FuNGI

A0A1B9HT64

Protein Details

Accession

A0A1B9HT64

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	SDAALFLRKRKDKDRRSRVPSRPVGGP	Hydrophilic
175-197	DKIGKAPGKKKMKKGTKEVFHQD	Basic
664-686	GGISNRPGKKSKKGSNTPTPGPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-21	RKRKDKDRRSRVP
178-189	GKAPGKKKMKKG
443-453	GKKLKRIMKKR
629-629	K
670-676	PGKKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSDAALFLRKRKDKDRRSRVPSRPVGGPSSSTNNVSTASSSTRPNGVASCSASSSAGVKTEPGTNGQNANITEIKIFSSGSDGGLRFNFMRLNHEKEIDPSQIGKNILLNRKKPGPREPSKYAMNKEGKIVGKFVYDNEGKLVLDSEGKPIIERKPEIEGMDMSLVGQAPEEIEDKIGKAPGKKKMKKGTKEVFHQDIEIMRLRREEASPWILESSKPKDKSIIPEYWVGRMQEPSALPTVLLVNDGTTEGFEMVPLGRTYKFVPDRPFKVLDSDAANKMFEHQAKHKIHDRWALRPEGANNIVTPEHIVHGVKAEREMEERVRRMEIRMNQFNGVAIDRKPKIERFEDDYVKEGRRAERGLEGGIDEELDFDETEHFQDDDDVNTFYRNADEEDQAREAEEIQKKEYRLANANVGDKPQIADEDGEDDGDLFGEKKKYSDEGKKLKRIMKKRQEDGEDEDMFSDDDESDETDTESVSSKTSQNKEKERDKDGKPIDDQGSGSRPSSRGPGSRGTSSPTGKRPNVPLSGKASTAPPGSGAAFLAQRAASRGASPRPPGGARAGSPLSGRAASPETGNGRATSPVMRGTSPVPPSRGQSPAPARGSSPVSGTTSRDASPAPGGNTKSKGKRKTDSESPGPGVGTTASPSGKRKNSPAEGNTNSNGGISNRPGKKSKKGSNTPTPGPEDLPNFEGMITKQDVLDWFKSLKKETVPMSEAISAFRNRIMNAGKNRESNQKLFLGWMKMLADQEEKMLRLKEEYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.86
3	0.86
4	0.89
5	0.93
6	0.92
7	0.91
8	0.89
9	0.83
10	0.78
11	0.72
12	0.67
13	0.59
14	0.52
15	0.46
16	0.45
17	0.42
18	0.37
19	0.34
20	0.3
21	0.29
22	0.27
23	0.23
24	0.19
25	0.21
26	0.22
27	0.24
28	0.25
29	0.27
30	0.27
31	0.28
32	0.27
33	0.26
34	0.27
35	0.27
36	0.27
37	0.25
38	0.25
39	0.23
40	0.22
41	0.2
42	0.17
43	0.15
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.19
48	0.19
49	0.21
50	0.24
51	0.25
52	0.27
53	0.27
54	0.3
55	0.25
56	0.29
57	0.27
58	0.24
59	0.21
60	0.19
61	0.19
62	0.15
63	0.15
64	0.1
65	0.13
66	0.13
67	0.14
68	0.18
69	0.17
70	0.18
71	0.19
72	0.21
73	0.18
74	0.19
75	0.21
76	0.17
77	0.25
78	0.28
79	0.36
80	0.36
81	0.38
82	0.37
83	0.38
84	0.42
85	0.36
86	0.33
87	0.28
88	0.28
89	0.3
90	0.3
91	0.27
92	0.27
93	0.32
94	0.4
95	0.44
96	0.45
97	0.47
98	0.56
99	0.6
100	0.62
101	0.64
102	0.66
103	0.67
104	0.73
105	0.73
106	0.7
107	0.73
108	0.74
109	0.68
110	0.68
111	0.65
112	0.57
113	0.54
114	0.54
115	0.5
116	0.43
117	0.41
118	0.32
119	0.28
120	0.27
121	0.25
122	0.26
123	0.22
124	0.21
125	0.21
126	0.21
127	0.18
128	0.18
129	0.18
130	0.11
131	0.14
132	0.14
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.17
137	0.2
138	0.24
139	0.27
140	0.27
141	0.27
142	0.3
143	0.33
144	0.33
145	0.32
146	0.27
147	0.22
148	0.22
149	0.19
150	0.13
151	0.12
152	0.11
