Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M3R1

Protein Details
Accession A0A1C7M3R1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61TLPLKPKPIISPPPQKRQAEHydrophilic
262-282VFPTRSRTALRTRRRNRWVLGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10, cyto 7, mito 4, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MATNPQDDADRIRLKRLAKLQGAPSSSPTPAASSSSTPVPTTLPLKPKPIISPPPQKRQAEPVVTPSPVPFKKKTAAPSHLNVEDWEHETIGQVFNITLIKSVAEKSGYEIVWLKDLAAELESEGNADNADRILISRLELDSQSMTDDLEFLPVLASLPPQQTVFEYLVGCWKRLNASRAGLLKKGYPPVEVQKATDILDKIRDLVISYTGLTLQEPEMFPQPKGTGASGARALLNVFVHALRTISLHKCIVYDIDTVRNRVFPTRSRTALRTRRRNRWVLGPVVLQLCFDPSVSKSEGFASGDAWRGVISGFEALISVKAIAVVITRLPHWNPENVNAVQFERASLLGPLLGLGVFEREWPSIAKTYYANAEARPQGEITSATASLRGTLKSLQSSLFQIFNTLVRASPESREAVLQYFSHAINLNRKRAGMQVDPDTVASDCFTMNLQTILLRFCEPFMDSSYSKMDRIDTSYYAHSSRIDLDDETRINATNDEAEEWRKQNETLNAAPPNFISDIFYLTLAINHIGQQKIATNLDELARQYDELRRHLDMLNGDGSWRGTPFQARTENAINAVKYGATLTRVHLQAEQDRLTAAQLAYEAQLGDPELVFRSISFANFVSTWLIRQVDPKGLHPNPLVELPLPKEVPASFNVLPEYLVEDVVEYQLYVIRHSPNSLELSGKTEMLVWALTFLTSTWYIKNPFLKAKIVEVIFYGTLNWGEHRSVLTTILNTHPMALKHLMPALMHFYIEVEQTGASSQFYDKFSIFSVSLFLLYGLRSCSHFRSRNIAYIFKVIWDNPAHREALKNEASSNSEKFIRFVNLMINDVTYLLDESLSELAKIHEIETEMKDRETFAAQSVQYRREREQALRSLERHASGYVQLGNSTVNLLKVFTGETKAPFMVPEIVDRLAAMLDYNLEALVGPRCQELKVSNPEKFKFDPKRLLSDIIQVFLNLSDQEEFARAVAGDGRSYRKELFEEAAKIAQRKVLKSDAEIEELHLFVLKVEEAKATLEAEEDLGEIPDEFLDPLMYTLMRDPVTLPSSRAVVDRATIKSHLLSDTKDPFNRVPLTLEDVVPNIELKQQIDSFVAERRGKKAALDKPAEDVVKMDISTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.51
3 0.55
4 0.56
5 0.54
6 0.6
7 0.61
8 0.64
9 0.66
10 0.59
11 0.55
12 0.49
13 0.43
14 0.38
15 0.31
16 0.26
17 0.23
18 0.25
19 0.23
20 0.22
21 0.25
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.25
26 0.23
27 0.25
28 0.27
29 0.31
30 0.35
31 0.38
32 0.44
33 0.46
34 0.49
35 0.51
36 0.55
37 0.58
38 0.58
39 0.65
40 0.68
41 0.76
42 0.81
43 0.77
44 0.72
45 0.72
46 0.72
47 0.69
48 0.62
49 0.6
50 0.56
51 0.53
52 0.5
53 0.43
54 0.43
55 0.41
56 0.44
57 0.4
58 0.41
59 0.47
60 0.52
61 0.59
62 0.59
63 0.62
64 0.63
65 0.64
66 0.66
67 0.61
68 0.56
69 0.47
70 0.41
71 0.36
72 0.33
73 0.28
74 0.21
75 0.18
76 0.19
77 0.2
78 0.17
79 0.14
80 0.11
81 0.1
82 0.11
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.17
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.26
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.21
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.11
106 0.11
107 0.08
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.12
132 0.12
133 0.09
134 0.1
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.18
152 0.17
153 0.16
154 0.15
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.24
161 0.3
162 0.33
163 0.31
164 0.33
165 0.39
166 0.45
167 0.47
168 0.43
169 0.38
170 0.39
171 0.38
172 0.41
173 0.35
174 0.3
175 0.32
176 0.37
177 0.45
178 0.41
179 0.38
180 0.35
181 0.36
182 0.35
183 0.36
184 0.28
185 0.22
186 0.25
187 0.23
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.2
206 0.22
207 0.22
208 0.24
209 0.24
210 0.23
211 0.25
212 0.23
213 0.22
214 0.21
215 0.24
216 0.22
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.17
221 0.13
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.09
231 0.13
232 0.15
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.19
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.24
243 0.25
244 0.27
245 0.27
246 0.28
247 0.27
248 0.29
249 0.32
250 0.29
251 0.36
252 0.4
253 0.44
254 0.46
255 0.49
256 0.55
257 0.61
258 0.65
259 0.68
260 0.7
261 0.76
262 0.81
