Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7Z5M4

Protein Details
Accession C7Z5M4    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-129KGEASAKPSKSNKKKASAKKSSSSEHydrophilic
387-414LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-124AKPSKSNKKKASAKK
393-406KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG nhe:NECHADRAFT_99421  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSGSKQNPPSWLFSNNPLNPVKPSADTMGKKSNKAAAAKSDDTASASVPPPGQLMDLVESFLSDHAFKGAHDAFKKQREKKGWLATGAETSASLVSVFQTWEASKGEASAKPSKSNKKKASAKKSSSSEDSDSSDDGEDVDMKDADSSSESSSSSSESEDEAPKPKATKNLKRKAPVDDSSSESSSDSESDSSSSDSDSDDDEPRAKKQKRDQSSSSESDSSSSESESDSDSDSDDENAESDSDSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSDSDSDDEADAETAAQVPLPDSDGSSSSSDSSDSDSDSDTKKGKKGKEVKDSSDSSVTLDGKESPEAETDSTNPPLPPDPILNNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDPKFASNEYVPITYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISEKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.49
3 0.52
4 0.49
5 0.47
6 0.45
7 0.46
8 0.41
9 0.32
10 0.33
11 0.32
12 0.39
13 0.4
14 0.42
15 0.48
16 0.49
17 0.49
18 0.5
19 0.51
20 0.48
21 0.49
22 0.48
23 0.46
24 0.5
25 0.5
26 0.47
27 0.42
28 0.36
29 0.33
30 0.29
31 0.21
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.16
56 0.19
57 0.24
58 0.25
59 0.32
60 0.38
61 0.48
62 0.58
63 0.58
64 0.63
65 0.65
66 0.71
67 0.74
68 0.76
69 0.72
70 0.65
71 0.61
72 0.53
73 0.48
74 0.41
75 0.31
76 0.2
77 0.16
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.13
93 0.16
94 0.17
95 0.22
96 0.28
97 0.29
98 0.36
99 0.44
100 0.53
101 0.59
102 0.68
103 0.71
104 0.73
105 0.81
106 0.84
107 0.87
108 0.87
109 0.84
110 0.82
111 0.79
112 0.74
113 0.68
114 0.62
115 0.54
116 0.46
117 0.41
118 0.34
119 0.29
120 0.25
121 0.2
122 0.15
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.12
146 0.14
147 0.15
148 0.18
149 0.2
150 0.2
151 0.22
152 0.22
153 0.29
154 0.36
155 0.45
156 0.52
157 0.6
158 0.66
159 0.71
160 0.72
161 0.71
162 0.68
163 0.62
164 0.56
165 0.48
166 0.46
167 0.41
168 0.39
169 0.31
170 0.24
171 0.21
172 0.16
173 0.14
174 0.1
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.14
190 0.15
191 0.18
192 0.27
193 0.29
194 0.33
195 0.41
196 0.5
197 0.55
198 0.61
199 0.61
200 0.6
201 0.64
202 0.6
203 0.54
204 0.45
205 0.37
206 0.31
207 0.27
208 0.21
209 0.14
210 0.11
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.18
289 0.2
290 0.22
291 0.27
292 0.33
293 0.36
294 0.44
295 0.52
296 0.59
297 0.65
298 0.69
299 0.7
300 0.71
301 0.69
302 0.63
303 0.55
304 0.46
305 0.36
306 0.34
307 0.28
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.12
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.15
320 0.18
321 0.2
322 0.21
323 0.19
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.21
328 0.21
329 0.22
330 0.28
331 0.35
332 0.41
333 0.47
334 0.52
335 0.58
336 0.58
337 0.6
338 0.62
339 0.66
340 0.67
341 0.66
342 0.7
343 0.71
344 0.76
345 0.77
346 0.75
347 0.72
348 0.71
349 0.71
350 0.71
351 0.66
352 0.63
353 0.6
354 0.6
355 0.55
356 0.49
357 0.47
358 0.38
359 0.37
360 0.33
361 0.31
362 0.25
363 0.24
364 0.26
365 0.25
366 0.26
367 0.25
368 0.27
369 0.28
370 0.3
371 0.29
372 0.28
373 0.27
374 0.31
375 0.32
376 0.28
377 0.27
378 0.3
379 0.3
380 0.35
381 0.37
382 0.4
383 0.48
384 0.59
385 0.67
386 0.74
387 0.82
388 0.83
389 0.9
390 0.91
391 0.9
392 0.9
393 0.88
394 0.86
395 0.84
396 0.78
397 0.67
398 0.57
399 0.55
400 0.48
401 0.43
402 0.36
403 0.27
404 0.25