FuNGI

A0A1C7MS00

Protein Details

Accession

A0A1C7MS00

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-52	LPLPSVKGKKKVASKKTIKFGTL	Hydrophilic
767-789	RPSWSGFDKRKYRKGNGAPPAGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-44	GKKKVASK

Subcellular Location(s)

extr 9, nucl 8, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011044 Quino_amine_DH_bsu IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MVETTTVSVHRCRFVDFTPSAITALCFPPLPLPSVKGKKKVASKKTIKFGTLAVGRANGNIELCEWTGSNAKTQAWQAWVVKKTLSGPCPSKVESLAFTIRFPDSEDEVPSWSNLRLFSAGGGSELAEWDIERGCIKRTISSQGGTIWSVSPNPASTLLALGCEDGSVRLLSLQHDGLTHLRRLDRIKSRILSIAWGPPVPRQTTSDRTQNASSDSDDDDDDEDNWTDSWLVTGCSDSSLRKWDIATGRVLDRMGTDKIRGERTLVWTVGVLGDGTVVSGDSMGMVKFWDSRTCTQTQSFQGHGADVLCLTVSPEGNAVYTSGVDQKVTQFSHVKTSRPENASLLSRPSGHWVQSCSRRLHSHDVRALAIWPPHTPLPSAYKRHFAVDVAPVLASGAWTCPWCTAATYEDSYHRRMAYSSGPYSTSAVHLARQARLLLCTRDSGLTVWRILRRQPSDDEDAEDLDSPSREGGWERVLDMDLNVQTNIVAGAISDNGRWVAVSDWYETKLFELVEEKNGDLKPKRIRDFASIIHGHLSGSSSSTGSSSLTFTPDSSKLVLATSASSRVVIVELGSGDRSSRVLRVFEQHRMRDGLVRDRVIRGRKGDEDAQIENAATVMSDDDFDSVETVKTTITRMAVSADGQWLATSDDLCRTHVFNLDSVQHHCVLPSFPQAIHVLTFDPATPNTLVLGLANNAIEIYDVELRQFPRWSRALPQRFTHLHDPLLGVTFNPAPRTGEQKGSSAGAPLKQALFWGATWLCRMRLSDRPSWSGFDKRKYRKGNGAPPAGPNGKIEVSLEEGQQQQENSFRMVTQYRPVLFVDYLAPGELVVVERPLVDVLAKLPPAYFKPKYGAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.4
3	0.35
4	0.35
5	0.33
6	0.33
7	0.3
8	0.27
9	0.25
10	0.19
11	0.2
12	0.17
13	0.14
14	0.13
15	0.18
16	0.19
17	0.22
18	0.21
19	0.23
20	0.32
21	0.43
22	0.49
23	0.53
24	0.58
25	0.62
26	0.71
27	0.78
28	0.78
29	0.78
30	0.82
31	0.82
32	0.85
33	0.83
34	0.74
35	0.65
36	0.57
37	0.54
38	0.48
39	0.41
40	0.32
41	0.29
42	0.28
43	0.27
44	0.27
45	0.2
46	0.16
47	0.14
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.12
53	0.13
54	0.19
55	0.19
56	0.23
57	0.23
58	0.24
59	0.26
60	0.28
61	0.3
62	0.27
63	0.32
64	0.33
65	0.38
66	0.4
67	0.38
68	0.36
69	0.34
70	0.37
71	0.39
72	0.38
73	0.38
74	0.4
75	0.43
76	0.48
77	0.48
78	0.44
79	0.39
80	0.38
81	0.32
82	0.33
83	0.34
84	0.3
85	0.28
86	0.28
87	0.26
88	0.23
89	0.24
90	0.23
91	0.21
92	0.22
93	0.25
94	0.23
95	0.24
96	0.24
97	0.22
98	0.2
99	0.17
100	0.17
101	0.15
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.15
106	0.14
107	0.13
108	0.12
109	0.12
110	0.09
111	0.08
112	0.08
113	0.08
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.09
120	0.1
121	0.12
122	0.17
123	0.18
124	0.22
125	0.25
126	0.32
127	0.34
128	0.34
129	0.33
130	0.31
131	0.32
132	0.27
133	0.25
134	0.19
135	0.16
136	0.16
137	0.15
138	0.14
139	0.12
140	0.14
141	0.14
142	0.13
143	0.12
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.1
149	0.08
150	0.08
151	0.07
152	0.06
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.08
158	0.1
159	0.12
160	0.13
161	0.12
162	0.12
163	0.14
164	0.18
165	0.21
166	0.21
167	0.22