153	0.08
154	0.07
155	0.05
156	0.05
157	0.06
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.11
164	0.14
165	0.15
166	0.21
167	0.27
168	0.36
169	0.47
170	0.53
171	0.61
172	0.69
173	0.77
174	0.79
175	0.83
176	0.83
177	0.8
178	0.82
179	0.8
180	0.74
181	0.65
182	0.57
183	0.48
184	0.39
185	0.34
186	0.31
187	0.24
188	0.2
189	0.2
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.2
194	0.2
195	0.24
196	0.23
197	0.23
198	0.23
199	0.21
200	0.22
201	0.25
202	0.27
203	0.31
204	0.33
205	0.33
206	0.36
207	0.39
208	0.46
209	0.47
210	0.44
211	0.37
212	0.42
213	0.42
214	0.41
215	0.41
216	0.33
217	0.28
218	0.24
219	0.22
220	0.2
221	0.19
222	0.17
223	0.16
224	0.15
225	0.13
226	0.12
227	0.13
228	0.09
229	0.09
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.1
247	0.11
248	0.2
249	0.24
250	0.27
251	0.35
252	0.41
253	0.44
254	0.48
255	0.49
256	0.41
257	0.4
258	0.36
259	0.3
260	0.28
261	0.27
262	0.25
263	0.23
264	0.23
265	0.19
266	0.2
267	0.22
268	0.19
269	0.2
270	0.22
271	0.31
272	0.33
273	0.38
274	0.44
275	0.43
276	0.47
277	0.51
278	0.49
279	0.46
280	0.49
281	0.47
282	0.4
283	0.38
284	0.34
285	0.31
286	0.3
287	0.23
288	0.18
289	0.17
290	0.16
291	0.14
292	0.14
293	0.09
294	0.08
295	0.09
296	0.09
297	0.07
298	0.1
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.12
304	0.13
305	0.16
306	0.18
307	0.23
308	0.24
309	0.24
310	0.26
311	0.26
312	0.26
313	0.3
314	0.31
315	0.34
316	0.38
317	0.38
318	0.36
319	0.36
320	0.34
321	0.29
322	0.23
323	0.16
324	0.12
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.22
330	0.26
331	0.28
332	0.31
333	0.32
334	0.38
335	0.39
336	0.37
337	0.37
338	0.35
339	0.32
340	0.3
341	0.25
342	0.2
343	0.2
344	0.2
345	0.19
346	0.19
347	0.19
348	0.17
349	0.15
350	0.13
351	0.1
352	0.09
353	0.08
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.11
380	0.12
381	0.14
382	0.15
383	0.14
384	0.14
385	0.12
386	0.1
387	0.15
388	0.18
389	0.17
390	0.19
391	0.22
392	0.22
393	0.27
394	0.29
395	0.26
396	0.27
397	0.28
398	0.31
399	0.31
400	0.33
401	0.29
402	0.27
403	0.24
404	0.19
405	0.17
406	0.12
407	0.09
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.04
420	0.05
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.1
425	0.13
426	0.2
427	0.28
428	0.36
429	0.45
430	0.53
431	0.59
432	0.64
433	0.67
434	0.69
435	0.7
436	0.72
437	0.72
438	0.73
439	0.73
440	0.74
441	0.71
442	0.67
443	0.64
444	0.6
445	0.5
446	0.41
447	0.34
448	0.27
449	0.23
450	0.19
451	0.13
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.09
466	0.12
467	0.19
468	0.25
469	0.32
470	0.39
