Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7Z4Y9

Protein Details
Accession C7Z4Y9    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-200EEARRNADKKDRKHKHRHHRSHRSRRDDSREDRBasic
219-307EKESRRHRDRDDDRDRRRDRDRRRDREDEDGERDRDRRRDRDRDRDREHRRRDRDEDDESRHRRHRDEDDKDRKPRRRSRSRSPRRRDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-306KKKEVEEARRNADKKDRKHKHRHHRSHRSRRDDSREDRHRKSRRDETPVEGDERRHEKESRRHRDRDDDRDRRRDRDRRRDREDEDGERDRDRRRDRDRDRDREHRRRDRDEDDESRHRRHRDEDDKDRKPRRRSRSRSPRRRD
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG nhe:NECHADRAFT_33762  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences ALSTPEGSWHTDYRDTAYIYFGGLPYELSEGDVVTIFSQFGEPVFLKLVRDKETGKSKGFGWLKYEDQRSTDLAVDNLGGAEIGGRLVRVDHARYKARDDEDPEEFKVGWEDIMKREGQALSEDESSEEEQRRPMLPEERELALLMQEHDDDDPMKGFLIEEKKKEVEEARRNADKKDRKHKHRHHRSHRSRRDDSREDRHRKSRRDETPVEGDERRHEKESRRHRDRDDDRDRRRDRDRRRDREDEDGERDRDRRRDRDRDRDREHRRRDRDEDDESRHRRHRDEDDKDRKPRRRSRSRSPRRRDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.3
4 0.29
5 0.25
6 0.22
7 0.22
8 0.17
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.09
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.21
35 0.25
36 0.26
37 0.29
38 0.3
39 0.35
40 0.44
41 0.48
42 0.45
43 0.43
44 0.38
45 0.45
46 0.46
47 0.41
48 0.35
49 0.34
50 0.37
51 0.43
52 0.47
53 0.39
54 0.37
55 0.37
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.23
60 0.18
61 0.17
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64 0.1
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66 0.05
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68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.04
75 0.07
76 0.09
77 0.13
78 0.18
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80 0.3
81 0.32
82 0.36
83 0.4
84 0.4
85 0.4
86 0.4
87 0.39
88 0.38
89 0.4
90 0.36
91 0.31
92 0.28
93 0.25
94 0.21
95 0.16
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.18
122 0.22
123 0.22
124 0.24
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.22
129 0.19
130 0.12
131 0.12
132 0.09
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.08
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.25
153 0.26
154 0.28
155 0.34
156 0.38
157 0.41
158 0.47
159 0.48
160 0.49
161 0.54
162 0.52
163 0.52
164 0.58
165 0.63
166 0.66
167 0.77
168 0.85
169 0.87
170 0.9
171 0.92
172 0.92
173 0.94
174 0.95
175 0.95
176 0.95
177 0.93
178 0.9
179 0.88
180 0.86
181 0.83
182 0.79
183 0.79
184 0.8
185 0.78
186 0.77
187 0.78
188 0.78
189 0.76
190 0.77
191 0.77
192 0.74
193 0.75
194 0.72
195 0.67
196 0.67
197 0.61
198 0.57
199 0.48
200 0.41
201 0.39
202 0.4
203 0.37
204 0.33
205 0.35
206 0.4
207 0.48
208 0.58
209 0.63
210 0.66
211 0.69
212 0.71
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214 0.78
215 0.79
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219 0.83
220 0.82
221 0.78
222 0.8
223 0.78
224 0.78
225 0.79
226 0.82
227 0.81
228 0.86
229 0.88
230 0.81
231 0.82
232 0.78
233 0.74
234 0.7
235 0.66
236 0.6
237 0.54
238 0.54
239 0.5
240 0.51
241 0.53
242 0.55
243 0.58
244 0.67
245 0.73
246 0.81
247 0.85
248 0.87
249 0.88
250 0.88
251 0.9
252 0.89
253 0.91
254 0.9
255 0.89
256 0.87
257 0.86
258 0.83
259 0.79
260 0.78
261 0.75
262 0.73
263 0.74
264 0.7
265 0.71
266 0.7
267 0.67
268 0.63
269 0.62
270 0.65
271 0.65
272 0.7
273 0.73
274 0.77
275 0.82
276 0.88
277 0.9
278 0.89
279 0.88
280 0.88
281 0.88
282 0.89
283 0.88
284 0.89
285 0.91
286 0.93
287 0.93