Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MSZ0

Protein Details
Accession A0A1C7MSZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-176SLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-166KKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, nucl 9, cyto 8.5, cysk 8, mito_nucl 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDVGEGSSQGAAQDAREDTIQAGNTLLLKVPSGDIRTLKLEKDSTVNLGKFGTFYSNELIGRSYGSTYEIVEKRLKVIPPRPMQEVGDTDATNELINDGEYVQPLTVEEIEVLKRSGLHASVSVLALFKSIPNLYTVSGNYQKQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTVIEPTLFNVCEYWFNKDQNRLRDIRPDALSQMLNLANIRPGGRYLAVDEASGVVVAGVLERLGGSGRLITICDIDSPPAYPVMTQMNFKKEVIASTLSSLNWATADEDTTHRVRLIPPIQRKTDIFPVLAPSDPPSGKFKSDGQRSRLSKRKAASDALLQTREELFAGEFDGLIIATEYDPYSILEKLTPYLGGSASIVVHGPNVQVVTELQCRVRDLPQYLGPTVTEMWLRCYQVLPGRTHPMMNASGSGGFIFHAIKVYAGCSLSSVKFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.19
7 0.19
8 0.15
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.13
18 0.15
19 0.17
20 0.21
21 0.21
22 0.24
23 0.3
24 0.32
25 0.31
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.33
30 0.32
31 0.31
32 0.36
33 0.35
34 0.3
35 0.29
36 0.28
37 0.23
38 0.22
39 0.21
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.17
48 0.17
49 0.16
50 0.13
51 0.1
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.21
56 0.21
57 0.24
58 0.28
59 0.28
60 0.29
61 0.34
62 0.37
63 0.36
64 0.42
65 0.49
66 0.53
67 0.56
68 0.57
69 0.55
70 0.53
71 0.48
72 0.44
73 0.37
74 0.32
75 0.28
76 0.24
77 0.22
78 0.2
79 0.16
80 0.13
81 0.1
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.17
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.23
130 0.22
131 0.28
132 0.28
133 0.24
134 0.26
135 0.31
136 0.32
137 0.31
138 0.31
139 0.25
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.21
144 0.26
145 0.35
146 0.41
147 0.5
148 0.6
149 0.69
150 0.77
151 0.8
152 0.84
153 0.85
154 0.89
155 0.9
156 0.9
157 0.85
158 0.76
159 0.72
160 0.63
161 0.52
162 0.48
163 0.38
164 0.29
165 0.24
166 0.23
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.09
171 0.09
172 0.14
173 0.15
174 0.19
175 0.22
176 0.25
177 0.29
178 0.37
179 0.42
180 0.42
181 0.46
182 0.43
183 0.41
184 0.46
185 0.46
186 0.42
187 0.39
188 0.33
189 0.29
190 0.29
191 0.27
192 0.18
193 0.18
194 0.13
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.08
244 0.13
245 0.14
246 0.16
247 0.18
248 0.22
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.14
258 0.16
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.2
277 0.26
278 0.32
279 0.4
280 0.46
281 0.48
282 0.5
283 0.51
284 0.47
285 0.48
286 0.42
287 0.33
288 0.28
289 0.28
290 0.27
291 0.26
292 0.22
293 0.16
294 0.18
295 0.18
296 0.19
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.25
301 0.29
302 0.34
303 0.44
304 0.49
305 0.5
306 0.57
307 0.61
308 0.67
309 0.7
310 0.66
311 0.61
312 0.58
313 0.61
314 0.56
315 0.55
316 0.48
317 0.46
318 0.48
319 0.47
320 0.45
321 0.36
322 0.33
323 0.3
324 0.27
325 0.2
326 0.14
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.13
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.21
375 0.24
376 0.26
377 0.3
378 0.32
379 0.31
380 0.34
381 0.38
382 0.41
383 0.39
384 0.37
385 0.33
386 0.28
387 0.26
388 0.22
389 0.19
390 0.15
391 0.21
392 0.24
393 0.26
394 0.24
395 0.24
396 0.27
397 0.31
398 0.37
399 0.36
400 0.38
401 0.44
402 0.44
403 0.44
404 0.4
405 0.38
406 0.34
407 0.3
408 0.26
409 0.2
410 0.19
411 0.19
412 0.17
413 0.13
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.14
425 0.14
426 0.13
427 0.18