Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7MFB6

Protein Details
Accession A0A1C7MFB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-279SDTPSKRKSKTKIQRKWGDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-244NRLRGRGARPGRRGQG
265-270KRKSKT
Subcellular Location(s) extr 10, cyto 8, cyto_nucl 7.833, nucl 6.5, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR007222  Sig_recog_particle_rcpt_asu_N  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0005785  C:signal recognition particle receptor complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04086  SRP-alpha_N  
PF00448  SRP54  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
CDD cd14826  SR_alpha_SRX  
cd17876  SRalpha_C  
Amino Acid Sequences TYDFLQWQVQVPGLRFPPVLVETVMLDHCSISHKGGVVLWSRSFTPAASQIAASSASPVNSLIREVLIEGRNSDDKFEKDGYAVKWTFVNDLELIFVVAYQRILQLTYVDELLAALKTLFVKLFQPFLATFVASLHAVSNAKVTPIAGETTASWNFAKVLDGWDSVFDKLLRGLEDKAAQERRAHPSHPPRPILDASPPSDDTSTIPSQSSSTVLDEEQIARNVQALKNRLRGRGARPGRRGQGRTDAGNGRDSLPGSDSDTPSKRKSKTKIQRKWGDEAPTESDMASLDFSYDSSASDGHSGLLDVSALVDKGSLGTRTQDGLLGFSSNKADDVIAEVLKKTAQEAKPTSSGSLGALGSIFARLTGSKVLTQEDLKPVLEAMKQHLMKKNVAKEISEKSLIGKKVGGFQTTNAAVRLALSNSLTRILTPKTSTDLLLSIRTKLSSPLPSSQQRLPYSITFVGVNGVGKSTNLSKVCFWLIQNGLKVLIAACDTFRSGAVEQLRVHVRNLSMLGVNGATNSRGRVELYERGYGKDAAGIAKEAIAYARDNDFDCSHRHSGRMQDNEPLMRALAKLVAANNPDKIIFVGEALVGNEAVDQLTKFDRALRDFSASSGGQERGIDGMLVTKWDTVDDKGVGAALSMTYVTGQPIIFVGCGQTYTDLRQLRVSNVVQAILSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.25
4 0.27
5 0.25
6 0.26
7 0.19
8 0.19
9 0.17
10 0.19
11 0.2
12 0.15
13 0.13
14 0.11
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.24
24 0.24
25 0.27
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.26
31 0.21
32 0.21
33 0.22
34 0.24
35 0.23
36 0.22
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.22
58 0.26
59 0.26
60 0.28
61 0.27
62 0.26
63 0.3
64 0.32
65 0.28
66 0.25
67 0.31
68 0.29
69 0.34
70 0.32
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.28
75 0.23
76 0.24
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.12
109 0.13
110 0.16
111 0.14
112 0.17
113 0.16
114 0.18
115 0.18
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.13
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.17
154 0.14
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.2
163 0.21
164 0.26
165 0.29
166 0.29
167 0.32
168 0.36
169 0.4
170 0.4
171 0.4
172 0.42
173 0.49
174 0.56
175 0.59
176 0.57
177 0.51
178 0.53
179 0.54
180 0.47
181 0.43
182 0.4
183 0.34
184 0.35
185 0.34
186 0.3
187 0.28
188 0.26
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.2
213 0.23
214 0.27
215 0.36
216 0.4
217 0.4
218 0.42
219 0.45
220 0.46
221 0.51
222 0.55
223 0.56
224 0.58
225 0.62
226 0.65
227 0.68
228 0.64
229 0.57
230 0.58
231 0.52
232 0.47
233 0.45
234 0.41
235 0.35
236 0.35
237 0.32
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.16
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.17
246 0.16
247 0.2
248 0.24
249 0.27
250 0.32
251 0.38
252 0.4
253 0.44
254 0.5
255 0.56
256 0.63
257 0.7
258 0.75
259 0.78
260 0.82
261 0.78
262 0.77
263 0.71
264 0.67
265 0.57
266 0.51
267 0.44
268 0.36
269 0.32
270 0.26
271 0.2
272 0.14
273 0.13
274 0.1
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.13
331 0.14
332 0.2
333 0.22
334 0.25
335 0.28
336 0.28
337 0.28
338 0.21
339 0.2
340 0.14
341 0.14
342 0.1
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.06
354 0.07
355 0.09
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.15
361 0.16
362 0.17
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.13
370 0.19
371 0.21
372 0.25
373 0.3
374 0.31
375 0.34
376 0.39
377 0.42
378 0.4
379 0.39
380 0.36
381 0.35
382 0.36
383 0.35
384 0.31
385 0.25
386 0.22
387 0.26
388 0.26
389 0.22
390 0.2
391 0.17
392 0.23
393 0.25
394 0.24
395 0.19
396 0.19
397 0.23
398 0.23
399 0.23
400 0.16
401 0.14
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.11
411 0.1
412 0.09
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.18
421 0.16
422 0.17
423 0.16
424 0.2
425 0.19
426 0.18
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.17
431 0.2
432 0.2
433 0.23
434 0.26
435 0.32
436 0.36
437 0.39
438 0.41
439 0.44
440 0.4
441 0.39
442 0.38
443 0.33
444 0.33
445 0.29
446 0.27
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.13
451 0.13
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.09
458 0.15
459 0.15
460 0.17
461 0.17
462 0.2
463 0.22
464 0.23
465 0.21
466 0.21
467 0.24
468 0.26
469 0.27
470 0.24
471 0.23
472 0.21
473 0.2
474 0.14
475 0.11
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.15
486 0.17
487 0.2
488 0.2
489 0.24
490 0.29
491 0.27
492 0.27
493 0.25
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.19
498 0.15
499 0.14
500 0.14
501 0.11
502 0.11
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.1
510 0.1
511 0.13
512 0.17
513 0.23
514 0.26
515 0.32
516 0.32
517 0.33
518 0.35
519 0.32
520 0.27
521 0.23
522 0.2
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.1
534 0.11
535 0.12
536 0.13
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.2
541 0.25
542 0.3
543 0.29
544 0.3
545 0.31
546 0.39
547 0.46
548 0.51
549 0.45
550 0.46
551 0.49
552 0.48
553 0.46
554 0.37
555 0.29
556 0.22
557 0.2
558 0.14
559 0.12
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.17
564 0.19
565 0.21
566 0.22
567 0.21
568 0.2
569 0.19
570 0.18
571 0.15
572 0.12
573 0.1
574 0.1
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.09
588 0.1
589 0.11
590 0.15
591 0.21
592 0.24
593 0.28
594 0.29
595 0.32
596 0.31
597 0.32
598 0.33
599 0.27
600 0.26
601 0.26
602 0.24
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.15
607 0.15
608 0.13
609 0.08
610 0.11
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.13
617 0.15
618 0.14
619 0.18
620 0.18
621 0.17
622 0.16
623 0.17
624 0.15
625 0.13
626 0.11
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.09
641 0.1
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.13
646 0.14
647 0.17
648 0.25
649 0.26
650 0.27
651 0.33
652 0.35
653 0.34
654 0.4
655 0.38
656 0.37
657 0.35
658 0.35