471	0.47
472	0.54
473	0.61
474	0.64
475	0.64
476	0.67
477	0.63
478	0.65
479	0.6
480	0.58
481	0.5
482	0.5
483	0.45
484	0.39
485	0.36
486	0.29
487	0.28
488	0.24
489	0.23
490	0.19
491	0.18
492	0.17
493	0.21
494	0.22
495	0.22
496	0.24
497	0.31
498	0.32
499	0.35
500	0.35
501	0.35
502	0.37
503	0.36
504	0.39
505	0.39
506	0.43
507	0.42
508	0.45
509	0.47
510	0.48
511	0.52
512	0.49
513	0.47
514	0.45
515	0.45
516	0.41
517	0.36
518	0.31
519	0.26
520	0.24
521	0.19
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.11
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.08
532	0.08
533	0.1
534	0.12
535	0.1
536	0.12
537	0.17
538	0.2
539	0.25
540	0.27
541	0.27
542	0.29
543	0.29
544	0.29
545	0.3
546	0.28
547	0.24
548	0.27
549	0.26
550	0.23
551	0.23
552	0.22
553	0.19
554	0.17
555	0.15
556	0.12
557	0.14
558	0.14
559	0.14
560	0.17
561	0.18
562	0.2
563	0.21
564	0.19
565	0.17
566	0.18
567	0.19
568	0.16
569	0.15
570	0.17
571	0.18
572	0.17
573	0.18
574	0.19
575	0.25
576	0.27
577	0.3
578	0.29
579	0.29
580	0.32
581	0.35
582	0.37
583	0.31
584	0.36
585	0.39
586	0.44
587	0.46
588	0.43
589	0.4
590	0.4
591	0.42
592	0.34
593	0.29
594	0.22
595	0.22
596	0.23
597	0.25
598	0.24
599	0.23
600	0.22
601	0.22
602	0.19
603	0.18
604	0.21
605	0.22
606	0.22
607	0.25
608	0.27
609	0.31
610	0.36
611	0.42
612	0.47
613	0.53
614	0.59
615	0.62
616	0.68
617	0.71
618	0.74
619	0.76
620	0.75
621	0.74
622	0.71
623	0.66
624	0.58
625	0.51
626	0.42
627	0.33
628	0.25
629	0.18
630	0.13
631	0.13
632	0.13
633	0.16
634	0.21
635	0.29
636	0.34
637	0.38
638	0.44
639	0.51
640	0.58
641	0.64
642	0.65
643	0.66
644	0.65
645	0.66
646	0.59
647	0.5
648	0.42
649	0.34
650	0.29
651	0.21
652	0.2
653	0.2
654	0.28
655	0.32
656	0.37
657	0.44
658	0.49
659	0.58
660	0.64
661	0.69
662	0.71
663	0.76
664	0.81
665	0.85
666	0.87
667	0.83
668	0.78
669	0.74
670	0.65
671	0.58
672	0.53
673	0.46
674	0.4
675	0.36
676	0.3
677	0.25
678	0.23
679	0.22
680	0.18
681	0.19
682	0.18
683	0.17
684	0.16
685	0.17
686	0.21
687	0.24
688	0.25
689	0.23
690	0.24
691	0.27
692	0.31
693	0.33
694	0.35
695	0.34
696	0.38
697	0.4
698	0.46
699	0.44
700	0.42
701	0.41
702	0.4
703	0.37
704	0.33
705	0.32
706	0.26
707	0.24
708	0.27
709	0.25
710	0.21
711	0.28
712	0.31
713	0.35
714	0.44
715	0.52
716	0.54
717	0.57
718	0.61
719	0.65
720	0.65
721	0.6
722	0.56
723	0.49
724	0.44
725	0.43
726	0.45
727	0.39
728	0.34
729	0.33
730	0.29
731	0.28
732	0.29
733	0.27
734	0.24
735	0.2
736	0.24
737	0.24
738	0.24
739	0.26
740	0.28
741	0.26

A0A1B9HT64

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer