Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YU06

Protein Details
Accession C7YU06    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71ESGQQFARRKHIKKASQVKMHydrophilic
402-443PGPPGPDSPKHKHQKHHHKDKAENRRHSKSPERSRSSPKAEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-274KKRAK
401-442APGPPGPDSPKHKHQKHHHKDKAENRRHSKSPERSRSSPKAE
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 9.833, cyto 7.5, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG nhe:NECHADRAFT_96198  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MATDIVREGVLAINKPCGISSAQVIRECQKVFNPSKFFKPMIDAEIAKRMNESGQQFARRKHIKKASQVKMGHGGTLDPLATGVLILGIGSGTKVLSQFLECTKTYETVILFGASTDTYDRVGRILTKRPYDHITREKVEKELASMKGPLTQIPPLYSALKMNGKPLYEYAREGKPIPREIEGREVEIKDIELLEWYEPGKHSHRWPTEEAEAAERNLAEQVWRVKKQQETNKKLSPEEKEEDDQAIAAHESFKRKFEQRQDELIKDAPKKRAKNSKNPPMMSGALGQLPQPIYSEKGTHLVPDAPDENTPPPWSDEGPPAARVRLTVTSGFYIRSFCHDLGAKMDSAALMAELCRSRQSDFSIGGDNCLEFDDLSKGEEVWAPQVASMLEQWSNENKDKAPGPPGPDSPKHKHQKHHHKDKAENRRHSKSPERSRSSPKAEATESKDDAKQANEPKPSKKDAEPTKEEAKPNNGTRSDDEKSWNGIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.22
8 0.26
9 0.31
10 0.34
11 0.37
12 0.38
13 0.43
14 0.42
15 0.38
16 0.36
17 0.4
18 0.44
19 0.51
20 0.56
21 0.53
22 0.6
23 0.63
24 0.59
25 0.51
26 0.5
27 0.44
28 0.41
29 0.42
30 0.36
31 0.33
32 0.41
33 0.39
34 0.33
35 0.3
36 0.26
37 0.23
38 0.27
39 0.27
40 0.27
41 0.33
42 0.42
43 0.46
44 0.5
45 0.58
46 0.61
47 0.62
48 0.65
49 0.69
50 0.68
51 0.74
52 0.8
53 0.79
54 0.79
55 0.77
56 0.71
57 0.7
58 0.62
59 0.52
60 0.42
61 0.33
62 0.24
63 0.23
64 0.18
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.08
85 0.11
86 0.14
87 0.18
88 0.18
89 0.21
90 0.22
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.19
95 0.17
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.15
111 0.19
112 0.27
113 0.32
114 0.38
115 0.4
116 0.43
117 0.47
118 0.47
119 0.52
120 0.51
121 0.52
122 0.5
123 0.53
124 0.51
125 0.48
126 0.45
127 0.36
128 0.31
129 0.3
130 0.28
131 0.24
132 0.24
133 0.22
134 0.24
135 0.24
136 0.22
137 0.18
138 0.19
139 0.18
140 0.18
141 0.2
142 0.17
143 0.18
144 0.17
145 0.16
146 0.18
147 0.23
148 0.22
149 0.24
150 0.25
151 0.24
152 0.24
153 0.25
154 0.27
155 0.22
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.26
160 0.27
161 0.29
162 0.29
163 0.32
164 0.31
165 0.31
166 0.3
167 0.31
168 0.37
169 0.33
170 0.31
171 0.29
172 0.27
173 0.24
174 0.22
175 0.2
176 0.12
177 0.11
178 0.08
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.22
190 0.3
191 0.35
192 0.38
193 0.4
194 0.41
195 0.39
196 0.39
197 0.34
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.19
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.06
207 0.07
208 0.15
209 0.2
210 0.22
211 0.24
212 0.28
213 0.33
214 0.41
215 0.49
216 0.53
217 0.55
218 0.6
219 0.63
220 0.61
221 0.58
222 0.55
223 0.5
224 0.45
225 0.41
226 0.36
227 0.32
228 0.31
229 0.29
230 0.24
231 0.19
232 0.13
233 0.1
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.18
242 0.21
243 0.28
244 0.36
245 0.44
246 0.45
247 0.53
248 0.55
249 0.53
250 0.51
251 0.48
252 0.43
253 0.39
254 0.39
255 0.38
256 0.42
257 0.45
258 0.51
259 0.58
260 0.6
261 0.66
262 0.72
263 0.73
264 0.75
265 0.72
266 0.66
267 0.59
268 0.53
269 0.43
270 0.33
271 0.24
272 0.16
273 0.15
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.15
291 0.15
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.19
304 0.22
305 0.23
306 0.24
307 0.23
308 0.22
309 0.2
310 0.19
311 0.18
312 0.16
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.18
317 0.18
318 0.19
319 0.16
320 0.15
321 0.13
322 0.17
323 0.19
324 0.17
325 0.2
326 0.21
327 0.21
328 0.23
329 0.24
330 0.19
331 0.15
332 0.15
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.16
346 0.2
347 0.21
348 0.23
349 0.24
350 0.29
351 0.28
352 0.28
353 0.26
354 0.21
355 0.17
356 0.16
357 0.15
358 0.07
359 0.08
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.11
379 0.13
380 0.17
381 0.23
382 0.25
383 0.27
384 0.26
385 0.29
386 0.32
387 0.33
388 0.34
389 0.33
390 0.35
391 0.38
392 0.43
393 0.46
394 0.51
395 0.56
396 0.57
397 0.63
398 0.68
399 0.69
400 0.74
401 0.78
402 0.82
403 0.85
404 0.89
405 0.87
406 0.86
407 0.89
408 0.9
409 0.9
410 0.89
411 0.88
412 0.85
413 0.85
414 0.81
415 0.8
416 0.8
417 0.79
418 0.8
419 0.81
420 0.8
421 0.8
422 0.84
423 0.85
424 0.83
425 0.79
426 0.72
427 0.68
428 0.64
429 0.64
430 0.61
431 0.6
432 0.54
433 0.5
434 0.48
435 0.44
436 0.42
437 0.37
438 0.38
439 0.38
440 0.43
441 0.49
442 0.52
443 0.59
444 0.63
445 0.67
446 0.65
447 0.63
448 0.65
449 0.66
450 0.71
451 0.69
452 0.69
453 0.71
454 0.72
455 0.7
456 0.66
457 0.64
458 0.63
459 0.63
460 0.65
461 0.6
462 0.58
463 0.59
464 0.6
465 0.57
466 0.51
467 0.5
468 0.44
469 0.46