Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HSQ6

Protein Details
Accession A0A1B9HSQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-98IKKVQGCAKKGCKNNPRCYNHLGHydrophilic
287-310LYNCPACMRKRKAIRQQTPTKYPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR033841  USP48  
IPR018200  USP_CS  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00240  ubiquitin  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50053  UBIQUITIN_2  
PS00972  USP_1  
PS00973  USP_2  
PS50235  USP_3  
CDD cd02668  Peptidase_C19L  
Amino Acid Sequences MPPKKGIQPDWSWIEDVSSPDEITPDHRRLAAGLGHLLPCPFNYTSDKPQESRDDQSDDEIFEVDSKGNSKSKAVIKKVQGCAKKGCKNNPRCYNHLGAEAILRSDAKQIYLDEHAEPIPIDREGPAGLRNLGATCYANAFLQLWYHNVAFRNGVYDCVTTDTTPLYQLAIVFGMLQHSNRQLVDPMGLIDALRLEKGNQQDAAEFSKLFMSVLASEFAKNPDPKIRSFLKEQFEGEMEYVTTCECGYESKTTSTFLELEFNLKDKTTLEDCLNSLKNPEILEGDNLYNCPACMRKRKAIRQQTPTKYPPVIHMALMRFVFNIKTMSRKKSPASITYPKEIYLGGDRYDLRAVITHEGKSAHHGHFICEVYDESQHSWLLCNDEEVKTLSDRPAKRPRLSLKLDNDTQTSTDAYMLVYKRREISWVIARDPPSAITDQVISQNLSLEEERNEIGVKREQLEDEFGQINGLQRHPDRLVPRHSLFRFLDADSSAELYGPFDFASILCAHGGIDPEKAQDTVLISEEAFDQIQLINECPQHEICSVCIETEYTSRQTQNGQDERTEAFEQANQEGEPEYVISKIWYDEWKQGNLPAHVLPTSEGFSLYCEHGDRRIIPKNHLKKTCMIISAEALAILKSIIGEFQVFRMDQEDCDRCSSVTHVTAEIRRARIAESRTDRQVKNRHLNPKPPAFCLDYFALSPAFVEEWEKYMKGDRDQPEMHVEICPHGGLDWDPQMEPRPIVDENGWDLLVAKYGQKQPVVLQFGPNTPSTNKTHVDTFSPGICDECCTARRTNFDLIDIPIIRMRFPSPSNIGSSSYQTNDLNGVQSRLVLQNGFNRGMDQNAIIDSRTRKGKSDFTFTGTKETSIKDLKVHIMNKTQGRLTPIQQKLYYKGKELASEDTIGSISFLLGDHLNVEEIIEDIDIDSDVVEIERSHNNGREEGFSGTALFGRIPCPDCTFENDGAARSCEMCMRPLQIDHIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.32
3 0.29
4 0.25
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.17
10 0.21
11 0.27
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.28
16 0.28
17 0.33
18 0.3
19 0.25
20 0.25
21 0.25
22 0.25
23 0.26
24 0.25
25 0.21
26 0.18
27 0.2
28 0.17
29 0.18
30 0.24
31 0.3
32 0.39
33 0.48
34 0.53
35 0.49
36 0.55
37 0.61
38 0.58
39 0.59
40 0.55
41 0.5
42 0.46
43 0.49
44 0.44
45 0.36
46 0.32
47 0.25
48 0.2
49 0.16
50 0.16
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.16
55 0.2
56 0.21
57 0.22
58 0.29
59 0.37
60 0.45
61 0.5
62 0.55
63 0.6
64 0.68
65 0.75
66 0.76
67 0.74
68 0.69
69 0.72
70 0.73
71 0.72
72 0.71
73 0.73
74 0.75
75 0.8
76 0.86
77 0.86
78 0.83
79 0.8
80 0.78
81 0.75
82 0.67
83 0.61
84 0.51
85 0.41
86 0.38
87 0.33
88 0.27
89 0.2
90 0.17
91 0.13
92 0.17
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.22
99 0.24
100 0.2
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.18
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.2
140 0.17
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.18
146 0.19
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.15
173 0.13
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.13
184 0.16
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.21
189 0.23
190 0.26
191 0.23
192 0.2
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.14
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.15
206 0.19
207 0.19
208 0.21
209 0.28
210 0.3
211 0.31
212 0.36
213 0.39
214 0.37
215 0.44
216 0.49
217 0.46
218 0.47
219 0.46
220 0.42
221 0.38
222 0.35
223 0.27
224 0.2
225 0.15
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.09
235 0.13
236 0.16
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.2
243 0.16
244 0.18
245 0.15
246 0.17
247 0.16
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.12
253 0.16
254 0.16
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.26
260 0.26
261 0.22
262 0.21
263 0.2
264 0.2
265 0.18
266 0.19
267 0.14
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.17
280 0.27
281 0.34
282 0.42
283 0.52
284 0.62
285 0.71
286 0.78
287 0.82
288 0.82
289 0.86
290 0.85
291 0.84
292 0.77
293 0.72
294 0.63
295 0.54
296 0.48
297 0.44
298 0.37
299 0.29
300 0.3
301 0.26
302 0.27
303 0.27
304 0.22
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.11
309 0.13
310 0.1
311 0.19
312 0.24
313 0.31
314 0.35
315 0.39
316 0.4
317 0.46
318 0.49
319 0.47
320 0.51
321 0.53
322 0.52
323 0.52
324 0.51
325 0.43
326 0.39
327 0.32
328 0.25
329 0.21
330 0.19
331 0.15
332 0.18
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.17
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.18
345 0.18
346 0.2
347 0.23
348 0.19
349 0.23
350 0.23
351 0.23
352 0.27
353 0.28
354 0.23
355 0.19
356 0.19
357 0.14
358 0.15
359 0.15
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.11
366 0.13
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.13
375 0.14
376 0.16
377 0.22
378 0.23
379 0.31
380 0.4
381 0.46
382 0.48
383 0.54
384 0.57
385 0.58
386 0.62
387 0.62
388 0.58
389 0.58
390 0.58
391 0.52
392 0.46
393 0.38
394 0.32
395 0.25
396 0.19
397 0.12
398 0.1
399 0.08
400 0.07
401 0.11
402 0.11
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.16
407 0.16
408 0.18
409 0.16
410 0.2
411 0.24
412 0.27
413 0.28
414 0.3
415 0.31
416 0.3
417 0.28
418 0.24
419 0.17
420 0.15
421 0.13
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.09
439 0.08
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.15
447 0.18
448 0.15
449 0.15
450 0.14
451 0.12
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.14
460 0.15
461 0.18
462 0.2
463 0.24
464 0.29
465 0.33
466 0.35
467 0.4
468 0.39
469 0.41
470 0.37
471 0.36
472 0.32
473 0.26
474 0.25
475 0.18
476 0.18
477 0.12
478 0.12
479 0.09
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.08
521 0.1
522 0.1
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.12
528 0.1
529 0.13
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.09
534 0.09
535 0.11
536 0.13
537 0.12
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.18
542 0.21
543 0.28
544 0.31
545 0.29
546 0.28
547 0.29
548 0.29
549 0.3
550 0.27
551 0.18
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.14
556 0.14
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.09
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.07
570 0.1
571 0.12
572 0.19
573 0.22
574 0.23
575 0.23
576 0.26
577 0.29
578 0.27
579 0.26
580 0.19
581 0.18
582 0.16
583 0.16
584 0.13
585 0.1
586 0.11
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.12
597 0.14
598 0.15
599 0.2
600 0.29
601 0.3
602 0.35
603 0.45
604 0.53
605 0.59
606 0.62
607 0.58
608 0.54
609 0.57
610 0.55
611 0.47
612 0.38
613 0.3
614 0.26
