Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MBY1

Protein Details
Accession A0A1C7MBY1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-74ILFDKLQNEKKPEKRRKMLGNWFNRWRKEHydrophilic
394-416GLSLLHKSLKFRKRNLRACLQEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-62KPEKRRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044125  Adenylation_DNA_ligase_IV  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07903  Adenylation_DNA_ligase_IV  
Amino Acid Sequences MMQPTPAPSSPPSSPTVPAVVSEDHPIVYPEPPKNVGNTPFRVLAILFDKLQNEKKPEKRRKMLGNWFNRWRKEEGYDLYPVLRLILPYKDRERTVYGLKEKNIAKDYIKIIPLSRNDPDAIRLLNWKRPTEREKASGDFPSVLYEVISKRSSVVEGSLTIHELNDILDELAKSSGKSHIQSQILRRVYNRSTPEEQRWIIRIILKDMIIAVKETTVFSVFHPDAHDLFNTCSDLKKVAWELWNPDRRLNDEDKAVQLFRAFAPMLCKRPTRGIDGSVKEMQGRTFIIEEKLDGERMQLHKQGNEYFYCSRKGKDYTYLYGKHVGIGSLTPFIDDAFDSRVDEIILDGEMLVWDPVSETNLPFGSLKTFALDKSKGEHNPRPCFKVFDLLYLNGLSLLHKSLKFRKRNLRACLQEVPGRIEFVSETEGTTAQMCANVWMSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.34
4 0.28
5 0.26
6 0.26
7 0.24
8 0.23
9 0.24
10 0.22
11 0.19
12 0.19
13 0.19
14 0.17
15 0.2
16 0.25
17 0.25
18 0.3
19 0.33
20 0.34
21 0.37
22 0.42
23 0.45
24 0.46
25 0.46
26 0.46
27 0.44
28 0.43
29 0.39
30 0.32
31 0.29
32 0.25
33 0.23
34 0.2
35 0.2
36 0.22
37 0.26
38 0.33
39 0.35
40 0.39
41 0.46
42 0.55
43 0.64
44 0.73
45 0.79
46 0.81
47 0.84
48 0.87
49 0.88
50 0.89
51 0.88
52 0.87
53 0.86
54 0.87
55 0.85
56 0.8
57 0.73
58 0.66
59 0.6
60 0.54
61 0.53
62 0.47
63 0.43
64 0.42
65 0.38
66 0.35
67 0.31
68 0.27
69 0.21
70 0.16
71 0.13
72 0.12
73 0.19
74 0.21
75 0.26
76 0.32
77 0.36
78 0.36
79 0.4
80 0.42
81 0.39
82 0.43
83 0.46
84 0.48
85 0.49
86 0.48
87 0.52
88 0.5
89 0.52
90 0.48
91 0.42
92 0.35
93 0.36
94 0.38
95 0.36
96 0.35
97 0.3
98 0.29
99 0.32
100 0.34
101 0.33
102 0.31
103 0.28
104 0.27
105 0.26
106 0.27
107 0.23
108 0.2
109 0.17
110 0.23
111 0.25
112 0.3
113 0.34
114 0.36
115 0.37
116 0.44
117 0.48
118 0.48
119 0.5
120 0.5
121 0.5
122 0.49
123 0.49
124 0.43
125 0.39
126 0.32
127 0.27
128 0.23
129 0.18
130 0.15
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.14
135 0.14
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.18
166 0.24
167 0.28
168 0.32
169 0.35
170 0.4
171 0.4
172 0.4
173 0.37
174 0.36
175 0.35
176 0.38
177 0.37
178 0.34
179 0.37
180 0.4
181 0.44
182 0.44
183 0.42
184 0.38
185 0.36
186 0.31
187 0.27
188 0.26
189 0.22
190 0.19
191 0.2
192 0.17
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.09
197 0.09
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.11
224 0.12
225 0.14
226 0.17
227 0.18
228 0.23
229 0.3
230 0.37
231 0.35
232 0.37
233 0.35
234 0.34
235 0.38
236 0.36
237 0.3
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.26
242 0.23
243 0.18
244 0.14
245 0.13
246 0.1
247 0.12
248 0.1
249 0.09
250 0.15
251 0.19
252 0.23
253 0.25
254 0.26
255 0.25
256 0.32
257 0.34
258 0.35
259 0.33
260 0.35
261 0.39
262 0.41
263 0.44
264 0.38
265 0.36
266 0.3
267 0.29
268 0.23
269 0.17
270 0.15
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.15
283 0.18
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.25
288 0.29
289 0.32
290 0.29
291 0.28
292 0.29
293 0.28
294 0.29
295 0.33
296 0.31
297 0.29
298 0.32
299 0.35
300 0.33
301 0.39
302 0.42
303 0.42
304 0.48
305 0.5
306 0.46
307 0.48
308 0.45
309 0.37
310 0.33
311 0.26
312 0.19
313 0.17
314 0.16
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.05
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.15
357 0.21
358 0.22
359 0.21
360 0.24
361 0.31
362 0.36
363 0.44
364 0.5
365 0.54
366 0.63
367 0.67
368 0.69
369 0.63
370 0.62
371 0.55
372 0.57
373 0.48
374 0.45
375 0.43
376 0.38
377 0.38
378 0.32
379 0.3
380 0.21
381 0.2
382 0.13
383 0.1
384 0.12
385 0.15
386 0.17
387 0.24
388 0.33
389 0.43
390 0.51
391 0.6
392 0.68
393 0.74
394 0.82
395 0.84
396 0.84
397 0.82
398 0.8
399 0.77
400 0.71
401 0.66
402 0.59
403 0.57
404 0.47
405 0.41
406 0.34
407 0.28
408 0.23
409 0.2
410 0.21
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.1
419 0.12
420 0.11
421 0.12