Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1B9HZH1

Protein Details
Accession A0A1B9HZH1    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-42SIPPSRRSKSPSRLTSSRKGKGKHydrophilic
364-388ISGANEQLKKAKKRNQESRLFLLIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-41RSKSPSRLTSSRKGKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 10.5, pero 3, mito 1, plas 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MSPIDHTSAFQSIFSDKLSSIPPSRRSKSPSRLTSSRKGKGKQGDHENEEDFLKEAYRIYEHLQSLEILIKSVRKPYLSNIEPPPLSRRNIRTHLEDVKEEDEWKRWGKVKYLTDRERDEIDLRARMILRRCKDRINIMETTEQARRSKTPSISLTRSTVLSFLPSLSPDESSSSSSSSFQPLIIAHRASIIWKLNDFLTKLTSNISNLQEERFKRKEERMKSLGSNASLEASKLTKINIVNDSRKIPEGLIINVENDNSFNLNNLNENNNKIEIGTGIGIGIINYENENPEEVKLNEKQIQEFENENNILLENMSFNLNSILNAESSLLEISKLQNELLQNLNNQNELIDKLYEDAIGSLNQISGANEQLKKAKKRNQESRLFLLIFLLGASFALLFLDWYAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.14
4 0.16
5 0.19
6 0.22
7 0.28
8 0.35
9 0.43
10 0.51
11 0.56
12 0.6
13 0.65
14 0.7
15 0.73
16 0.76
17 0.76
18 0.75
19 0.8
20 0.8
21 0.83
22 0.83
23 0.82
24 0.8
25 0.74
26 0.74
27 0.75
28 0.76
29 0.75
30 0.76
31 0.76
32 0.72
33 0.73
34 0.65
35 0.56
36 0.48
37 0.39
38 0.29
39 0.2
40 0.16
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.23
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.2
55 0.14
56 0.14
57 0.18
58 0.19
59 0.25
60 0.26
61 0.23
62 0.25
63 0.31
64 0.4
65 0.39
66 0.44
67 0.43
68 0.47
69 0.45
70 0.46
71 0.47
72 0.41
73 0.41
74 0.42
75 0.44
76 0.46
77 0.53
78 0.56
79 0.54
80 0.56
81 0.61
82 0.56
83 0.51
84 0.46
85 0.4
86 0.37
87 0.33
88 0.28
89 0.24
90 0.25
91 0.26
92 0.27
93 0.31
94 0.33
95 0.38
96 0.45
97 0.5
98 0.57
99 0.64
100 0.65
101 0.65
102 0.66
103 0.62
104 0.56
105 0.49
106 0.41
107 0.35
108 0.32
109 0.28
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.25
114 0.31
115 0.34
116 0.36
117 0.42
118 0.44
119 0.47
120 0.5
121 0.55
122 0.53
123 0.51
124 0.48
125 0.43
126 0.43
127 0.38
128 0.38
129 0.32
130 0.29
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.25
135 0.31
136 0.29
137 0.33
138 0.37
139 0.42
140 0.44
141 0.44
142 0.42
143 0.36
144 0.35
145 0.28
146 0.22
147 0.16
148 0.13
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.15
178 0.14
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.21
198 0.23
199 0.29
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.39
204 0.47
205 0.48
206 0.55
207 0.51
208 0.53
209 0.51
210 0.52
211 0.46
212 0.37
213 0.32
214 0.23
215 0.2
216 0.16
217 0.15
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.16
226 0.21
227 0.25
228 0.28
229 0.3
230 0.32
231 0.3
232 0.3
233 0.27
234 0.21
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.11
253 0.15
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.13
280 0.13
281 0.18
282 0.19
283 0.24
284 0.29
285 0.29
286 0.3
287 0.29
288 0.3
289 0.28
290 0.28
291 0.25
292 0.25
293 0.24
294 0.23
295 0.21
296 0.19
297 0.16
298 0.14
299 0.12
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.18
326 0.21
327 0.22
328 0.23
329 0.27
330 0.28
331 0.26
332 0.25
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.17
337 0.13
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.14
354 0.2
355 0.21
356 0.23
357 0.3
358 0.39
359 0.46
360 0.55
361 0.6
362 0.64
363 0.74
364 0.82
365 0.85
366 0.86
367 0.85
368 0.82
369 0.81
370 0.71
371 0.6
372 0.5
373 0.4
374 0.3
375 0.22
376 0.15
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04