168	0.23
169	0.26
170	0.3
171	0.37
172	0.42
173	0.43
174	0.49
175	0.48
176	0.49
177	0.49
178	0.45
179	0.39
180	0.32
181	0.33
182	0.27
183	0.26
184	0.24
185	0.23
186	0.28
187	0.27
188	0.26
189	0.25
190	0.29
191	0.35
192	0.4
193	0.45
194	0.42
195	0.44
196	0.44
197	0.42
198	0.39
199	0.33
200	0.3
201	0.23
202	0.22
203	0.19
204	0.17
205	0.16
206	0.14
207	0.13
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.06
218	0.07
219	0.06
220	0.07
221	0.07
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.17
227	0.18
228	0.19
229	0.19
230	0.23
231	0.26
232	0.27
233	0.28
234	0.25
235	0.25
236	0.25
237	0.25
238	0.19
239	0.16
240	0.17
241	0.17
242	0.15
243	0.16
244	0.18
245	0.22
246	0.25
247	0.25
248	0.24
249	0.25
250	0.3
251	0.33
252	0.28
253	0.25
254	0.21
255	0.21
256	0.19
257	0.15
258	0.09
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.07
275	0.08
276	0.12
277	0.15
278	0.19
279	0.24
280	0.26
281	0.29
282	0.29
283	0.33
284	0.35
285	0.34
286	0.32
287	0.3
288	0.28
289	0.25
290	0.24
291	0.18
292	0.13
293	0.09
294	0.08
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.15
315	0.15
316	0.17
317	0.18
318	0.19
319	0.29
320	0.3
321	0.3
322	0.3
323	0.36
324	0.4
325	0.39
326	0.39
327	0.31
328	0.32
329	0.33
330	0.3
331	0.27
332	0.21
333	0.19
334	0.17
335	0.21
336	0.2
337	0.18
338	0.19
339	0.2
340	0.25
341	0.33
342	0.38
343	0.36
344	0.37
345	0.39
346	0.42
347	0.48
348	0.48
349	0.47
350	0.45
351	0.44
352	0.41
353	0.38
354	0.34
355	0.26
356	0.22
357	0.15
358	0.12
359	0.12
360	0.13
361	0.13
362	0.12
363	0.12
364	0.19
365	0.25
366	0.3
367	0.3
368	0.35
369	0.35
370	0.36
371	0.35
372	0.27
373	0.23
374	0.21
375	0.2
376	0.14
377	0.13
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.07
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.11
394	0.12
395	0.13
396	0.18
397	0.2
398	0.21
399	0.21
400	0.2
401	0.18
402	0.17
403	0.18
404	0.17
405	0.2
406	0.19
407	0.19
408	0.19
409	0.2
410	0.2
411	0.18
412	0.14
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.13
417	0.15
418	0.15
419	0.15
420	0.15
421	0.13
422	0.15
423	0.16
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.14
435	0.15
436	0.16
437	0.18
438	0.25
439	0.26
440	0.27
441	0.29
442	0.31
443	0.34
444	0.33
445	0.33
446	0.26
447	0.24
448	0.21
449	0.18
450	0.14
451	0.09
452	0.09
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.07
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.1
467	0.08
468	0.09
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.04
475	0.03
476	0.02
477	0.03
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.07
488	0.08
489	0.1
490	0.11
491	0.13
492	0.13
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.09
498	0.11
499	0.1
500	0.14
501	0.15
502	0.14
503	0.17
504	0.17
505	0.21
506	0.2
507	0.26
508	0.3
509	0.38
510	0.41
511	0.41
512	0.43
