Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MDR2

Protein Details
Accession A0A1C7MDR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
191-211DTSGKKRKGGGDVPKKSKKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-214GKKRKGGGDVPKKSKKAKMAA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MEHHVDSGDFDWDAVENDDNLELWVIRVPEGVKPKHLEDLKLDAPSTSKTSRIGSIDRKHTSYDVWSLGDHDEDESVGGEELRGLSCLLPRQKKGGKLYQAPKPVARHLVISARPTLPTPAHSSDSSSQSSPLTSHNPARFCYPKEVLKHRFMPLGSLAPVEDLSEIEVDAALLVKKPSHQSHTAAQERGDTSGKKRKGGGDVPKKSKKAKMAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.07
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.11
15 0.11
16 0.16
17 0.24
18 0.26
19 0.28
20 0.31
21 0.33
22 0.4
23 0.41
24 0.38
25 0.35
26 0.4
27 0.38
28 0.36
29 0.35
30 0.26
31 0.26
32 0.26
33 0.26
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.21
38 0.25
39 0.27
40 0.31
41 0.35
42 0.41
43 0.49
44 0.49
45 0.49
46 0.47
47 0.44
48 0.39
49 0.33
50 0.29
51 0.22
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.05
73 0.06
74 0.11
75 0.18
76 0.22
77 0.23
78 0.3
79 0.33
80 0.39
81 0.44
82 0.46
83 0.46
84 0.5
85 0.55
86 0.55
87 0.57
88 0.53
89 0.5
90 0.45
91 0.41
92 0.36
93 0.31
94 0.25
95 0.21
96 0.24
97 0.22
98 0.21
99 0.21
100 0.18
101 0.18
102 0.17
103 0.18
104 0.13
105 0.14
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.21
110 0.24
111 0.25
112 0.28
113 0.27
114 0.23
115 0.2
116 0.18
117 0.18
118 0.15
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.24
123 0.27
124 0.29
125 0.29
126 0.35
127 0.36
128 0.34
129 0.38
130 0.36
131 0.37
132 0.42
133 0.51
134 0.51
135 0.54
136 0.56
137 0.51
138 0.5
139 0.44
140 0.4
141 0.33
142 0.3
143 0.24
144 0.19
145 0.17
146 0.14
147 0.14
148 0.11
149 0.09
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.1
164 0.17
165 0.22
166 0.27
167 0.31
168 0.34
169 0.41
170 0.51
171 0.54
172 0.5
173 0.45
174 0.45
175 0.41
176 0.4
177 0.37
178 0.3
179 0.31
180 0.39
181 0.43
182 0.41
183 0.44
184 0.47
185 0.51
186 0.58
187 0.62
188 0.63
189 0.7
190 0.76
191 0.81
192 0.81
193 0.79
194 0.77