615 0.25
616 0.2
617 0.15
618 0.11
619 0.07
620 0.07
621 0.05
622 0.04
623 0.03
624 0.03
625 0.03
626 0.04
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.17
637 0.19
638 0.18
639 0.21
640 0.21
641 0.19
642 0.2
643 0.21
644 0.18
645 0.18
646 0.18
647 0.17
648 0.19
649 0.22
650 0.26
651 0.28
652 0.26
653 0.23
654 0.23
655 0.23
656 0.26
657 0.26
658 0.3
659 0.33
660 0.36
661 0.43
662 0.49
663 0.49
664 0.52
665 0.59
666 0.59
667 0.62
668 0.65
669 0.68
670 0.68
671 0.76
672 0.75
673 0.76
674 0.69
675 0.61
676 0.57
677 0.51
678 0.45
679 0.4
680 0.34
681 0.26
682 0.23
683 0.21
684 0.18
685 0.13
686 0.12
687 0.09
688 0.07
689 0.06
690 0.08
691 0.07
692 0.1
693 0.12
694 0.12
695 0.12
696 0.18
697 0.21
698 0.22
699 0.31
700 0.31
701 0.37
702 0.38
703 0.39
704 0.38
705 0.36
706 0.33
707 0.26
708 0.23
709 0.17
710 0.17
711 0.15
712 0.1
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.11
717 0.12
718 0.13
719 0.13
720 0.14
721 0.18
722 0.18
723 0.18
724 0.15
725 0.16
726 0.15
727 0.17
728 0.17
729 0.16
730 0.17
731 0.18
732 0.17
733 0.13
734 0.14
735 0.12
736 0.13
737 0.11
738 0.1
739 0.14
740 0.19
741 0.23
742 0.22
743 0.23
744 0.25
745 0.33
746 0.38
747 0.33
748 0.32
749 0.31
750 0.33
751 0.34
752 0.31
753 0.26
754 0.21
755 0.26
756 0.26
757 0.29
758 0.29
759 0.29
760 0.32
761 0.31
762 0.33
763 0.32
764 0.3
765 0.26
766 0.26
767 0.23
768 0.2
769 0.19
770 0.17
771 0.15
772 0.17
773 0.17
774 0.19
775 0.24
776 0.26
777 0.31
778 0.34
779 0.4
780 0.37
781 0.37
782 0.36
783 0.33
784 0.36
785 0.31
786 0.28
787 0.23
788 0.22
789 0.19
790 0.18
791 0.18
792 0.17
793 0.18
794 0.23
795 0.26
796 0.28
797 0.32
798 0.32
799 0.34
800 0.31
801 0.33
802 0.3
803 0.27
804 0.28
805 0.24
806 0.23
807 0.22
808 0.21
809 0.21
810 0.19
811 0.19
812 0.16
813 0.16
814 0.17
815 0.17
816 0.17
817 0.14
818 0.16
819 0.21
820 0.25
821 0.27
822 0.25
823 0.25
824 0.24
825 0.25
826 0.23
827 0.17
828 0.14
829 0.13
830 0.14
831 0.12
832 0.16
833 0.17
834 0.22
835 0.29
836 0.3
837 0.33
838 0.38
839 0.47
840 0.47
841 0.54
842 0.51
843 0.48
844 0.53
845 0.49
846 0.52
847 0.43
848 0.4
849 0.33
850 0.32
851 0.34
852 0.32
853 0.33
854 0.28
855 0.31
856 0.35
857 0.4
858 0.42
859 0.41
860 0.43
861 0.49
862 0.51
863 0.51
864 0.48
865 0.43
866 0.46
867 0.45
868 0.43
869 0.47
870 0.47
871 0.5
872 0.52
873 0.53
874 0.53
875 0.59
876 0.55
877 0.5
878 0.5
879 0.46
880 0.48
881 0.47
882 0.46
883 0.39
884 0.38
885 0.33
886 0.27
887 0.24
888 0.19
889 0.16
890 0.11
891 0.07
892 0.06
893 0.06
894 0.07
895 0.07
896 0.07
897 0.08
898 0.08
899 0.09
900 0.08
901 0.08
902 0.06
903 0.06
904 0.07
905 0.06
906 0.05
907 0.05
908 0.06
909 0.06
910 0.05
911 0.05
912 0.04
913 0.05
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.09
918 0.13
919 0.17
920 0.22
921 0.27
922 0.3
923 0.32
924 0.34
925 0.34
926 0.33
927 0.32
928 0.28
929 0.23
930 0.21
931 0.18
932 0.17
933 0.14
934 0.13
935 0.11
936 0.12
937 0.16
938 0.19
939 0.21
940 0.25
941 0.27
942 0.29
943 0.35
944 0.39
945 0.36
946 0.39
947 0.37
948 0.35
949 0.34
950 0.34
951 0.28
952 0.23
953 0.22
954 0.21
955 0.21
956 0.22
957 0.23
958 0.26
959 0.28
960 0.29