Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M0W0

Protein Details
Accession A0A1C7M0W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-247RSRSHAPPRTRRSRHARWRRLSLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-242APPRTRRSRHARWR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, cyto 4.5, extr 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011583  Chitinase_II  
IPR029070  Chitinase_insertion_sf  
IPR001223  Glyco_hydro18_cat  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
Gene Ontology GO:0008061  F:chitin binding  
GO:0004568  F:chitinase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00704  Glyco_hydro_18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51910  GH18_2  
Amino Acid Sequences MAYYPDWAAPAFPPEKIDFGRFDWIDYAFAVPDENFNLTWDGSDDAPNLLARLVSAAHGKGKNVKLSVGGWTGSKFFSPAVSSEQSRQTFVANILDVYKHPNDTANFLAFLQLLRATLPPTAKITAATLTVPFADDAGNPLADASAFAQVLDWVLLMNYDAWGSSSSPGPNAPLSDGCYNSTQDSANAFSAMQAWTAAGFPASKLVLGVPSYGYISRSSATLLRSRSHAPPRTRRSRHARWRRLSLLQWTDALVPAPGPLLPPPVLATSEDGGTDSGQVQFSELVQQGVLQSTPDAARTIVQGTELHSLYAGWSGFTRYWDACSSTPYLRSAAAGQVVTYDDPMSLGMKAVFAREAGMRGVNMFDVHGDTDAWDLTDALRRGLGVIWRIDWLGDGGAGANVHFWAFSCRCGRECRILRKFDN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.28
3 0.3
4 0.32
5 0.28
6 0.29
7 0.38
8 0.34
9 0.33
10 0.31
11 0.29
12 0.26
13 0.24
14 0.22
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.11
43 0.12
44 0.19
45 0.21
46 0.23
47 0.3
48 0.34
49 0.38
50 0.36
51 0.36
52 0.31
53 0.31
54 0.34
55 0.28
56 0.24
57 0.19
58 0.2
59 0.2
60 0.18
61 0.17
62 0.13
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.18
68 0.21
69 0.23
70 0.26
71 0.34
72 0.33
73 0.34
74 0.32
75 0.27
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.18
85 0.18
86 0.15
87 0.15
88 0.2
89 0.2
90 0.23
91 0.26
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.15
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.05
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.12
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.19
212 0.22
213 0.27
214 0.34
215 0.4
216 0.44
217 0.52
218 0.61
219 0.69
220 0.71
221 0.73
222 0.74
223 0.77
224 0.8
225 0.81
226 0.82
227 0.78
228 0.81
229 0.77
230 0.73
231 0.65
232 0.63
233 0.55
234 0.46
235 0.4
236 0.33
237 0.28
238 0.23
239 0.2
240 0.11
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.06
278 0.05
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.14
298 0.11
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.11
303 0.13
304 0.16
305 0.13
306 0.16
307 0.18
308 0.21
309 0.19
310 0.21
311 0.24
312 0.24
313 0.26
314 0.24
315 0.23
316 0.2
317 0.21
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.07
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.11
349 0.11
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.07
362 0.08
363 0.15
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.15
369 0.18
370 0.21
371 0.18
372 0.19
373 0.19
374 0.2
375 0.2
376 0.19
377 0.17
378 0.14
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.13
392 0.14
393 0.21
394 0.26
395 0.29
396 0.33
397 0.4
398 0.46
399 0.49
400 0.57
401 0.63
402 0.66