FuNGI

A0A1C7LTM4

Protein Details

Accession

A0A1C7LTM4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-107	GVAPRAKMNQQRSRRFRTAKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
99-111	SRRFRTAKEAKEV

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 10, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPKFFRYISERYPLTSQLIQENKIPEFDNLYIDFNGIIHNCSHPNDADAHFRLSEEQIFTSIFAYVDHLFGKIKPKKLFFMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAKEAKEVREKAEQKGEKLPDEKAFDSNCITPGTEFMAKLSQQLRYFVNKKISEDSNWRDVTVVLAQPDHDPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVKFGPASKSKGNKSLESINFYLLHLTLMREYLDLEFHDIEPVLPFEYNLEHVIDDFIILAVFVGNDFLPNLPDLHIHENGLEKLFDVYKKALPSLDGYINEGGTINTKRLQVILDEMAEWEQEIFEKEYSDLNWYKGKQAKHVKEMEQARKRAKFVLTKSQREIFDQVKAFVLARRNLTAIEHAGRSPLTMPNSFPARDRQFIAKLAEDLHLSLAWDEYDEQDQNLVTWRFPDEDDEESRAAVDRVLNKYEKAKVMEDDKEGDFDRRYEMSLKDKMDEWKRTYYKGKLEISYDDPQQMGDLIYRYIEGMQWVMHYYYSGVASWSWFYNYHYAPRISDLKGVDKMTFDFDLGTPFRPFEQLMGVLPEASKELIPLAYRDLMYDPNSPILDFYPLEFEQDLNGKKQDWEAIVKIPFIDEKRLLKAMRGVISTSKEPVVEPLLIHSSRTSSY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.44
3	0.43
4	0.4
5	0.36
6	0.36
7	0.4
8	0.38
9	0.4
10	0.41
11	0.37
12	0.36
13	0.35
14	0.28
15	0.28
16	0.28
17	0.28
18	0.25
19	0.27
20	0.25
21	0.23
22	0.22
23	0.16
24	0.18
25	0.14
26	0.14
27	0.12
28	0.15
29	0.17
30	0.2
31	0.23
32	0.2
33	0.21
34	0.24
35	0.26
36	0.31
37	0.3
38	0.31
39	0.28
40	0.28
41	0.29
42	0.27
43	0.28
44	0.22
45	0.21
46	0.19
47	0.19
48	0.19
49	0.17
50	0.15
51	0.11
52	0.09
53	0.12
54	0.11
55	0.12
56	0.12
57	0.13
58	0.13
59	0.15
60	0.26
61	0.29
62	0.36
63	0.42
64	0.45
65	0.5
66	0.53
67	0.58
68	0.49
69	0.5
70	0.44
71	0.38
72	0.36
73	0.31
74	0.28
75	0.21
76	0.2
77	0.12
78	0.13
79	0.19
80	0.26
81	0.36
82	0.44
83	0.54
84	0.65
85	0.73
86	0.79
87	0.83
88	0.82
89	0.77
90	0.79
91	0.79
92	0.76
93	0.78
94	0.75
95	0.7
96	0.74
97	0.71
98	0.64
99	0.63
100	0.59
101	0.54
102	0.57
103	0.55
104	0.48
105	0.55
106	0.54
107	0.49
108	0.49
109	0.47
110	0.43
111	0.45
112	0.43
113	0.39
114	0.36
115	0.33
116	0.33
117	0.3
118	0.26
119	0.22
120	0.21
121	0.16
122	0.16
123	0.19
124	0.18
125	0.16
126	0.16
127	0.19
128	0.18
129	0.23
130	0.24
131	0.25
132	0.24
133	0.27
134	0.29
135	0.34
136	0.37
137	0.38
138	0.45
139	0.42
140	0.43
141	0.46
142	0.46
143	0.42
144	0.48
145	0.47
146	0.46
147	0.44
148	0.41
149	0.35
150	0.32
151	0.3
152	0.25
153	0.21
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.16
158	0.18
159	0.17
160	0.16
161	0.16
162	0.17
163	0.26
164	0.26
165	0.23
166	0.22
167	0.22
168	0.21
169	0.21
170	0.19
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.09
176	0.07
177	0.04
178	0.03
179	0.02
180	0.03
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.07
186	0.09
187	0.09
188	0.12
189	0.13
190	0.19
191	0.2
192	0.23
193	0.22
194	0.22
195	0.23
196	0.21
197	0.25
198	0.22
199	0.25
200	0.28
201	0.35
202	0.36
203	0.44
204	0.46
205	0.42
206	0.42
207	0.48
208	0.44
209	0.43
210	0.4
211	0.34
212	0.32
213	0.3
214	0.26
215	0.17
216	0.15
217	0.1
218	0.1
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.05
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.02
255	0.02
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.09
267	0.13
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.15
272	0.15
273	0.15
274	0.12