513	0.44
514	0.47
515	0.43
516	0.42
517	0.35
518	0.31
519	0.29
520	0.26
521	0.21
522	0.16
523	0.16
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.14
539	0.14
540	0.15
541	0.14
542	0.14
543	0.13
544	0.13
545	0.13
546	0.09
547	0.1
548	0.09
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.07
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.1
567	0.12
568	0.13
569	0.15
570	0.23
571	0.26
572	0.34
573	0.41
574	0.4
575	0.41
576	0.41
577	0.4
578	0.38
579	0.37
580	0.37
581	0.34
582	0.35
583	0.33
584	0.35
585	0.4
586	0.4
587	0.41
588	0.36
589	0.36
590	0.36
591	0.39
592	0.4
593	0.39
594	0.37
595	0.34
596	0.32
597	0.28
598	0.25
599	0.2
600	0.16
601	0.11
602	0.06
603	0.05
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.1
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.12
624	0.13
625	0.13
626	0.13
627	0.12
628	0.11
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.08
633	0.08
634	0.07
635	0.07
636	0.13
637	0.14
638	0.16
639	0.17
640	0.17
641	0.19
642	0.23
643	0.24
644	0.19
645	0.22
646	0.25
647	0.26
648	0.27
649	0.28
650	0.24
651	0.23
652	0.22
653	0.2
654	0.17
655	0.17
656	0.19
657	0.18
658	0.17
659	0.2
660	0.21
661	0.2
662	0.19
663	0.18
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.1
668	0.11
669	0.1
670	0.13
671	0.12
672	0.11
673	0.11
674	0.11
675	0.11
676	0.09
677	0.1
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.05
686	0.08
687	0.1
688	0.1
689	0.11
690	0.15
691	0.17
692	0.2
693	0.24
694	0.23
695	0.27
696	0.3
697	0.31
698	0.37
699	0.46
700	0.52
701	0.54
702	0.55
703	0.57
704	0.56
705	0.6
706	0.59
707	0.51
708	0.43
709	0.4
710	0.38
711	0.3
712	0.3
713	0.23
714	0.16
715	0.15
716	0.17
717	0.17
718	0.17
719	0.17
720	0.18
721	0.2
722	0.28
723	0.28
724	0.33
725	0.33
726	0.34
727	0.36
728	0.34
729	0.33
730	0.29
731	0.29
732	0.23
733	0.23
734	0.22
735	0.21
736	0.19
737	0.19
738	0.16
739	0.15
740	0.13
741	0.17
742	0.16
743	0.16
744	0.2
745	0.21
746	0.21
747	0.22
748	0.24
749	0.23
750	0.31
751	0.37
752	0.41
753	0.45
754	0.49
755	0.49
756	0.5
757	0.5
758	0.52
759	0.52
760	0.55
761	0.6
762	0.64
763	0.71
764	0.76
765	0.79
766	0.8
767	0.83
768	0.83
769	0.82
770	0.82
771	0.74
772	0.69
773	0.69
774	0.61
775	0.52
776	0.42
777	0.37
778	0.29
779	0.27
780	0.25
781	0.18
782	0.22
783	0.23
784	0.22
785	0.21
786	0.23
787	0.24
788	0.25
789	0.24
790	0.2
791	0.23
792	0.24
793	0.23
794	0.21
795	0.2
796	0.23
797	0.25
798	0.26
799	0.29
800	0.34
801	0.33
802	0.34
803	0.35
804	0.34
805	0.31
806	0.29
807	0.24
808	0.19
809	0.18
810	0.16
811	0.15
812	0.11
813	0.11
814	0.1
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.09
821	0.09
822	0.09
823	0.08
824	0.08
825	0.09
826	0.15
827	0.15
828	0.15
829	0.15
830	0.19
831	0.24
832	0.32
833	0.33
834	0.32

A0A1C7MS00

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer