Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MHS9

Protein Details
Accession A0A1C7MHS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-172PESVWNPPKKPKQSRYERWQQKNDRQGRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MAPQKRKIADLDDSDDEEPVLGKQVLPVANLPDSFHGVPADGLQYLFMVRRDARALPNVTRVTNPYEIPEKNADISVQPSDAIRSSNVLPSEEWRGTFLRRFKNFRKNSTQSTIHVRIPHADTSRRMMPDKKDREAWWAFLTGQPESVWNPPKKPKQSRYERWQQKNDRQGRGMRGFSSDPDGPSISHNFHEADASAMRASAQTWRVSDDGEVELVDEVKPAGSLPTPDAAPEPQAIPFEVAQTGEPPALRVTPEPTPSLMHCIDHRYALHLLMYFTHWINIHLEQPDLALSDFTVVHARWMFNLLSRVDDYISGDEASLLRNLARACMSLIVELKRRRNAKDSAEVSQAKIETFGWMLRRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.32
4 0.25
5 0.19
6 0.13
7 0.14
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.17
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.2
16 0.23
17 0.23
18 0.23
19 0.2
20 0.24
21 0.22
22 0.22
23 0.18
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.15
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.11
34 0.1
35 0.13
36 0.14
37 0.17
38 0.2
39 0.22
40 0.26
41 0.31
42 0.35
43 0.34
44 0.42
45 0.41
46 0.39
47 0.38
48 0.37
49 0.35
50 0.34
51 0.31
52 0.27
53 0.31
54 0.3
55 0.33
56 0.34
57 0.3
58 0.28
59 0.28
60 0.25
61 0.19
62 0.21
63 0.18
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.24
79 0.23
80 0.21
81 0.2
82 0.21
83 0.23
84 0.28
85 0.33
86 0.36
87 0.42
88 0.5
89 0.57
90 0.66
91 0.7
92 0.73
93 0.76
94 0.72
95 0.72
96 0.72
97 0.67
98 0.59
99 0.61
100 0.57
101 0.5
102 0.47
103 0.4
104 0.36
105 0.35
106 0.38
107 0.32
108 0.31
109 0.3
110 0.32
111 0.36
112 0.35
113 0.34
114 0.34
115 0.39
116 0.46
117 0.51
118 0.49
119 0.49
120 0.48
121 0.53
122 0.5
123 0.44
124 0.35
125 0.29
126 0.26
127 0.23
128 0.24
129 0.16
130 0.15
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.17
135 0.22
136 0.22
137 0.27
138 0.35
139 0.44
140 0.53
141 0.61
142 0.65
143 0.68
144 0.77
145 0.82
146 0.82
147 0.85
148 0.85
149 0.84
150 0.85
151 0.83
152 0.81
153 0.81
154 0.8
155 0.73
156 0.67
157 0.62
158 0.59
159 0.55
160 0.49
161 0.39
162 0.34
163 0.3
164 0.26
165 0.27
166 0.2
167 0.16
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.13
240 0.16
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.21
245 0.2
246 0.25
247 0.22
248 0.2
249 0.19
250 0.23
251 0.22
252 0.24
253 0.23
254 0.21
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.16
259 0.16
260 0.14
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.11
283 0.1
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.18
289 0.17
290 0.18
291 0.22
292 0.19
293 0.2
294 0.21
295 0.21
296 0.19
297 0.19
298 0.18
299 0.16
300 0.17
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.22
319 0.24
320 0.31
321 0.38
322 0.44
323 0.49
324 0.54
325 0.56
326 0.59
327 0.63
328 0.63
329 0.66
330 0.63
331 0.6
332 0.63
333 0.59
334 0.54
335 0.5
336 0.43
337 0.32
338 0.29
339 0.24
340 0.18
341 0.18
342 0.2