Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YM46

Protein Details
Accession C7YM46    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-291AAQGQAAKPKQQKRRAGKRIGKATNVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-286AAKPKQQKRRAGKRIGK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG nhe:NECHADRAFT_103760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MSSYLDRQANAFKGTLSAAAAKISNPSSNKASSLAPPSLTPLSPSPSAASDPNTPSSKRKRDAAPEVPYSQPQLTGYGAEVKTQMTFAVEYLKKKGDTKSITEIIDHLSLRGYDEEHKRELAEGLRGHPRVDWKPDASLSEQTWKTGTYAHRPIIPNVKDATSLLGHLQAKTDASGVSVKDLKDGWPDCEDTLAKLEQQHRILVVRTKKDNLPRYVWPNDASLHHSVQPEFQAMWHRVPLPSIDDMHRKLVSVGQKPTSEDPHKAAQGQAAKPKQQKRRAGKRIGKATNVHMAHLMQDYSGMRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.17
10 0.18
11 0.22
12 0.21
13 0.26
14 0.28
15 0.3
16 0.31
17 0.29
18 0.29
19 0.29
20 0.33
21 0.31
22 0.27
23 0.26
24 0.29
25 0.29
26 0.27
27 0.25
28 0.21
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.21
33 0.21
34 0.23
35 0.22
36 0.23
37 0.24
38 0.26
39 0.31
40 0.33
41 0.33
42 0.39
43 0.48
44 0.54
45 0.53
46 0.57
47 0.59
48 0.65
49 0.73
50 0.74
51 0.7
52 0.66
53 0.65
54 0.6
55 0.53
56 0.47
57 0.37
58 0.29
59 0.23
60 0.19
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.07
73 0.08
74 0.07
75 0.15
76 0.17
77 0.19
78 0.22
79 0.25
80 0.26
81 0.29
82 0.32
83 0.32
84 0.33
85 0.36
86 0.4
87 0.41
88 0.4
89 0.37
90 0.35
91 0.28
92 0.27
93 0.22
94 0.15
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.1
100 0.14
101 0.19
102 0.22
103 0.23
104 0.23
105 0.22
106 0.23
107 0.23
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.18
112 0.24
113 0.24
114 0.24
115 0.23
116 0.27
117 0.25
118 0.3
119 0.3
120 0.25
121 0.26
122 0.27
123 0.28
124 0.24
125 0.24
126 0.2
127 0.24
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.18
134 0.19
135 0.19
136 0.24
137 0.25
138 0.3
139 0.3
140 0.32
141 0.37
142 0.35
143 0.31
144 0.27
145 0.27
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.12
150 0.11
151 0.09
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.2
175 0.18
176 0.21
177 0.2
178 0.14
179 0.16
180 0.14
181 0.13
182 0.16
183 0.2
184 0.23
185 0.24
186 0.24
187 0.22
188 0.23
189 0.25
190 0.27
191 0.3
192 0.31
193 0.33
194 0.36
195 0.4
196 0.47
197 0.53
198 0.52
199 0.5
200 0.5
201 0.54
202 0.54
203 0.52
204 0.45
205 0.38
206 0.35
207 0.32
208 0.3
209 0.26
210 0.24
211 0.25
212 0.25
213 0.24
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.17
218 0.17
219 0.2
220 0.21
221 0.23
222 0.23
223 0.23
224 0.22
225 0.23
226 0.23
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.22
231 0.27
232 0.29
233 0.33
234 0.32
235 0.28
236 0.26
237 0.29
238 0.33
239 0.34
240 0.37
241 0.37
242 0.38
243 0.41
244 0.45
245 0.49
246 0.45
247 0.41
248 0.4
249 0.42
250 0.43
251 0.41
252 0.38
253 0.35
254 0.38
255 0.4
256 0.45
257 0.44
258 0.5
259 0.57
260 0.65
261 0.7
262 0.71
263 0.77
264 0.78
265 0.84
266 0.86
267 0.89
268 0.89
269 0.89
270 0.9
271 0.87
272 0.83
273 0.75
274 0.7
275 0.69
276 0.6
277 0.51
278 0.42
279 0.36
280 0.31
281 0.3
282 0.24
283 0.14
284 0.17