Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MJ04

Protein Details
Accession A0A1C7MJ04    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-257GPTRVLRSRSRPPSRVRNVDQHydrophilic
458-478RQEQRGRRRLHRPQSPCRSQPBasic
535-557QRPPSLFHPKRKKPTPVPPKNDPBasic
686-711RDEKGKEKAPPKKRFQKKTKQVFLVPBasic
763-782VPAHRWYKFQKKPNYRIPNLHydrophilic
1106-1126GQTAVGKPKKRKAHLPPGGVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-314RKRRK
544-549KRKKPT
584-591RVPRPRRE
688-704EKGKEKAPPKKRFQKKT
1112-1118KPKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR040106  Esc1_bHLHzip  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd19690  bHLHzip_spESC1_like  
Amino Acid Sequences MGVDENGTDQMDVDPKSNGQQRRNDPGASQRPNSARKSEEVDYNSRRQSVVAGTKRKASSDKVYPPPGNEDIDPQLVGPGVSSGMNVDSEGPAPKRRGSAIDTQRIAQLSLYDRRNSVDARLGVGGPQWWGDRRDSGSSAFSNTPVTGYTTPASAFPGDSPHGRPPGGIATFAWPVIPPLDQSAPPAMQNEPAPNMSGPPHPYDPLTIMPPVTFAPDRRMSAPASSPENLSTPASTGPTRVLRSRSRPPSRVRNVDQSVNNHAGQSASSPGAGTSTEDASSSLLQPSKESGSTPYSRSPELRVSHKLAERKRRKEMKDLFDELRDQLPADRGMKASKWEILSKAIDFIVNLKQSHQDMGREIEMLRHELESFRQGIPPPFPGGPPHPVVYGHGPPVGMPGYPPPGGPAVPLRRLISPHTIPMDPFPRRNNNNRSLDQGRHIMCIHLARILLRPPMEQRQEQRGRRRLHRPQSPCRSQPVSISISWLSVMGLRRPPCQRGGAVSLHPCDNLSPPSGAHNARSHALYLNLWLQNGAQRPPSLFHPKRKKPTPVPPKNDPAKDGVSPSPSTSASTPTPGTPSRQPPRVPRPRRESAEDEKPKRPEGVPLTYRLMSSALNGWKYDVMKFDSRKDVEIDRWAGPVKLNRKEPRRPDEGPVAAAPQPVGPMLGPDGKPVIGADGKMTYAAGRDEKGKEKAPPKKRFQKKTKQVFLVPEATRQLRREERFPWVMEDSAQQEVWVGKMEEIAKSQTHAMFMPAAQDVFKFVPAHRWYKFQKKPNYRIPNLEEAESLMQKMQKNKAAVLNRRMAPRILESMYSSGQSLGPGGRRLRTVDNGMGGLFGDDEEEEATNRKRRMKREYGADGDMDELDFEEDFADDEERMEPEDREDEEAKELEERLKREYTKANKYREGNIDVEESDESEDETKLTGAGKSLQKTLRKLEKDGGYDDSDEEKNPYASSEEEEEEEIPQAPTGPAILPPPEPRVKTRSPSTVPSGAVPKPANGLPSIAVKTEPQSRATSPVPASSHGGHIVVAKRATSPKVPKAKTGVPSRAGSPLIGHGPTSPTASRATSPVAPTSPAAGASVGGPAPMGAGTSAVKALKRKATDDGQTAVGKPKKRKAHLPPGGVELEDRMVIEWLKNTPNATTRDCILHFTPYLTDEAKKVKFTALVKEVAQLSKGVLVLRPAFRAMASSPPGHVLSPAAAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.26
4 0.33
5 0.39
6 0.42
7 0.51
8 0.57
9 0.65
10 0.69
11 0.63
12 0.59
13 0.62
14 0.65
15 0.62
16 0.57
17 0.55
18 0.58
19 0.64
20 0.66
21 0.61
22 0.54
23 0.51
24 0.55
25 0.51
26 0.51
27 0.5
28 0.54
29 0.54
30 0.59
31 0.59
32 0.53
33 0.49
34 0.41
35 0.39
36 0.38
37 0.42
38 0.44
39 0.48
40 0.49
41 0.57
42 0.58
43 0.58
44 0.54
45 0.5
46 0.5
47 0.51
48 0.59
49 0.6
50 0.67
51 0.66
52 0.65
53 0.65
54 0.59
55 0.53
56 0.44
57 0.4
58 0.35
59 0.34
60 0.31
61 0.24
62 0.21
63 0.18
64 0.17
65 0.12
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.11
77 0.16
78 0.18
79 0.23
80 0.26
81 0.28
82 0.3
83 0.32
84 0.35
85 0.35
86 0.43
87 0.47
88 0.54
89 0.52
90 0.5
91 0.51
92 0.47
93 0.42
94 0.32
95 0.26
96 0.23
97 0.29
98 0.33
99 0.32
100 0.32
101 0.33
102 0.36
103 0.33
104 0.31
105 0.31
106 0.27
107 0.28
108 0.29
109 0.27
110 0.24
111 0.24
112 0.21
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.24
120 0.27
121 0.32
122 0.32
123 0.32
124 0.33
125 0.32
126 0.34
127 0.3
128 0.27
129 0.24
130 0.22
131 0.2
132 0.16
133 0.2
134 0.16
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.18
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.23
148 0.27
149 0.3
150 0.29
151 0.29
152 0.27
153 0.32
154 0.3
155 0.27
156 0.22
157 0.22
158 0.23
159 0.23
160 0.2
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.12
165 0.09
166 0.12
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.22
171 0.22
172 0.22
173 0.23
174 0.19
175 0.2
176 0.22
177 0.23
178 0.21
179 0.21
180 0.22
181 0.2
182 0.21
183 0.2
184 0.23
185 0.22
186 0.25
187 0.27
188 0.26
189 0.26
190 0.27
191 0.27
192 0.25
193 0.25
194 0.21
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.22
203 0.26
204 0.29
205 0.3
206 0.32
207 0.29
208 0.3
209 0.34
210 0.31
211 0.31
212 0.3
213 0.29
214 0.28
215 0.28
216 0.26
217 0.23
218 0.19
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.15
223 0.15
224 0.18
225 0.22
226 0.25
227 0.28
228 0.33
229 0.39
230 0.46
231 0.56
232 0.61
233 0.65
234 0.7
235 0.74
236 0.78
237 0.8
238 0.82
239 0.78
240 0.77
241 0.72
242 0.73
243 0.69
244 0.63
245 0.59
246 0.54
247 0.48
248 0.38
249 0.33
250 0.26
251 0.2
252 0.17
253 0.13
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.22
279 0.25
280 0.27
281 0.31
282 0.31
283 0.33
284 0.34
285 0.34
286 0.36
287 0.37
288 0.4
289 0.39
290 0.42
291 0.46
292 0.49
293 0.53
294 0.53
295 0.6
296 0.65
297 0.67
298 0.73
299 0.76
300 0.75
301 0.78
302 0.8
303 0.78
304 0.76
305 0.73
306 0.65
307 0.58
308 0.55
309 0.46
310 0.38
311 0.29
312 0.21
313 0.17
314 0.17
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.19
320 0.2
321 0.21
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.24
327 0.26
328 0.27
329 0.24
330 0.23
331 0.19
332 0.17
333 0.14
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.21
340 0.21
341 0.25
342 0.24
343 0.2
344 0.19
345 0.22
346 0.21
347 0.19
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.16
361 0.17
362 0.2
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.2
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.24
373 0.21
374 0.21
375 0.23
376 0.24
377 0.23
378 0.2
379 0.19
380 0.17
381 0.16
382 0.18
383 0.16
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.19
395 0.2
396 0.23
397 0.26
398 0.26
399 0.26
400 0.28
401 0.31
402 0.3
403 0.27
404 0.27
405 0.28
406 0.27
407 0.26
408 0.29
409 0.33
410 0.29
411 0.32
412 0.34
413 0.4
414 0.45
415 0.55
416 0.59
417 0.61
418 0.65
419 0.62
420 0.63
421 0.59
422 0.56
423 0.49
424 0.47
425 0.38
426 0.33
427 0.32
428 0.25
429 0.22
430 0.21
431 0.18
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.13
436 0.15
437 0.16
438 0.15
439 0.16
440 0.18
441 0.25
442 0.28
443 0.3
444 0.32
445 0.41
446 0.5
447 0.55
448 0.62
449 0.63
450 0.65
451 0.7
452 0.76
453 0.75
454 0.76
455 0.78
456 0.77
457 0.79
458 0.83
459 0.83
460 0.75
461 0.72
462 0.66
463 0.57
464 0.51
465 0.46
466 0.39
467 0.31
468 0.31
469 0.24
470 0.2
471 0.19
472 0.16
473 0.1
474 0.1
475 0.11
476 0.11
477 0.16
478 0.18
479 0.23
480 0.26
481 0.28
482 0.28
483 0.29
484 0.27
485 0.26
486 0.29
487 0.27
488 0.27
489 0.28
490 0.26
491 0.24
492 0.23
493 0.19
494 0.15
495 0.14
496 0.13
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.13
501 0.17
502 0.17
503 0.18
504 0.19
505 0.2
506 0.2
507 0.2
508 0.18
509 0.15
510 0.16
511 0.12
512 0.11
