
438 0.12
439 0.11
440 0.08
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.09
451 0.11
452 0.13
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.1
459 0.12
460 0.12
461 0.17
462 0.2
463 0.23
464 0.24
465 0.26
466 0.34
467 0.37
468 0.4
469 0.4
470 0.41
471 0.44
472 0.51
473 0.52
474 0.45
475 0.4
476 0.36
477 0.33
478 0.33
479 0.26
480 0.18
481 0.16
482 0.16
483 0.18
484 0.22
485 0.23
486 0.24
487 0.25
488 0.26
489 0.26
490 0.26
491 0.23
492 0.19
493 0.17
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.06
500 0.05
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.08
509 0.09
510 0.11
511 0.12
512 0.15
513 0.15
514 0.19
515 0.19
516 0.19
517 0.19
518 0.17
519 0.16
520 0.18
521 0.19
522 0.18
523 0.18
524 0.22
525 0.22
526 0.22
527 0.24
528 0.21
529 0.22
530 0.23
531 0.3
532 0.34
533 0.36
534 0.37
535 0.34
536 0.32
537 0.29
538 0.26
539 0.2
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.11
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.12
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.14
554 0.22
555 0.2
556 0.21
557 0.23
558 0.23
559 0.27
560 0.27
561 0.26
562 0.23
563 0.29
564 0.31
565 0.35
566 0.42
567 0.43
568 0.5
569 0.54
570 0.55
571 0.56
572 0.56
573 0.57
574 0.52
575 0.47
576 0.42
577 0.37
578 0.3
579 0.22
580 0.17
581 0.11
582 0.08
583 0.08
584 0.06
585 0.05
586 0.04
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.07
594 0.1
595 0.09
596 0.1
597 0.11
598 0.11
599 0.13
600 0.14
601 0.14
602 0.14
603 0.15
604 0.16
605 0.19
606 0.22
607 0.22
608 0.21
609 0.2
610 0.2
611 0.24
612 0.28
613 0.3
614 0.34
615 0.39
616 0.45
617 0.48
618 0.46
619 0.45
620 0.46
621 0.44
622 0.41
623 0.38
624 0.33
625 0.29
626 0.28
627 0.23
628 0.17
629 0.15
630 0.1
631 0.08
632 0.06
633 0.06
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.09
642 0.07
643 0.08
644 0.06
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.05
656 0.07
657 0.1
658 0.13
659 0.15
660 0.16
661 0.19
662 0.21
663 0.25
664 0.24
665 0.22
666 0.21
667 0.19
668 0.18
669 0.15
670 0.13
671 0.08
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.08
677 0.09
678 0.12
679 0.13
680 0.12
681 0.15
682 0.19
683 0.22
684 0.26
685 0.25
686 0.3
687 0.31
688 0.31
689 0.36
690 0.4
691 0.44
692 0.42
693 0.42
694 0.43
695 0.42
696 0.43
697 0.39
698 0.33
699 0.26
700 0.25
701 0.26
702 0.2
703 0.2
704 0.19
705 0.17
706 0.15
707 0.15
708 0.16
709 0.14
710 0.13
711 0.11
712 0.16
713 0.17
714 0.17
715 0.21
716 0.21
717 0.23
718 0.25
719 0.27
720 0.22
721 0.21
722 0.2
723 0.14
724 0.19
725 0.18
726 0.15
727 0.15
728 0.16
729 0.18
730 0.19
731 0.19
732 0.16
733 0.16
734 0.18
735 0.18
736 0.16
737 0.13
738 0.13
739 0.14
740 0.12
741 0.11
742 0.07
743 0.07
744 0.08
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.09
753 0.12
754 0.13
755 0.15
756 0.17
757 0.18
758 0.2
759 0.21
760 0.19
761 0.17
762 0.17
763 0.16
764 0.14
765 0.13
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.08
770 0.08
771 0.06
772 0.06
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.06
778 0.07
779 0.07
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.11
787 0.11
788 0.12
789 0.12
790 0.17
791 0.17
792 0.18
793 0.2
794 0.24
795 0.28
796 0.36
797 0.41
798 0.39
799 0.41
800 0.41
801 0.44
802 0.47
803 0.51
804 0.46
805 0.48
806 0.52
807 0.55
808 0.63
809 0.64
810 0.63
811 0.65
812 0.64
813 0.61
814 0.56
815 0.51
816 0.45
817 0.39
818 0.3
819 0.22
820 0.19
821 0.15
822 0.12
823 0.1