Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YR60

Protein Details
Accession C7YR60    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21AAAPRRRKLIGQRRRVEDEGBasic
149-169AAPANRRRQEHEDYKRRRDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-204RGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG nhe:NECHADRAFT_40681  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MAAAPRRRKLIGQRRRVEDEGDDEGGPDALDLDDDSITDGSLTDDNDPADDSDTSNIDEASPTAPNARKKANGAPAAPRHAGHASKLGTDSGHDGKPVTDTDMMLHGLSITDQSQPGQVMHFDEVTAPSPPRSPAAPIVVSSASARPQAAPANRRRQEHEDYKRRRDEDPAFVPNRGAFFMHDHRHAGPAANGFRPFGRGRGRGGRGGIGGPYAPINQLHHPGDPTTNSPWTHDMHETVVEPPPPARPRHMIVDDEGPANGNGFIPTCEPNPTPINRTLSTEKHIGNTQVRVFLPSMKAAAVIPRLAVKQYTKLPDHRPPLRRDKPVRISLPENPPRYIYPAADRSFIFIPRAMRPNQQRMRGKPRSGFGSMGGFSRRTSMFGGSYYGGSVYTPSVALSRRSSIVDRDYMFSPTGSVISRPPIPVENARPVVRLPPAPRPDVPPMNTMAPPPMAAPMPVSIPGPADPAFAVERPIMSETSINDLPPPQTYPLPQKPAFQENRPTSALPMHQPRPQKSISVADIESPTLTQGPQAFQQAFHQQVPIQMANGLSQESHNRQPSYPSQLSTGTPLSQIPERAIHAAPFQPNTYGQQPYYNQQPYQAQPPQPQPQPQQGYYYPPNYNNPNMAPSGGPPPYVPGQPGPPGSYTPQNQPEQLAMPGNGQPPPPSSNLVAQEVNGMVYYYDASQLPPVNNYPTYSAPQGYQPSVIGMNGMVTPSPDAFYYPQQAPGMVYYPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.81
3 0.76
4 0.68
5 0.61
6 0.57
7 0.51
8 0.44
9 0.36
10 0.29
11 0.27
12 0.24
13 0.19
14 0.13
15 0.08
16 0.05
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.06
21 0.07
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.17
51 0.23
52 0.29
53 0.34
54 0.39
55 0.42
56 0.46
57 0.54
58 0.57
59 0.58
60 0.55
61 0.59
62 0.6
63 0.62
64 0.59
65 0.5
66 0.45
67 0.43
68 0.4
69 0.33
70 0.34
71 0.28
72 0.29
73 0.3
74 0.26
75 0.21
76 0.21
77 0.24
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.11
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.18
119 0.17
120 0.2
121 0.22
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.28
126 0.26
127 0.25
128 0.23
129 0.2
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.13
134 0.15
135 0.21
136 0.27
137 0.34
138 0.42
139 0.51
140 0.56
141 0.59
142 0.63
143 0.63
144 0.66
145 0.68
146 0.7
147 0.7
148 0.74
149 0.8
150 0.82
151 0.77
152 0.7
153 0.68
154 0.64
155 0.62
156 0.6
157 0.6
158 0.54
159 0.51
160 0.5
161 0.43
162 0.37
163 0.28
164 0.21
165 0.14
166 0.17
167 0.24
168 0.27
169 0.28
170 0.29
171 0.29
172 0.31
173 0.3
174 0.26
175 0.21
176 0.23
177 0.24
178 0.25
179 0.25
180 0.23
181 0.23
182 0.26
183 0.23
184 0.23
185 0.28
186 0.27
187 0.32
188 0.41
189 0.44
190 0.43
191 0.44
192 0.4
193 0.33
194 0.31
195 0.26
196 0.17
197 0.14
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.13
205 0.19
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.21
210 0.22
211 0.21
212 0.22
213 0.2
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.25
218 0.25
219 0.26
220 0.25
221 0.22
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.18
226 0.19
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.26
234 0.28
235 0.3
236 0.37
237 0.39
238 0.33
239 0.32
240 0.34
241 0.31
242 0.27
243 0.24
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.13
257 0.17
258 0.21
259 0.22
260 0.25
261 0.28
262 0.33
263 0.3
264 0.35
265 0.36
266 0.34
267 0.35
268 0.36
269 0.31
270 0.28
271 0.29
272 0.29
273 0.27
274 0.28
275 0.26
276 0.25
277 0.24
278 0.24
279 0.23
280 0.21
281 0.2
282 0.16
283 0.16
284 0.12
285 0.12
286 0.1
287 0.12
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.11
296 0.14
297 0.19
298 0.24
299 0.25
300 0.31
301 0.37
302 0.43
303 0.5
304 0.54
305 0.56
306 0.58
307 0.66
308 0.68
309 0.71
310 0.7
311 0.72
312 0.72
313 0.73
314 0.7
315 0.62
316 0.58
317 0.56
318 0.6
319 0.57
320 0.52
321 0.44
322 0.42
323 0.39
324 0.39
325 0.33
326 0.24
327 0.22
328 0.26
329 0.27
330 0.27
331 0.26
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.19
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.22
340 0.21
341 0.26
342 0.31
343 0.41
344 0.44
345 0.51
346 0.53
347 0.56
348 0.65
349 0.66
350 0.65
351 0.58
352 0.55
353 0.51
354 0.47
355 0.4
356 0.31
357 0.27
358 0.23
359 0.2
360 0.18
361 0.14
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.14
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.16
390 0.17
391 0.18
392 0.2
393 0.2
394 0.21
395 0.2
396 0.2
397 0.2
398 0.17
399 0.14
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.1
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.15
411 0.19
412 0.22
413 0.26
414 0.28
415 0.28
416 0.28
417 0.27
418 0.27
419 0.25
420 0.25
421 0.22
422 0.27
423 0.3
424 0.33
425 0.34
426 0.36
427 0.4
428 0.42
429 0.41
430 0.34
431 0.33
432 0.32
433 0.32
434 0.27
435 0.21
436 0.16
437 0.14
438 0.12
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.09
452 0.09
453 0.08
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.11
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.15
467 0.16
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.16
474 0.12
475 0.13
476 0.17
477 0.26
478 0.32
479 0.39
480 0.39
481 0.41
482 0.43
483 0.52
484 0.53
485 0.48
486 0.51
487 0.47
488 0.51
489 0.48
490 0.44
491 0.36
492 0.35
493 0.33
494 0.29
495 0.33
496 0.32
497 0.35
498 0.42
499 0.44
500 0.46
501 0.44
502 0.4
503 0.36
504 0.38
505 0.36
506 0.33
507 0.29
508 0.26
509 0.26
510 0.24
511 0.21
512 0.14
513 0.12
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.09
518 0.11
519 0.13
520 0.17
521 0.17
522 0.17
523 0.21
524 0.25
525 0.27
526 0.25
527 0.24
528 0.21
529 0.23
530 0.27
531 0.24
532 0.18
533 0.16
534 0.16
535 0.16
536 0.15
537 0.13
538 0.08
539 0.09
540 0.14
541 0.18
542 0.24
543 0.29
544 0.3
545 0.3
546 0.36
547 0.4
548 0.44
549 0.43
550 0.37
551 0.34
552 0.35
553 0.35
554 0.33
555 0.3
556 0.21
557 0.19
558 0.18
559 0.18
560 0.19
561 0.19
562 0.17
563 0.17
564 0.18
565 0.21
566 0.21
567 0.19
568 0.2
569 0.23
570 0.24
571 0.23
572 0.23
573 0.21
574 0.22
575 0.25
576 0.27
577 0.26
578 0.23
579 0.28
580 0.3
581 0.31
582 0.39
583 0.4
584 0.36
585 0.37
586 0.42
587 0.38
588 0.45
589 0.49
590 0.45
591 0.47
592 0.55
593 0.59
594 0.59
595 0.64
596 0.6
597 0.63
598 0.65
599 0.59
600 0.58
601 0.51
602 0.53
603 0.51
604 0.53
605 0.47
606 0.44
607 0.49
608 0.47
609 0.49
610 0.46
611 0.42
612 0.38
613 0.35
614 0.32
615 0.26
616 0.23
617 0.26
618 0.23
619 0.22
620 0.18
621 0.22
622 0.24
623 0.24
624 0.24
625 0.2
626 0.24
627 0.28
628 0.31
629 0.28
630 0.27
631 0.28
632 0.3
633 0.35
634 0.34
635 0.37
636 0.43
637 0.44
638 0.44
639 0.42
640 0.41
641 0.36
642 0.35
643 0.3
644 0.22
645 0.22
646 0.25
647 0.26
648 0.25
649 0.24
650 0.23
651 0.23
652 0.26
653 0.26
654 0.25
655 0.26
656 0.3
657 0.33
658 0.36
659 0.33
660 0.29
661 0.29
662 0.26
663 0.23
664 0.17
665 0.13
666 0.08
667 0.08
668 0.09
669 0.07
670 0.09
671 0.09
672 0.1
673 0.14
674 0.18
675 0.19
676 0.21
677 0.24
678 0.27
679 0.28
680 0.29
681 0.29
682 0.29
683 0.32
684 0.32
685 0.31
686 0.27
687 0.32
688 0.35
689 0.33
690 0.31
691 0.27
692 0.26
693 0.25
694 0.23
695 0.17
696 0.12
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.08
701 0.08
702 0.1
703 0.1
704 0.11
705 0.1
706 0.13
707 0.15
708 0.21
709 0.26
710 0.26
711 0.31
712 0.31
713 0.31
714 0.29
715 0.29