Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HTW8

Protein Details
Accession A0A1B9HTW8    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-64ISENSTKPPPFKRRKGDDEPKEPLTHydrophilic
151-174EEINNKKDKKGKGKSKENDSKSNPBasic
243-268FKLKTEFSKEKWRRRKEKKFSTTVHPBasic
509-537HPSKYQPDSHFRSKRRKTGNGKSSNKVIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-171KKDKKGKGKSKENDSK
248-261EFSKEKWRRRKEKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSIPDDVIKQPTEVNTENMEVDIPIHDIPANKEVEQVSIISENSTKPPPFKRRKGDDEPKEPLTEVILRRLTKMKEGDTVMLKLPSDAIKVVTIEKNGLIQLGKYGSFPSSQLIDLHYDITYEIIGGSFTSSSSSSSSTSRNSTPLPFLNEEINNKKDKKGKGKSKENDSKSNPGWKNILRPLKRQNVVEAVIDDITETNEHIHDLPEIEKQTLSHEEIAELKLNGMSVEEIIKKQEEAHEKFKLKTEFSKEKWRRRKEKKFSTTVHPLSPSIPNILSHYSERSPTSILHLRMDTLSQILNMSNIRPGGRYLVVDDTSGLVTSAILERIGAKGKILLFTNSDSPPAWGVLQTMNISERELECVKWLNWMEAQEDYERPPPPPEDDNAKPAKVAQRLRKHNAQVAELNATRDELHLGGWDGLIIASTLSPISILSFLTQYLIGSAQLVVYSPYQQILVELLNWSKKDPNYLNDTLSESWERTYQVLPGRTHPMMNTSSTGGYLWSAIRVHPSKYQPDSHFRSKRRKTGNGKSSNKVIEDDNLQKDNEEIQIQVNKKNDIVEVEAEIQNTEGEVIYNLFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.28
4 0.28
5 0.25
6 0.23
7 0.16
8 0.15
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.13
15 0.17
16 0.22
17 0.24
18 0.22
19 0.26
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.21
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.19
31 0.25
32 0.25
33 0.29
34 0.39
35 0.49
36 0.58
37 0.66
38 0.73
39 0.77
40 0.85
41 0.89
42 0.9
43 0.9
44 0.88
45 0.85
46 0.78
47 0.69
48 0.6
49 0.49
50 0.42
51 0.38
52 0.31
53 0.32
54 0.34
55 0.33
56 0.36
57 0.42
58 0.4
59 0.41
60 0.44
61 0.39
62 0.39
63 0.41
64 0.43
65 0.4
66 0.4
67 0.35
68 0.32
69 0.29
70 0.23
71 0.22
72 0.19
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.15
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.14
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.09
109 0.06
110 0.06
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.12
123 0.14
124 0.17
125 0.19
126 0.23
127 0.23
128 0.25
129 0.26
130 0.27
131 0.3
132 0.31
133 0.33
134 0.31
135 0.31
136 0.33
137 0.33
138 0.37
139 0.37
140 0.37
141 0.38
142 0.37
143 0.41
144 0.43
145 0.48
146 0.54
147 0.59
148 0.66
149 0.7
150 0.8
151 0.83
152 0.87
153 0.88
154 0.83
155 0.82
156 0.77
157 0.74
158 0.67
159 0.69
160 0.6
161 0.53
162 0.53
163 0.45
164 0.48
165 0.48
166 0.55
167 0.48
168 0.54
169 0.6
170 0.64
171 0.66
172 0.59
173 0.54
174 0.49
175 0.47
176 0.41
177 0.32
178 0.23
179 0.19
180 0.18
181 0.14
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.15
200 0.17
201 0.18
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.16
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.16
224 0.22
225 0.26
226 0.32
227 0.38
228 0.4
229 0.41
230 0.47
231 0.44
232 0.38
233 0.39
234 0.41
235 0.42
236 0.44
237 0.54
238 0.57
239 0.64
240 0.73
241 0.77
242 0.79
243 0.82
244 0.9
245 0.89
246 0.92
247 0.9
248 0.89
249 0.83
250 0.8
251 0.78
252 0.69
253 0.61
254 0.51
255 0.42
256 0.35
257 0.34
258 0.26
259 0.18
260 0.16
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.13
266 0.16
267 0.14
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.18
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.13
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.08
317 0.08
318 0.07
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.14
326 0.18
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.12
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.15
350 0.15
351 0.2
352 0.2
353 0.17
354 0.18
355 0.19
356 0.19
357 0.17
358 0.19
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.23
368 0.24
369 0.25
370 0.28
371 0.29
372 0.36
373 0.37
374 0.35
375 0.31
376 0.31
377 0.35
378 0.35
379 0.4
380 0.42
381 0.49
382 0.58
383 0.64
384 0.69
385 0.66
386 0.64
387 0.6
388 0.54
389 0.47
390 0.4
391 0.39
392 0.32
393 0.29
394 0.24
395 0.21
396 0.18
397 0.15
398 0.14
399 0.09
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.04
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.1
446 0.12
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.21
451 0.21
452 0.29
453 0.32
454 0.34
455 0.39
456 0.42
457 0.42
458 0.38
459 0.42
460 0.34
461 0.33
462 0.3
463 0.22
464 0.21
465 0.21
466 0.2
467 0.18
468 0.18
469 0.19
470 0.24
471 0.31
472 0.31
473 0.34
474 0.4
475 0.39
476 0.39
477 0.35
478 0.33
479 0.28
480 0.29
481 0.26
482 0.21
483 0.2
484 0.2
485 0.19
486 0.14
487 0.12
488 0.12
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.2
494 0.22
495 0.25
496 0.31
497 0.36
498 0.42
499 0.47
500 0.55
501 0.52
502 0.6
503 0.65
504 0.68
505 0.72
506 0.72
507 0.78
508 0.79
509 0.83
510 0.83
511 0.85
512 0.85
513 0.87
514 0.89
515 0.89
516 0.86
517 0.82
518 0.8
519 0.74
520 0.65
521 0.56
522 0.47
523 0.41
524 0.41
525 0.43
526 0.41
527 0.39
528 0.37
529 0.35
530 0.34
531 0.32
532 0.29
533 0.22
534 0.16
535 0.19
536 0.27
537 0.29
538 0.34
539 0.36
540 0.34
541 0.34
542 0.35
543 0.32
544 0.28
545 0.29
546 0.26
547 0.25
548 0.27
549 0.28
550 0.26
551 0.24
552 0.21
553 0.17
554 0.15
555 0.12
556 0.07
557 0.06
558 0.07