FuNGI

A0A1C7LPE5

Protein Details

Accession

A0A1C7LPE5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
316-340	LFVAGRRYARKRRHIWYKHTLRNST	Hydrophilic
1175-1194	VAHASKRKAAFDRRVQRTKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11.5, cyto 11, nucl 10, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MYLPDSTIINFYDLYSVESQRLTAPNIGLLESKPFVHHLALHSPTGEIVRVKGLFDDGAMISVMSTDLWTIVKHRLGPAQPSTRKLRMADGFIVPSEGSWTGTVHLGGTHTRGAFEIFPSGGAWSFLVGKPLLQAFHAIHNYDSDTLLIPTSSGQCTLQNQLGQTPDTTALAAAGLSLALDIKVYSSIIVDTISSSSIESSAELTQIVDCPPCTNQTKPDHITLPDSTSAFVITATEPIANPSLPPQLQPNVHRRTYVEEVEDEDAQPLPQYHMNAHIPPVPTSKPIPEAANTHHQGAEPTTHALRRTRQIRWPALFVAGRRYARKRRHIWYKHTLRNSTPTTATTTAAPLNDDNLWYIGPDAPLPDPTEDAEFSINHISSQAPSLPFTRLTDPFNPQRISAILDAVTIGADLTNTQLTGVIAQCDPSQVKCVSSITLAQKAHEGNGLPLAELQHRVNDQCVAAGLPPYFDLPERPPPPESTTQPLPNAEPKWRICQNFAEINRVTEIAPMPQGDVRGKQQALSGHRWLCTFDFASGFYAVTVAEESRPYTCFYVEGRGYFWCIKMPFGLTGAPSTFAHMTGIHLHDFLADGTMELFVDDGASADDDFDSLISKLRRIFTRIRDRRMSLSPSKSQFFVTDAVFTGASVGPSGVTADHAKLTAIVDWQPPKNALNLNSFLGLTGHFRDLIKDYAKIEAPLRNLLREVDLPKTYSKTTYRRILTNHVLAERWTDAHTDSFLTLKTILTSEPVLRRFGAVLTQRFQTVLPNGRTVEHLHPIAFASKRTSRTEEKYKPFLLEFAALKFALDKFSDIIWGFPIEIETDCQALRDVLINDKLNAAHARWRDSILAHQIVDVRHVPGRLNVVADGISRVGEGSPRTSTDGSTWTVSEDWESSLGLIQDIFQIDDEHTALLTRFQNEPLFLEVIQALLDLDTDTDSRRLRRAQHRASQYMLDNAKLWKLTTGPTPRARSRVECVPQTEAVELARQQHQNGGHWGRDSIKIALLDRICSPHLDQSIIKAIQECGQCKNFARLQQIFRAYIPPETFMSDGGSHFDNNDVRDTCTSWHVRTHIVAAYSPWINGLVEGTNKLLLHILQRLCAPDLNDADINAATWDTLPGHWPDRLDEALQALNTPYPLILTRPPTGDATEPVEPDAIALHLAYAAQQCLDGCDAIVAHASKRKAAFDRRVQRTKPGEVIFIPGSLIQVYRSDLETTLSTARKLLRAGRNLDALSNASRTPINLQPLMVFPLTGPFTHAGCVVTTLIPIPNLPLMRRGRRAASENAWIDVADTD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.19
4	0.2
5	0.2
6	0.2
7	0.22
8	0.24
9	0.24
10	0.24
11	0.23
12	0.25
13	0.25
14	0.26
15	0.23
16	0.21
17	0.23
18	0.2
19	0.2
20	0.18
21	0.19
22	0.2
23	0.21
24	0.23
25	0.23
26	0.3
27	0.32
28	0.32
29	0.3
30	0.28
31	0.27
32	0.25
33	0.23
34	0.16
35	0.14
36	0.19
37	0.19
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.17
42	0.16
43	0.18
44	0.12
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.05
52	0.05
53	0.04
54	0.05
55	0.06
56	0.07
57	0.1
58	0.16
59	0.19
60	0.22
61	0.25
62	0.32
63	0.35
64	0.42
65	0.48
66	0.52
67	0.54
68	0.58
69	0.63
70	0.61
71	0.62
72	0.56
73	0.56
74	0.51
75	0.51
76	0.5
77	0.45
78	0.42
79	0.37
80	0.37
81	0.27
82	0.22
83	0.19
84	0.15
85	0.13
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.14
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.14
96	0.17
97	0.15
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.17
103	0.17
104	0.13
105	0.14
106	0.14
107	0.14
108	0.12
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.12
113	0.12
114	0.14
115	0.13
116	0.13
117	0.15
118	0.17
119	0.16
120	0.14
121	0.17
122	0.15
123	0.23
124	0.26
125	0.24
126	0.22
127	0.23
128	0.25
129	0.23
130	0.21
131	0.15
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.11
136	0.09
137	0.1
138	0.13
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.16
143	0.19
144	0.24
145	0.26
146	0.25
147	0.25
148	0.27
149	0.28
150	0.26
151	0.23
152	0.21
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.13
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.06
161	0.04
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.04
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.12
198	0.13
199	0.19
200	0.22
