Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M345

Protein Details
Accession A0A1C7M345    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-278AAEPQERAGVRRRRRRRAVYVLVMLCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-269GVRRRRRRR
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, mito 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032281  40S_SA_C  
IPR001865  Ribosomal_S2  
IPR018130  Ribosomal_S2_CS  
IPR005707  Ribosomal_S2_euk/arc  
IPR023591  Ribosomal_S2_flav_dom_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16122  40S_SA_C  
PF00318  Ribosomal_S2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00962  RIBOSOMAL_S2_1  
CDD cd01425  RPS2  
Amino Acid Sequences MSSKLPSVLSATDEEIQLLLAAQSHIGSKNCDKQMLPYVWKRRSDGIHVLNIGKTWEKLVFAARIIAAIENPNDVCVISARPYGHRAVLKYAANTGAQAIAGRFTPWTTRRSARRPTSTSPLSHSATPTRPQVCRRRYSHQQQIPPFHRSGVVASRARGAPPPRHHPSHLRRLECYGGYVLLYRDPEEVEKQQQEEAQAKAAAAGEQAEVVPNEWDVTSAPQAGGINPGLVATEGGALDWSAEPTNAGPTDWAAEPQERAGVRRRRRRRAVYVLVMLCFLQRVVPKANIAVESLGSRCTPISLQFNMRQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.14
4 0.12
5 0.1
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.12
13 0.13
14 0.18
15 0.24
16 0.33
17 0.35
18 0.38
19 0.37
20 0.39
21 0.47
22 0.49
23 0.5
24 0.5
25 0.58
26 0.61
27 0.65
28 0.63
29 0.6
30 0.57
31 0.57
32 0.57
33 0.53
34 0.52
35 0.5
36 0.48
37 0.42
38 0.38
39 0.33
40 0.24
41 0.19
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.18
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.1
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.13
67 0.14
68 0.16
69 0.19
70 0.2
71 0.24
72 0.25
73 0.24
74 0.26
75 0.3
76 0.3
77 0.28
78 0.28
79 0.25
80 0.22
81 0.21
82 0.16
83 0.11
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.12
93 0.15
94 0.17
95 0.21
96 0.28
97 0.36
98 0.43
99 0.53
100 0.56
101 0.62
102 0.65
103 0.66
104 0.67
105 0.63
106 0.57
107 0.52
108 0.48
109 0.41
110 0.36
111 0.33
112 0.29
113 0.28
114 0.3
115 0.31
116 0.29
117 0.31
118 0.38
119 0.46
120 0.49
121 0.54
122 0.56
123 0.59
124 0.64
125 0.7
126 0.73
127 0.7
128 0.7
129 0.67
130 0.71
131 0.68
132 0.62
133 0.53
134 0.42
135 0.36
136 0.29
137 0.25
138 0.2
139 0.22
140 0.2
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.23
146 0.22
147 0.24
148 0.28
149 0.37
150 0.39
151 0.42
152 0.45
153 0.51
154 0.55
155 0.58
156 0.59
157 0.53
158 0.49
159 0.49
160 0.49
161 0.39
162 0.33
163 0.22
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.15
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.2
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.11
190 0.08
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.19
245 0.17
246 0.19
247 0.27
248 0.35
249 0.43
250 0.54
251 0.64
252 0.7
253 0.8
254 0.88
255 0.88
256 0.89
257 0.89
258 0.86
259 0.85
260 0.76
261 0.66
262 0.57
263 0.46
264 0.36
265 0.26
266 0.17
267 0.12
268 0.12
269 0.16
270 0.2
271 0.23
272 0.24
273 0.27
274 0.3
275 0.27
276 0.26
277 0.23
278 0.19
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.18
288 0.23
289 0.27
290 0.34