Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7LS04

Protein Details
Accession A0A1C7LS04    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-419DLTSIVKKKKKAPEANGAVKRKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-418KKKKKAPEANGAVKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.666, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MPITLSTAPPSPRFALTTAAMSNRSNETSANPAVSIEDALEHAKRAFALRKYEQAVDHYATALELMTKKHGENAPETADLYFSYGKALLENAIAQSSVLGKEQPEDAEHATAGDGKDTSSGGAFLSFSGDADDEAEELVPGSKEDVPVDLFAEAAKAVDEMDEAEEDEDEDEEAEPEDDFNAAWEVLDLARALYEKQQDEDDQVKLKLADTYIALGDVSLETEKFDQAITDYTAGLALKNELLPLSSRQIAEAHYKLSIVLDLTSGRLRDAITHAERALESVEARVAELRDALSGQGLVQAGAHEEKADAKGKGKAKQSKLVAEDAIQKMSRSQMESEEKELLGLREDLALKVEELKVTPNEPVESAPALVARALDSELNAPTQSPSGAFSSTVVHDLTSIVKKKKKAPEANGAVKRKAEDEGGESPSEKKVKVTDAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.28
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.28
8 0.27
9 0.28
10 0.27
11 0.27
12 0.24
13 0.22
14 0.22
15 0.26
16 0.27
17 0.25
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.17
33 0.23
34 0.26
35 0.35
36 0.38
37 0.45
38 0.48
39 0.51
40 0.48
41 0.45
42 0.44
43 0.38
44 0.34
45 0.27
46 0.23
47 0.19
48 0.17
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.24
57 0.27
58 0.27
59 0.29
60 0.33
61 0.32
62 0.31
63 0.32
64 0.25
65 0.23
66 0.19
67 0.19
68 0.15
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.08
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.18
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.06
231 0.08
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.11
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.16
266 0.1
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.1
295 0.14
296 0.14
297 0.16
298 0.23
299 0.28
300 0.34
301 0.42
302 0.48
303 0.5
304 0.57
305 0.59
306 0.58
307 0.56
308 0.53
309 0.44
310 0.38
311 0.41
312 0.34
313 0.33
314 0.27
315 0.24
316 0.22
317 0.25
318 0.25
319 0.19
320 0.19
321 0.24
322 0.32
323 0.34
324 0.36
325 0.35
326 0.32
327 0.3
328 0.3
329 0.22
330 0.17
331 0.15
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.12
339 0.14
340 0.15
341 0.12
342 0.12
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.1
373 0.12
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.15
382 0.13
383 0.12
384 0.13
385 0.17
386 0.22
387 0.28
388 0.34
389 0.4
390 0.46
391 0.55
392 0.64
393 0.7
394 0.73
395 0.74
396 0.77
397 0.82
398 0.87
399 0.87
400 0.83
401 0.75
402 0.67
403 0.6
404 0.51
405 0.43
406 0.35
407 0.28
408 0.28
409 0.3
410 0.31
411 0.31
412 0.3
413 0.3
414 0.34
415 0.34
416 0.29
417 0.26
418 0.28
419 0.33