Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HSI6

Protein Details
Accession A0A1B9HSI6    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-405NNNNISGEKKKGKKKRPPPIVEEEEIEIKEKSKIKKKKKTNNNNNNNQPEPEPTKIEDQPPPQKKKKKSTAIANNAEIPPAETIPVKKKTQKKKKDDGENKEKKETTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-337EKKKGKKKRPPPIVEEEEIEIKEKSKIKKKKK
361-367QKKKKKS
383-399PVKKKTQKKKKDDGENK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRRWESSLTVQLFSSHWRFENSPMNFQYEGDMKPFLLALRSQVIPATLIRFLYSIQPPISFVDGCLVVEIQDYRKSPETRSRVVMRPAAETLAQTIDVMLERKGQNLDEGMGLELESRIIAATSPPLYLGTSILATRNATLALALTSPAGPSLASDGSVRNTLANGQGGSGDSKSLDKMSKLLRAGISSRSGTNNGNSTNVVGNGFQPNWNVLRAKEQYEQIKLQRENEQREAANRNQNLLNNNSNNQDQNDPSSSSSILQQQNGINNINGINGENNNNNNNNISGEKKKGKKKRPPPIVEEEEIEIKEKSKIKKKKKTNNNNNNNQPEPEPTKIEDQPPPQKKKKKSTAIANNAEIPPAETIPVKKKTQKKKKDDGENKEKKETTGQSENPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.67
6 0.75
7 0.8
8 0.73
9 0.7
10 0.68
11 0.65
12 0.66
13 0.68
14 0.62
15 0.53
16 0.48
17 0.44
18 0.39
19 0.37
20 0.31
21 0.24
22 0.23
23 0.26
24 0.28
25 0.33
26 0.42
27 0.4
28 0.45
29 0.44
30 0.47
31 0.43
32 0.41
33 0.39
34 0.33
35 0.3
36 0.23
37 0.23
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.18
59 0.2
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.22
64 0.23
65 0.25
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.11
73 0.08
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.15
78 0.16
79 0.19
80 0.27
81 0.28
82 0.32
83 0.4
84 0.45
85 0.45
86 0.51
87 0.53
88 0.52
89 0.56
90 0.55
91 0.47
92 0.43
93 0.39
94 0.34
95 0.28
96 0.22
97 0.18
98 0.14
99 0.13
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.12
185 0.14
186 0.19
187 0.19
188 0.21
189 0.19
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.2
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.18
220 0.2
221 0.24
222 0.25
223 0.29
224 0.31
225 0.34
226 0.37
227 0.33
228 0.4
229 0.37
230 0.37
231 0.42
232 0.44
233 0.46
234 0.47
235 0.46
236 0.38
237 0.41
238 0.44
239 0.4
240 0.42
241 0.36
242 0.35
243 0.34
244 0.36
245 0.35
246 0.34
247 0.35
248 0.29
249 0.31
250 0.3
251 0.3
252 0.28
253 0.27
254 0.25
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.17
263 0.18
264 0.22
265 0.22
266 0.21
267 0.23
268 0.24
269 0.27
270 0.29
271 0.28
272 0.2
273 0.18
274 0.18
275 0.15
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.2
284 0.22
285 0.22
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.27
293 0.35
294 0.42
295 0.51
296 0.6
297 0.69
298 0.75
299 0.82
300 0.85
301 0.88
302 0.88
303 0.86
304 0.86
305 0.82
306 0.73
307 0.65
308 0.56
309 0.48
310 0.4
311 0.34
312 0.24
313 0.18
314 0.21
315 0.25
316 0.31
317 0.38
318 0.49
319 0.58
320 0.68
321 0.79
322 0.84
323 0.89
324 0.93
325 0.94
326 0.95
327 0.94
328 0.95
329 0.94
330 0.91
331 0.82
332 0.73
333 0.64
334 0.6
335 0.55
336 0.48
337 0.41
338 0.36
339 0.4
340 0.41
341 0.45
342 0.45
343 0.48
344 0.55
345 0.61
346 0.69
347 0.72
348 0.78
349 0.82
350 0.86
351 0.88
352 0.88
353 0.87
354 0.88
355 0.89
356 0.9
357 0.88
358 0.8
359 0.76
360 0.65
361 0.56
362 0.45
363 0.35
364 0.27
365 0.2
366 0.18
367 0.14
368 0.19
369 0.27
370 0.34
371 0.39
372 0.46
373 0.55
374 0.65
375 0.74
376 0.8
377 0.82
378 0.86
379 0.9
380 0.92
381 0.93
382 0.93
383 0.93
384 0.93
385 0.89
386 0.87
387 0.78
388 0.69
389 0.68
390 0.64
391 0.61
392 0.6