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.09
279	0.1
280	0.11
281	0.13
282	0.14
283	0.14
284	0.13
285	0.13
286	0.15
287	0.16
288	0.17
289	0.14
290	0.16
291	0.15
292	0.15
293	0.14
294	0.12
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.1
305	0.12
306	0.12
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.05
314	0.03
315	0.03
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.09
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.17
327	0.17
328	0.22
329	0.26
330	0.27
331	0.31
332	0.4
333	0.43
334	0.47
335	0.52
336	0.48
337	0.51
338	0.59
339	0.6
340	0.57
341	0.57
342	0.56
343	0.54
344	0.53
345	0.5
346	0.46
347	0.43
348	0.41
349	0.46
350	0.49
351	0.5
352	0.52
353	0.54
354	0.5
355	0.45
356	0.45
357	0.35
358	0.33
359	0.29
360	0.26
361	0.21
362	0.21
363	0.18
364	0.17
365	0.2
366	0.17
367	0.18
368	0.18
369	0.18
370	0.18
371	0.18
372	0.17
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.12
377	0.13
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.18
386	0.21
387	0.21
388	0.21
389	0.26
390	0.27
391	0.29
392	0.3
393	0.31
394	0.3
395	0.33
396	0.34
397	0.27
398	0.23
399	0.22
400	0.21
401	0.17
402	0.15
403	0.12
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.08
413	0.09
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.14
419	0.13
420	0.11
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.14
425	0.17
426	0.15
427	0.18
428	0.21
429	0.22
430	0.21
431	0.2
432	0.2
433	0.17
434	0.14
435	0.12
436	0.12
437	0.14
438	0.18
439	0.22
440	0.22
441	0.23
442	0.27
443	0.31
444	0.32
445	0.3
446	0.29
447	0.28
448	0.33
449	0.35
450	0.33
451	0.32
452	0.28
453	0.27
454	0.26
455	0.25
456	0.21
457	0.17
458	0.19
459	0.16
460	0.17
461	0.18
462	0.21
463	0.25
464	0.3
465	0.31
466	0.28
467	0.31
468	0.37
469	0.43
470	0.47
471	0.44
472	0.49
473	0.49
474	0.54
475	0.57
476	0.56
477	0.55
478	0.57
479	0.58
480	0.5
481	0.51
482	0.49
483	0.48
484	0.46
485	0.39
486	0.32
487	0.27
488	0.24
489	0.21
490	0.18
491	0.12
492	0.1
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.1
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.1
515	0.11
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.14
520	0.2
521	0.22
522	0.26
523	0.3
524	0.3
525	0.29
526	0.34
527	0.37
528	0.32
529	0.35
530	0.31
531	0.32
532	0.35
533	0.36
534	0.31
535	0.28
536	0.27
537	0.26
538	0.24
539	0.19
540	0.16
541	0.14
542	0.19
543	0.19
544	0.21
545	0.18
546	0.18
547	0.19
548	0.19
549	0.19
550	0.15
551	0.17
552	0.16
553	0.16
554	0.19
555	0.18
556	0.17
557	0.16
558	0.16
559	0.12
560	0.12
561	0.1
562	0.07
563	0.08
564	0.1
565	0.11
566	0.12
567	0.14
568	0.17
569	0.17
570	0.18
571	0.18
572	0.2
573	0.23
574	0.26
575	0.24
576	0.25
577	0.26
578	0.24
579	0.23
580	0.21
581	0.22
582	0.18
583	0.17
584	0.19
585	0.19
586	0.21
587	0.2
588	0.19
589	0.18
590	0.25
591	0.26
592	0.24
593	0.26
594	0.24
595	0.26
596	0.28
597	0.3
598	0.27
599	0.3
600	0.29
601	0.34
602	0.35
603	0.34
604	0.32
605	0.28
606	0.29
607	0.26
608	0.3
609	0.29
610	0.32
611	0.37
612	0.43
613	0.42
614	0.4
615	0.45
616	0.45
617	0.44
618	0.41
619	0.38
620	0.37
621	0.42
622	0.41
623	0.37
624	0.32
625	0.27
626	0.26
627	0.27
628	0.26
629	0.22
630	0.2
631	0.21
632	0.27
633	0.27
634	0.27
635	0.24

A0A1C7LTM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer