Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MCV3

Protein Details
Accession A0A1C7MCV3    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
423-445SSAPAKPRVRSRLERRGNVPWNRHydrophilic
455-479VRASPLFKAPRNRKRREMRHDVESIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
258-271KDGDKKGKGKDKPK
425-435APAKPRVRSRL
464-470PRNRKRR
Subcellular Location(s) nucl 12.5cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd08029  LA_like_fungal  
Amino Acid Sequences MAVVITDTKVPGTTQEEVAAIAPIAMDTDSTVDAVKPEETSTEDDNEKMLRAMRQIEFYFADSNLPYDKFMWSLHTANPDHWVPVKTVASFKRMREFQPLGVEWAAKALRLSEELEVDEAGVNVRRKTEVQEPKGQFERSVYAKGFGNEEPGLQKRLEDFFNKYGRTNAVRMRRRDDTKEFKLGLRGVRRLQICRRVPASGPEAHLGWTGVAYHVKGSILRHEIKEKGLTGKAAVIRKQNIAGPGRKGFNAFKEMDQKDGDKKGKGKDKPKPEIWLEFLGNKIRVHEEDGGSLKPEDIPFVKGASLRFDGAGEDVSFDEIKGTLRERFSRAPFVKYTKGDSWGLVGFDKALSEDEITHVKDSLKTLSGKEVTWTVPDEEQEKAFQIERAIGAAKRTLSFAQNREHGGVEEDGRREGDKKEGESSAPAKPRVRSRLERRGNVPWNRMADPVWVCAVRASPLFKAPRNRKRREMRHDVESIVRPRTCVSRSRHNIETQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.18
7 0.13
8 0.1
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.05
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.14
27 0.18
28 0.21
29 0.23
30 0.24
31 0.23
32 0.24
33 0.24
34 0.22
35 0.19
36 0.19
37 0.17
38 0.2
39 0.26
40 0.26
41 0.32
42 0.32
43 0.34
44 0.32
45 0.32
46 0.3
47 0.24
48 0.24
49 0.18
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.2
59 0.21
60 0.22
61 0.24
62 0.31
63 0.31
64 0.3
65 0.35
66 0.31
67 0.28
68 0.3
69 0.28
70 0.21
71 0.27
72 0.29
73 0.25
74 0.31
75 0.32
76 0.35
77 0.39
78 0.41
79 0.43
80 0.44
81 0.46
82 0.48
83 0.49
84 0.46
85 0.49
86 0.47
87 0.41
88 0.38
89 0.36
90 0.26
91 0.27
92 0.22
93 0.14
94 0.14
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.15
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.21
115 0.3
116 0.36
117 0.4
118 0.49
119 0.51
120 0.55
121 0.6
122 0.56
123 0.46
124 0.38
125 0.37
126 0.29
127 0.32
128 0.26
129 0.23
130 0.25
131 0.25
132 0.26
133 0.21
134 0.23
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.19
139 0.21
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.24
147 0.29
148 0.34
149 0.35
150 0.33
151 0.33
152 0.34
153 0.34
154 0.33
155 0.33
156 0.38
157 0.44
158 0.48
159 0.51
160 0.55
161 0.57
162 0.6
163 0.62
164 0.61
165 0.6
166 0.64
167 0.59
168 0.52
169 0.51
170 0.47
171 0.44
172 0.4
173 0.38
174 0.33
175 0.37
176 0.38
177 0.39
178 0.43
179 0.47
180 0.44
181 0.45
182 0.45
183 0.42
184 0.4
185 0.39
186 0.37
187 0.3
188 0.29
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.2
193 0.15
194 0.11
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.12
206 0.16
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.24
212 0.26
213 0.22
214 0.21
215 0.2
216 0.18
217 0.15
218 0.18
219 0.2
220 0.21
221 0.22
222 0.23
223 0.24
224 0.25
225 0.25
226 0.24
227 0.24
228 0.26
229 0.26
230 0.25
231 0.26
232 0.27
233 0.26
234 0.27
235 0.23
236 0.22
237 0.24
238 0.21
239 0.2
240 0.28
241 0.28
242 0.29
243 0.28
244 0.27
245 0.26
246 0.32
247 0.32
248 0.27
249 0.31
250 0.35
251 0.43
252 0.48
253 0.54
254 0.55
255 0.63
256 0.67
257 0.67
258 0.66
259 0.6
260 0.57
261 0.51
262 0.47
263 0.37
264 0.3
265 0.29
266 0.25
267 0.24
268 0.2
269 0.18
270 0.16
271 0.15
272 0.18
273 0.2
274 0.17
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.17
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.16
293 0.14
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.12
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.16
312 0.19
313 0.23
314 0.29
315 0.31
316 0.4
317 0.4
318 0.41
319 0.42
320 0.45
321 0.47
322 0.43
323 0.46
324 0.38
325 0.4
326 0.36
327 0.32
328 0.3
329 0.24
330 0.23
331 0.17
332 0.14
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.2
353 0.25
354 0.26
355 0.24
356 0.24
357 0.24
358 0.21
359 0.21
360 0.22
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.17
381 0.15
382 0.17
383 0.18
384 0.21
385 0.27
386 0.3
387 0.34
388 0.37
389 0.38
390 0.38
391 0.37
392 0.32
393 0.28
394 0.26
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.21
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.2
403 0.25
404 0.25
405 0.27
406 0.31
407 0.32
408 0.32
409 0.35
410 0.37
411 0.36
412 0.38
413 0.41
414 0.4
415 0.44
416 0.52
417 0.55
418 0.61
419 0.64
420 0.68
421 0.74
422 0.79
423 0.81
424 0.78
425 0.8
426 0.81
427 0.78
428 0.74
429 0.69
430 0.65
431 0.59
432 0.55
433 0.45
434 0.43
435 0.36
436 0.33
437 0.3
438 0.25
439 0.23
440 0.23
441 0.23
442 0.19
443 0.2
444 0.21
445 0.19
446 0.27
447 0.33
448 0.38
449 0.47
450 0.56
451 0.63
452 0.71
453 0.77
454 0.8
455 0.85
456 0.9
457 0.9
458 0.9
459 0.86
460 0.83
461 0.79
462 0.72
463 0.68
464 0.65
465 0.6
466 0.56
467 0.5
468 0.42
469 0.41
470 0.45
471 0.42
472 0.42
473 0.44
474 0.47
475 0.56
476 0.62