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.15
525 0.2
526 0.28
527 0.31
528 0.4
529 0.49
530 0.58
531 0.66
532 0.73
533 0.76
534 0.74
535 0.8
536 0.82
537 0.81
538 0.8
539 0.77
540 0.79
541 0.77
542 0.69
543 0.6
544 0.52
545 0.44
546 0.38
547 0.34
548 0.27
549 0.23
550 0.21
551 0.2
552 0.19
553 0.16
554 0.16
555 0.14
556 0.16
557 0.13
558 0.15
559 0.15
560 0.13
561 0.16
562 0.16
563 0.19
564 0.21
565 0.3
566 0.33
567 0.38
568 0.41
569 0.47
570 0.57
571 0.65
572 0.67
573 0.67
574 0.69
575 0.72
576 0.72
577 0.69
578 0.65
579 0.61
580 0.64
581 0.64
582 0.61
583 0.58
584 0.56
585 0.51
586 0.46
587 0.4
588 0.36
589 0.32
590 0.35
591 0.31
592 0.33
593 0.35
594 0.33
595 0.32
596 0.26
597 0.22
598 0.13
599 0.12
600 0.14
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.14
606 0.15
607 0.15
608 0.13
609 0.14
610 0.19
611 0.21
612 0.23
613 0.28
614 0.28
615 0.29
616 0.29
617 0.27
618 0.24
619 0.27
620 0.27
621 0.2
622 0.21
623 0.2
624 0.18
625 0.18
626 0.21
627 0.23
628 0.26
629 0.34
630 0.4
631 0.47
632 0.55
633 0.62
634 0.63
635 0.64
636 0.6
637 0.56
638 0.57
639 0.51
640 0.44
641 0.36
642 0.31
643 0.25
644 0.22
645 0.18
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.07
650 0.05
651 0.04
652 0.06
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.1
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.05
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.08
673 0.11
674 0.14
675 0.19
676 0.22
677 0.24
678 0.29
679 0.37
680 0.46
681 0.53
682 0.6
683 0.65
684 0.73
685 0.8
686 0.84
687 0.86
688 0.88
689 0.88
690 0.89
691 0.88
692 0.83
693 0.77
694 0.71
695 0.64
696 0.61
697 0.51
698 0.43
699 0.37
700 0.34
701 0.33
702 0.29
703 0.31
704 0.31
705 0.33
706 0.34
707 0.34
708 0.39
709 0.4
710 0.4
711 0.37
712 0.3
713 0.28
714 0.25
715 0.23
716 0.19
717 0.16
718 0.15
719 0.11
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.1
724 0.08
725 0.07
726 0.1
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.12
732 0.12
733 0.14
734 0.12
735 0.13
736 0.12
737 0.12
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.09
742 0.09
743 0.08
744 0.08
745 0.09
746 0.09
747 0.11
748 0.1
749 0.1
750 0.19
751 0.23
752 0.29
753 0.28
754 0.35
755 0.38
756 0.48
757 0.56
758 0.56
759 0.63
760 0.68
761 0.75
762 0.79
763 0.84
764 0.77
765 0.76
766 0.72
767 0.71
768 0.61
769 0.53
770 0.42
771 0.33
772 0.32
773 0.25
774 0.2
775 0.12
776 0.14
777 0.16
778 0.21
779 0.25
780 0.28
781 0.29
782 0.32
783 0.38
784 0.43
785 0.48
786 0.49
787 0.51
788 0.5
789 0.51
790 0.5
791 0.43
792 0.36
793 0.32
794 0.29
795 0.23
796 0.2
797 0.19
798 0.2
799 0.2
800 0.18
801 0.16
802 0.12
803 0.11
804 0.1
805 0.1
806 0.09
807 0.11
808 0.15
809 0.17
810 0.18
811 0.19
812 0.22
813 0.25
814 0.26
815 0.28
816 0.26
817 0.25
818 0.24
819 0.23
820 0.19
821 0.15
822 0.12
823 0.07
824 0.05
825 0.04
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.05
830 0.05
831 0.08
832 0.12
833 0.18
834 0.22
835 0.31
836 0.37
837 0.44
838 0.54
839 0.61
840 0.64
841 0.68
842 0.72
843 0.69
844 0.64
845 0.57
846 0.47
847 0.37
848 0.3
849 0.2
850 0.12
851 0.07
852 0.06
853 0.05
854 0.05
855 0.04
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.06
860 0.05
861 0.06
862 0.07
863 0.07
864 0.1
865 0.11
866 0.1
867 0.11
868 0.15
869 0.15
870 0.19
871 0.2
872 0.19
873 0.2
874 0.2
875 0.19
876 0.17
877 0.17
878 0.18
879 0.21
880 0.21
881 0.23
882 0.28
883 0.29
884 0.32
885 0.41
886 0.44
887 0.52
888 0.58
889 0.61
890 0.63
891 0.65
892 0.68
893 0.65
894 0.61
895 0.51
896 0.45
897 0.4
898 0.32
899 0.3
900 0.23
901 0.17
902 0.13
903 0.11
904 0.1
905 0.09
906 0.09
907 0.07
908 0.08
909 0.07
910 0.07
911 0.08
912 0.08
913 0.08
914 0.15
915 0.19
916 0.21
917 0.27
918 0.33
919 0.37
920 0.41
921 0.49
922 0.52
923 0.51
924 0.52
925 0.54
926 0.55
927 0.52
928 0.51
929 0.46
930 0.38
931 0.35
932 0.33
933 0.29
934 0.23
935 0.21
936 0.2
937 0.18
938 0.17
939 0.16
940 0.15
941 0.13
942 0.13
943 0.15
944 0.16
945 0.16
946 0.16
947 0.17
948 0.17
949 0.16
950 0.16
951 0.14
952 0.11
953 0.1
954 0.1
955 0.08
956 0.08
957 0.08
958 0.08
959 0.08
960 0.1
961 0.12
962 0.14
963 0.17
964 0.24
965 0.29
966 0.31
967 0.34
968 0.39
969 0.44
970 0.48
971 0.52
972 0.54
973 0.53
974 0.56
975 0.59
976 0.56
977 0.51
978 0.47
979 0.46
980 0.37
981 0.39
982 0.35
983 0.29
984 0.27
985 0.27
986 0.25
987 0.2
988 0.2
989 0.16
990 0.2
991 0.21
992 0.18
993 0.18
994 0.17
995 0.2
996 0.28
997 0.28
998 0.26
999 0.29
1000 0.3
1001 0.35
1002 0.35
1003 0.38
1004 0.31
1005 0.35
1006 0.33
1007 0.32
1008 0.34
1009 0.29
1010 0.3
1011 0.25
1012 0.24
1013 0.18
1014 0.21
1015 0.22
1016 0.22
1017 0.21
1018 0.19
1019 0.21
1020 0.25
1021 0.28
1022 0.32
1023 0.37
1024 0.43
1025 0.53
1026 0.54
1027 0.57
1028 0.6
1029 0.64
1030 0.64
1031 0.65
1032 0.63
1033 0.58
1034 0.58
1035 0.55
1036 0.52
1037 0.45
1038 0.37
1039 0.29
1040 0.25
1041 0.24
1042 0.22
1043 0.2
1044 0.17
1045 0.19
1046 0.2
1047 0.22
1048 0.19
1049 0.17
1050 0.19
1051 0.21
1052 0.21
1053 0.2
1054 0.24
1055 0.24
1056 0.26
1057 0.28
1058 0.27
1059 0.26
1060 0.25
1061 0.26
1062 0.22
1063 0.18
1064 0.17
1065 0.13
1066 0.12
1067 0.1
1068 0.12
1069 0.09
1070 0.08
1071 0.07
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.06
1075 0.06
1076 0.04
1077 0.05
1078 0.06
1079 0.07
1080 0.1
1081 0.11
1082 0.14
1083 0.18
1084 0.24
1085 0.3
1086 0.33
1087 0.35
1088 0.4
1089 0.46
1090 0.5
1091 0.5
1092 0.47
1093 0.44
1094 0.43
1095 0.41
1096 0.44
1097 0.42
1098 0.42
1099 0.46
1100 0.52
1101 0.58
1102 0.63
1103 0.72
1104 0.74
1105 0.8
1106 0.82
1107 0.81
1108 0.75
1109 0.71
1110 0.65
1111 0.55
1112 0.44
1113 0.34
1114 0.26
1115 0.19
1116 0.16
1117 0.11
1118 0.11
1119 0.11
1120 0.12
1121 0.13
1122 0.16
1123 0.19
1124 0.21
1125 0.21
1126 0.24
1127 0.3
1128 0.34
1129 0.35
1130 0.34
1131 0.34
1132 0.38
1133 0.38
1134 0.39
1135 0.34
1136 0.34
1137 0.31
1138 0.29
1139 0.29
1140 0.24
1141 0.27
1142 0.24
1143 0.24
1144 0.22
1145 0.3
1146 0.32
1147 0.32
1148 0.32
1149 0.32
1150 0.36
1151 0.37
1152 0.43
1153 0.39
1154 0.4
1155 0.38
1156 0.42
1157 0.42
1158 0.37
1159 0.35
1160 0.25
1161 0.21
1162 0.2
1163 0.21
1164 0.17
1165 0.15
1166 0.19
1167 0.24
1168 0.26
1169 0.27
1170 0.25
1171 0.25
1172 0.24
1173 0.25
1174 0.22
1175 0.24
1176 0.26
1177 0.25
1178 0.25
1179 0.29
1180 0.3
1181 0.27
1182 0.26
1183 0.19