201	0.24
202	0.31
203	0.38
204	0.46
205	0.48
206	0.51
207	0.5
208	0.47
209	0.49
210	0.42
211	0.39
212	0.33
213	0.3
214	0.25
215	0.21
216	0.2
217	0.15
218	0.13
219	0.1
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.08
225	0.1
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.12
230	0.18
231	0.18
232	0.19
233	0.22
234	0.26
235	0.32
236	0.38
237	0.45
238	0.46
239	0.47
240	0.48
241	0.44
242	0.45
243	0.46
244	0.43
245	0.36
246	0.29
247	0.31
248	0.32
249	0.31
250	0.24
251	0.19
252	0.16
253	0.13
254	0.13
255	0.1
256	0.1
257	0.12
258	0.13
259	0.13
260	0.2
261	0.23
262	0.23
263	0.25
264	0.27
265	0.26
266	0.27
267	0.3
268	0.25
269	0.25
270	0.26
271	0.27
272	0.26
273	0.27
274	0.27
275	0.26
276	0.28
277	0.3
278	0.37
279	0.36
280	0.34
281	0.32
282	0.3
283	0.28
284	0.26
285	0.24
286	0.16
287	0.17
288	0.18
289	0.19
290	0.22
291	0.25
292	0.29
293	0.35
294	0.4
295	0.43
296	0.48
297	0.56
298	0.62
299	0.6
300	0.59
301	0.51
302	0.5
303	0.47
304	0.4
305	0.37
306	0.35
307	0.35
308	0.37
309	0.44
310	0.48
311	0.55
312	0.65
313	0.66
314	0.68
315	0.77
316	0.81
317	0.82
318	0.83
319	0.84
320	0.83
321	0.83
322	0.77
323	0.69
324	0.68
325	0.63
326	0.56
327	0.47
328	0.39
329	0.37
330	0.34
331	0.32
332	0.24
333	0.22
334	0.2
335	0.19
336	0.19
337	0.13
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.11
342	0.1
343	0.1
344	0.08
345	0.09
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.12
356	0.14
357	0.12
358	0.13
359	0.13
360	0.11
361	0.12
362	0.15
363	0.14
364	0.11
365	0.12
366	0.11
367	0.1
368	0.12
369	0.14
370	0.11
371	0.13
372	0.15
373	0.16
374	0.17
375	0.19
376	0.22
377	0.21
378	0.25
379	0.28
380	0.32
381	0.37
382	0.43
383	0.41
384	0.37
385	0.36
386	0.32
387	0.31
388	0.25
389	0.2
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.1
394	0.09
395	0.05
396	0.05
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.1
413	0.11
414	0.1
415	0.14
416	0.13
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.14
421	0.14
422	0.19
423	0.18
424	0.25
425	0.24
426	0.23
427	0.25
428	0.25
429	0.24
430	0.21
431	0.18
432	0.12
433	0.15
434	0.15
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.12
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.13
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.13
447	0.11
448	0.11
449	0.09
450	0.08
451	0.1
452	0.09
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.1
459	0.12
460	0.22
461	0.24
462	0.26
463	0.27
464	0.29
465	0.35
466	0.38
467	0.37
468	0.34
469	0.37
470	0.38
471	0.38
472	0.37
473	0.33
474	0.34
475	0.33
476	0.31
477	0.32
478	0.31
479	0.36
480	0.41
481	0.4
482	0.37
483	0.39
484	0.39
485	0.41
486	0.4
487	0.39
488	0.33
489	0.33
490	0.3
491	0.27
492	0.22
493	0.16
494	0.15
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.12
501	0.11
502	0.13
503	0.14
504	0.19
505	0.19
506	0.18
507	0.2
508	0.24
509	0.27
510	0.3
511	0.33
512	0.3
513	0.31
514	0.3
515	0.29
516	0.25
517	0.23
518	0.18
519	0.14
520	0.12
521	0.12
522	0.13
523	0.12
524	0.11
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.04
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.11
541	0.17
542	0.16
543	0.16
544	0.16
545	0.15
546	0.18
547	0.17
548	0.17
549	0.14
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.14
554	0.12
555	0.12
556	0.12
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.1
569	0.12
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.09
574	0.09
575	0.08
576	0.06
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.04
597	0.04
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.12
602	0.15
603	0.17
604	0.21
605	0.27
606	0.33
607	0.44
608	0.5
609	0.54
610	0.55
611	0.56
612	0.56
613	0.54
614	0.51
615	0.46
616	0.44
617	0.44
618	0.43
619	0.41
620	0.38
621	0.34
622	0.28
623	0.23
624	0.2
625	0.14
626	0.12
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.09
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.03
640	0.04
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.06
649	0.06
650	0.07
651	0.1
652	0.13
653	0.13
654	0.14
655	0.14
656	0.14
657	0.16
658	0.17
659	0.18
660	0.19
661	0.2
662	0.2
663	0.2
664	0.19
665	0.16
666	0.14
667	0.11
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.11
675	0.14
676	0.14
677	0.14
678	0.14
679	0.16
680	0.16
681	0.17
682	0.17
683	0.17
684	0.17
685	0.21
686	0.21
687	0.19
688	0.19
689	0.18
690	0.18
691	0.17
692	0.17
693	0.15
694	0.16
695	0.17
696	0.17
697	0.19
698	0.18
699	0.2
700	0.24
701	0.27
702	0.32
703	0.39
704	0.41
705	0.42
706	0.44
707	0.47
708	0.46
709	0.44
710	0.39
711	0.32
712	0.3
713	0.26
714	0.25
715	0.19
716	0.15
717	0.11
718	0.1
719	0.09
720	0.1
721	0.1
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.09
734	0.11
735	0.15
736	0.16
737	0.17
738	0.17
739	0.17
740	0.16
741	0.15
742	0.18
743	0.18
744	0.2
745	0.2
746	0.21
747	0.21
748	0.21
749	0.21
750	0.18
751	0.17
752	0.22
753	0.22
754	0.24
755	0.24
756	0.24
757	0.26
758	0.27
759	0.25
760	0.21
761	0.2
762	0.18
763	0.18
764	0.18
765	0.2
766	0.17
767	0.15
768	0.16
769	0.2
770	0.24
771	0.27
772	0.32
773	0.34
774	0.4
775	0.5
776	0.54
777	0.56
778	0.58
779	0.56
780	0.53
781	0.47
782	0.41
783	0.31
784	0.26
785	0.2
786	0.15
787	0.16
788	0.14
789	0.13
790	0.13
791	0.12
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.08
796	0.09
797	0.12
798	0.11
799	0.11
800	0.09
801	0.1
802	0.09
803	0.08
804	0.08
805	0.06
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.07
814	0.07
815	0.1
816	0.1
817	0.12
818	0.17
819	0.17
820	0.17
821	0.18
822	0.18
823	0.17
824	0.17
825	0.15
826	0.16
827	0.17
828	0.22
829	0.22
830	0.23
831	0.22
832	0.22
833	0.25
834	0.25
835	0.26
836	0.21
837	0.21
838	0.22
839	0.21
840	0.23
841	0.19
842	0.15
843	0.15
844	0.15
845	0.15
846	0.14
847	0.18
848	0.16
849	0.16
850	0.14
851	0.13
852	0.13
853	0.13
854	0.11
855	0.08
856	0.07
857	0.06
858	0.06
859	0.05
860	0.07
861	0.08
862	0.1
863	0.11
864	0.12
865	0.15
866	0.15
867	0.16
868	0.15
869	0.18
870	0.17
871	0.17
872	0.16
873	0.14
874	0.14
875	0.13
876	0.13
877	0.1
878	0.09
879	0.09
880	0.08
881	0.07
882	0.08
883	0.08
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.06
891	0.07
892	0.07
893	0.09
894	0.09
895	0.07
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.1
900	0.12
901	0.13
902	0.14
903	0.16
904	0.18
905	0.18
906	0.2
907	0.18
908	0.17
909	0.15
910	0.15
911	0.12
912	0.11
913	0.1
914	0.08
915	0.06
916	0.04
917	0.04
918	0.03
919	0.04
920	0.04
921	0.05
922	0.06
923	0.1
924	0.13
925	0.15
926	0.19
927	0.24
928	0.32
929	0.42
930	0.52
931	0.57
932	0.64
933	0.7
934	0.68
935	0.66
936	0.61
937	0.52
938	0.49
939	0.4
940	0.33
941	0.26
942	0.24
943	0.24
944	0.2
945	0.19
946	0.13
947	0.13
948	0.14
949	0.21
950	0.28
951	0.33
952	0.4
953	0.47
954	0.49
955	0.54
956	0.56
957	0.52