263 0.83
264 0.76
265 0.76
266 0.72
267 0.65
268 0.6
269 0.5
270 0.45
271 0.39
272 0.35
273 0.25
274 0.19
275 0.16
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.13
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.16
285 0.18
286 0.18
287 0.17
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.15
292 0.13
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.16
318 0.18
319 0.22
320 0.23
321 0.26
322 0.31
323 0.29
324 0.3
325 0.26
326 0.25
327 0.21
328 0.2
329 0.16
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.18
356 0.2
357 0.18
358 0.15
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.19
363 0.17
364 0.14
365 0.14
366 0.14
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.14
379 0.14
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.15
387 0.14
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.15
411 0.23
412 0.28
413 0.31
414 0.3
415 0.3
416 0.3
417 0.31
418 0.34
419 0.28
420 0.27
421 0.26
422 0.27
423 0.27
424 0.26
425 0.23
426 0.18
427 0.15
428 0.11
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.12
448 0.16
449 0.15
450 0.17
451 0.21
452 0.21
453 0.21
454 0.2
455 0.19
456 0.15
457 0.19
458 0.19
459 0.16
460 0.17
461 0.18
462 0.19
463 0.19
464 0.18
465 0.15
466 0.13
467 0.14
468 0.13
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.15
473 0.14
474 0.14
475 0.13
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.09
484 0.11
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.18
491 0.2
492 0.22
493 0.22
494 0.26
495 0.27
496 0.27
497 0.26
498 0.22
499 0.2
500 0.16
501 0.14
502 0.11
503 0.08
504 0.1
505 0.1
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.08
514 0.1
515 0.1
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.13
521 0.11
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.13
532 0.15
533 0.17
534 0.19
535 0.18
536 0.2
537 0.21
538 0.22
539 0.18
540 0.16
541 0.15
542 0.12
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.08
551 0.1
552 0.15
553 0.18
554 0.19
555 0.22
556 0.24
557 0.24
558 0.24
559 0.24
560 0.19
561 0.15
562 0.14
563 0.11
564 0.08
565 0.08
566 0.06
567 0.07
568 0.08
569 0.09
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.17
574 0.18
575 0.19
576 0.22
577 0.21
578 0.16
579 0.15
580 0.15
581 0.13
582 0.13
583 0.09
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.05
598 0.05
599 0.04
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.09
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.11
613 0.1
614 0.12
615 0.14
616 0.19
617 0.2
618 0.22
619 0.29
620 0.28
621 0.32
622 0.3
623 0.29
624 0.23
625 0.23
626 0.21
627 0.13
628 0.14
629 0.13
630 0.16
631 0.15
632 0.13
633 0.14
634 0.13
635 0.15
636 0.14
637 0.18
638 0.15
639 0.16
640 0.16
641 0.15
642 0.15
643 0.13
644 0.14
645 0.08
646 0.08
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.04
653 0.04
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.09
658 0.11
659 0.12
660 0.13
661 0.13
662 0.13
663 0.16
664 0.16
665 0.15
666 0.13
667 0.17
668 0.17
669 0.17
670 0.14
671 0.12
672 0.11
673 0.1
674 0.1
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.09
685 0.12
686 0.15
687 0.18
688 0.22
689 0.23
690 0.27
691 0.29
692 0.31
693 0.29
694 0.3
695 0.31
696 0.27
697 0.24
698 0.19
699 0.18
700 0.15
701 0.14
702 0.11
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.1
713 0.12
714 0.11
715 0.1
716 0.12
717 0.13
718 0.15
719 0.13
720 0.13
721 0.14
722 0.14
723 0.17
724 0.17
725 0.16
726 0.15
727 0.16
728 0.16
729 0.13
730 0.14
731 0.15
732 0.13
733 0.12
734 0.11
735 0.1
736 0.1
737 0.11
738 0.1
739 0.06
740 0.05
741 0.06
742 0.06
743 0.06
744 0.05
745 0.06
746 0.07
747 0.1
748 0.12
749 0.14
750 0.13
751 0.14
752 0.15
753 0.17
754 0.16
755 0.12
756 0.12
757 0.1
758 0.1
759 0.1
760 0.09
761 0.07
762 0.07
763 0.08
764 0.07
765 0.08
766 0.1
767 0.12
768 0.17
769 0.26
770 0.32
771 0.34
772 0.41
773 0.42
774 0.48
775 0.49
776 0.47
777 0.4
778 0.37
779 0.35
780 0.28
781 0.27
782 0.2
783 0.22
784 0.21
785 0.22
786 0.22
787 0.24
788 0.23
789 0.22
790 0.26
791 0.22
792 0.27
793 0.28
794 0.26
795 0.24
796 0.25
797 0.28
798 0.28
799 0.28
800 0.23
801 0.23
802 0.23
803 0.22
804 0.23
805 0.23
806 0.2
807 0.2
808 0.23
809 0.2
810 0.21
811 0.21
812 0.18
813 0.15
814 0.14
815 0.13
816 0.08
817 0.07
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.06
822 0.07
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.08
827 0.1
828 0.1
829 0.09
830 0.09
831 0.11
832 0.14
833 0.17
834 0.21
835 0.2
836 0.2
837 0.2
838 0.2
839 0.2
840 0.19
841 0.17
842 0.14
843 0.18
844 0.18
845 0.25
846 0.29
847 0.34
848 0.36
849 0.4
850 0.4
851 0.42
852 0.46
853 0.45
854 0.49
855 0.5
856 0.53
857 0.55
858 0.53
859 0.51
860 0.5
861 0.45
862 0.38
863 0.31
864 0.24
865 0.19
866 0.21
867 0.18
868 0.16
869 0.15
870 0.14
871 0.13
872 0.12
873 0.13
874 0.1
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.09
880 0.1
881 0.1
882 0.13
883 0.13
884 0.15
885 0.17
886 0.17
887 0.17
888 0.16
889 0.17
890 0.18
891 0.17
892 0.17
893 0.18
894 0.18
895 0.17
896 0.17
897 0.15
898 0.1
899 0.1
900 0.07
901 0.05
902 0.05
903 0.05
904 0.06
905 0.05
906 0.05
907 0.05
908 0.06
909 0.08
910 0.08
911 0.09
912 0.11
913 0.12
914 0.12
915 0.15
916 0.17
917 0.23
918 0.33
919 0.38
920 0.42
921 0.49
922 0.51
923 0.53
924 0.54
925 0.56
926 0.55
927 0.57
928 0.62
929 0.59
930 0.65
931 0.62
932 0.64
933 0.55
934 0.54
935 0.47
936 0.38
937 0.34
938 0.26
939 0.23
940 0.18
941 0.18
942 0.09
943 0.09
944 0.08
945 0.09
946 0.1
947 0.1
948 0.1
949 0.09
950 0.1
951 0.09
952 0.08
953 0.12
954 0.12
955 0.13
956 0.16
957 0.21
958 0.22
959 0.25
960 0.26
961 0.25
962 0.26
963 0.27
964 0.29
965 0.3
966 0.31
967 0.31
968 0.34
969 0.34
970 0.33
971 0.31
972 0.32
973 0.3
974 0.29
975 0.32
976 0.34
977 0.33
978 0.34
979 0.41
980 0.39
981 0.39
982 0.36
983 0.34
984 0.28
985 0.26
986 0.23
987 0.16
988 0.13
989 0.1
990 0.11
991 0.09
992 0.08
993 0.09
994 0.1
995 0.1
996 0.11
997 0.12
998 0.11
999 0.11
1000 0.11
1001 0.1
1002 0.1
1003 0.09
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.07
1007 0.07
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.06
1011 0.07
1012 0.06
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.07
1017 0.08
1018 0.08
1019 0.08
1020 0.1
1021 0.15
1022 0.14
1023 0.15
1024 0.16
1025 0.2
1026 0.24
1027 0.24
1028 0.24
1029 0.22
1030 0.23
1031 0.24
1032 0.24
1033 0.19
1034 0.17
1035 0.2
1036 0.24
1037 0.24
1038 0.26
1039 0.26
1040 0.27
1041 0.27
1042 0.28
1043 0.29
1044 0.26
1045 0.26
1046 0.31
1047 0.37
1048 0.43
1049 0.44
1050 0.46
1051 0.43
1052 0.48
1053 0.48
1054 0.42
1055 0.37
1056 0.33
1057 0.38
1058 0.35
1059 0.34
1060 0.28
1061 0.26
1062 0.25
1063 0.22
1064 0.2
1065 0.13
1066 0.15
1067 0.16
1068 0.15
1069 0.2
1070 0.2
1071 0.21
1072 0.22
1073 0.23
1074 0.22
1075 0.26
1076 0.34
1077 0.34
1078 0.36
1079 0.38
1080 0.42
1081 0.4
1082 0.44
1083 0.47
1084 0.47
1085 0.51
1086 0.55
1087 0.52
1088 0.52
1089 0.58
1090 0.52
1091 0.43
1092 0.36
1093 0.29
1094 0.26