Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MCI2

Protein Details
Accession A0A1C7MCI2    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-38KATSETPSKVVKRKSTKPEKAEKTAKDNKRKNASVDHydrophilic
49-70EKETQKELKKAKRGKRVEVQAEBasic
75-102EENEMPKESKKTKRRKRVEPQTEERGQVBasic
135-158EEETQKESKKPKKGKRVQVQEDIEHydrophilic
265-286GTVTRLRLSRNKKTGRSKHYAFHydrophilic
356-381QEKAEQRLLKRQSQRKRKLEEAGIKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-34VKRKSTKPEKAEKTAKDNKRKN
54-64KELKKAKRGKR
81-94KESKKTKRRKRVEP
107-121AKEMQKELKKTKKGK
142-150SKKPKKGKR
226-235KRKLEKAKRK
366-372RQSQRKR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKATSETPSKVVKRKSTKPEKAEKTAKDNKRKNASVDEIEEGKHAEEEKETQKELKKAKRGKRVEVQAEGNHVEENEMPKESKKTKRRKRVEPQTEERGQVEKEEAKEMQKELKKTKKGKHVEIEEEEREHVEEEETQKESKKPKKGKRVQVQEDIEQVSKKTRKEKHIEAQEETEVQEEQPEPEFFGFSSDDDDSSDDDEVPDEIPGIDVGKLPTIAKDDATVKRKLEKAKRKPTGDHGVIYLGRIPHGFYEDQMRAYFSQFGTVTRLRLSRNKKTGRSKHYAFIEFDSSSVAKIVADTMDNYLLMGHILTCKVIPKDEVHPELWIGANRKWRVVPRDRIARVHHNKPRTEEEQEKAEQRLLKRQSQRKRKLEEAGIKYDFEAVSYKKRSKPTEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.73
3 0.8
4 0.83
5 0.86
6 0.87
7 0.89
8 0.88
9 0.88
10 0.88
11 0.83
12 0.82
13 0.83
14 0.83
15 0.83
16 0.83
17 0.82
18 0.83
19 0.81
20 0.77
21 0.76
22 0.73
23 0.68
24 0.63
25 0.57
26 0.48
27 0.44
28 0.39
29 0.3
30 0.23
31 0.19
32 0.16
33 0.13
34 0.14
35 0.19
36 0.25
37 0.29
38 0.3
39 0.34
40 0.39
41 0.45
42 0.53
43 0.56
44 0.59
45 0.65
46 0.73
47 0.78
48 0.8
49 0.81
50 0.82
51 0.83
52 0.8
53 0.77
54 0.73
55 0.64
56 0.62
57 0.54
58 0.44
59 0.34
60 0.27
61 0.21
62 0.17
63 0.18
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.26
69 0.33
70 0.41
71 0.48
72 0.57
73 0.66
74 0.77
75 0.84
76 0.88
77 0.91
78 0.93
79 0.94
80 0.93
81 0.9
82 0.88
83 0.82
84 0.73
85 0.63
86 0.55
87 0.44
88 0.35
89 0.31
90 0.25
91 0.23
92 0.24
93 0.24
94 0.23
95 0.26
96 0.26
97 0.3
98 0.31
99 0.36
100 0.41
101 0.5
102 0.56
103 0.62
104 0.69
105 0.71
106 0.75
107 0.77
108 0.77
109 0.75
110 0.73
111 0.7
112 0.68
113 0.59
114 0.52
115 0.44
116 0.35
117 0.28
118 0.21
119 0.16
120 0.1
121 0.11
122 0.12
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.22
128 0.31
129 0.36
130 0.43
131 0.51
132 0.59
133 0.7
134 0.77
135 0.84
136 0.85
137 0.88
138 0.86
139 0.85
140 0.79
141 0.69
142 0.63
143 0.54
144 0.44
145 0.34
146 0.27
147 0.25
148 0.25
149 0.26
150 0.32
151 0.37
152 0.45
153 0.52
154 0.6
155 0.62
156 0.68
157 0.69
158 0.62
159 0.58
160 0.5
161 0.43
162 0.34
163 0.26
164 0.16
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.11
208 0.15
209 0.21
210 0.26
211 0.27
212 0.26
213 0.3
214 0.35
215 0.41
216 0.47
217 0.51
218 0.58
219 0.67
220 0.74
221 0.74
222 0.73
223 0.73
224 0.73
225 0.64
226 0.54
227 0.44
228 0.38
229 0.34
230 0.3
231 0.24
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.15
241 0.16
242 0.18
243 0.17
244 0.19
245 0.16
246 0.18
247 0.2
248 0.13
249 0.17
250 0.15
251 0.16
252 0.2
253 0.21
254 0.21
255 0.2
256 0.23
257 0.22
258 0.3
259 0.38
260 0.42
261 0.51
262 0.59
263 0.65
264 0.74
265 0.8
266 0.81
267 0.81
268 0.75
269 0.72
270 0.71
271 0.66
272 0.57
273 0.5
274 0.46
275 0.37
276 0.33
277 0.28
278 0.21
279 0.16
280 0.15
281 0.12
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.11
302 0.12
303 0.14
304 0.16
305 0.18
306 0.25
307 0.32
308 0.36
309 0.33
310 0.32
311 0.31
312 0.3
313 0.29
314 0.26
315 0.22
316 0.23
317 0.3
318 0.31
319 0.33
320 0.36
321 0.41
322 0.47
323 0.53
324 0.59
325 0.6
326 0.69
327 0.7
328 0.72
329 0.72
330 0.74
331 0.72
332 0.73
333 0.72
334 0.69
335 0.7
336 0.7
337 0.71
338 0.65
339 0.65
340 0.62
341 0.58
342 0.57
343 0.57
344 0.55
345 0.49
346 0.47
347 0.44
348 0.4
349 0.45
350 0.44
351 0.49
352 0.56
353 0.63
354 0.7
355 0.76
356 0.84
357 0.84
358 0.86
359 0.85
360 0.84
361 0.85
362 0.84
363 0.8
364 0.78
365 0.7
366 0.62
367 0.54
368 0.49
369 0.38
370 0.29
371 0.27
372 0.21
373 0.29
374 0.36
375 0.43
376 0.46
377 0.55