958	0.5
959	0.52
960	0.5
961	0.48
962	0.47
963	0.46
964	0.43
965	0.4
966	0.35
967	0.26
968	0.21
969	0.18
970	0.16
971	0.16
972	0.2
973	0.2
974	0.2
975	0.24
976	0.26
977	0.27
978	0.34
979	0.34
980	0.3
981	0.3
982	0.31
983	0.28
984	0.3
985	0.3
986	0.22
987	0.22
988	0.22
989	0.22
990	0.26
991	0.24
992	0.22
993	0.21
994	0.22
995	0.2
996	0.19
997	0.2
998	0.2
999	0.21
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.22
1003	0.3
1004	0.28
1005	0.27
1006	0.23
1007	0.22
1008	0.25
1009	0.29
1010	0.27
1011	0.25
1012	0.27
1013	0.29
1014	0.29
1015	0.35
1016	0.34
1017	0.35
1018	0.42
1019	0.43
1020	0.44
1021	0.5
1022	0.52
1023	0.47
1024	0.44
1025	0.43
1026	0.35
1027	0.34
1028	0.31
1029	0.25
1030	0.22
1031	0.23
1032	0.22
1033	0.18
1034	0.2
1035	0.16
1036	0.15
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.13
1040	0.13
1041	0.17
1042	0.16
1043	0.16
1044	0.22
1045	0.21
1046	0.22
1047	0.23
1048	0.24
1049	0.22
1050	0.27
1051	0.3
1052	0.26
1053	0.3
1054	0.29
1055	0.3
1056	0.3
1057	0.32
1058	0.27
1059	0.25
1060	0.23
1061	0.2
1062	0.22
1063	0.2
1064	0.18
1065	0.15
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.11
1069	0.12
1070	0.09
1071	0.1
1072	0.11
1073	0.12
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.13
1078	0.12
1079	0.14
1080	0.2
1081	0.2
1082	0.19
1083	0.21
1084	0.23
1085	0.24
1086	0.25
1087	0.23
1088	0.22
1089	0.23
1090	0.25
1091	0.24
1092	0.22
1093	0.22
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.12
1097	0.11
1098	0.07
1099	0.06
1100	0.08
1101	0.07
1102	0.08
1103	0.1
1104	0.13
1105	0.16
1106	0.18
1107	0.19
1108	0.19
1109	0.23
1110	0.24
1111	0.22
1112	0.2
1113	0.19
1114	0.2
1115	0.19
1116	0.17
1117	0.14
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.11
1121	0.09
1122	0.08
1123	0.09
1124	0.12
1125	0.16
1126	0.2
1127	0.23
1128	0.25
1129	0.27
1130	0.28
1131	0.29
1132	0.29
1133	0.26
1134	0.27
1135	0.27
1136	0.25
1137	0.24
1138	0.23
1139	0.2
1140	0.18
1141	0.15
1142	0.1
1143	0.07
1144	0.06
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.07
1149	0.08
1150	0.08
1151	0.08
1152	0.09
1153	0.08
1154	0.1
1155	0.12
1156	0.1
1157	0.08
1158	0.09
1159	0.09
1160	0.08
1161	0.12
1162	0.11
1163	0.13
1164	0.18
1165	0.19
1166	0.22
1167	0.25
1168	0.3
1169	0.35
1170	0.44
1171	0.51
1172	0.57
1173	0.67
1174	0.73
1175	0.81
1176	0.77
1177	0.79
1178	0.76
1179	0.73
1180	0.7
1181	0.62
1182	0.56
1183	0.47
1184	0.5
1185	0.41
1186	0.34
1187	0.28
1188	0.2
1189	0.18
1190	0.15
1191	0.14
1192	0.09
1193	0.1
1194	0.12
1195	0.13
1196	0.15
1197	0.15
1198	0.15
1199	0.18
1200	0.17
1201	0.19
1202	0.23
1203	0.23
1204	0.21
1205	0.24
1206	0.26
1207	0.27
1208	0.3
1209	0.36
1210	0.39
1211	0.45
1212	0.5
1213	0.51
1214	0.53
1215	0.51
1216	0.48
1217	0.41
1218	0.34
1219	0.29
1220	0.27
1221	0.22
1222	0.18
1223	0.18
1224	0.18
1225	0.22
1226	0.25
1227	0.28
1228	0.27
1229	0.28
1230	0.28
1231	0.3
1232	0.32
1233	0.27
1234	0.21
1235	0.15
1236	0.19
1237	0.2
1238	0.18
1239	0.19
1240	0.17
1241	0.18
1242	0.19
1243	0.2
1244	0.15
1245	0.14
1246	0.16
1247	0.15
1248	0.13
1249	0.13
1250	0.14
1251	0.14
1252	0.14
1253	0.13
1254	0.13
1255	0.17
1256	0.19
1257	0.2
1258	0.27
1259	0.34
1260	0.42
1261	0.49
1262	0.52
1263	0.53
1264	0.58
1265	0.62
1266	0.62
1267	0.58
1268	0.6
1269	0.54
1270	0.51
1271	0.45
1272	0.37

A0A1C7LPE5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer