Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YV21

Protein Details
Accession C7YV21    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51LDVNNPSKRRKPSNLSQTSNHydrophilic
92-116VTASGAPKKKRGRKAKNAKQDDAREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-110APKKKRGRKAKNAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG nhe:NECHADRAFT_63811  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPYASSPSAMSPPYPSPAQIPNKKRSSTLDVNNPSKRRKPSNLSQTSNSAAAVNHPLRQTSFPPEARSPYPRSPSVDASSHVSGSAVSVTASGAPKKKRGRKAKNAKQDDAREQTPSLVGGRAPTAVSGQGGDKEDDDEDDEKAEMALEDVVARTQEQKQEEIRLRAMLVEAFDSQQYNRYELWRAAKLADSVVKRVVNATVSQSVPQNVSTAVKAVAKLFAGEIIEAARNVQAEWITTGEKQSELPTPPPSNNDAAAEEEEVDLKRGPLRPDHLREAWRRYRLSGESRGVGVQQLWHAQQADGVDRFSTRTGKRLFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.25
7 0.34
8 0.43
9 0.48
10 0.54
11 0.59
12 0.66
13 0.67
14 0.66
15 0.64
16 0.63
17 0.62
18 0.63
19 0.63
20 0.65
21 0.72
22 0.76
23 0.76
24 0.74
25 0.72
26 0.72
27 0.71
28 0.72
29 0.72
30 0.74
31 0.79
32 0.82
33 0.8
34 0.75
35 0.7
36 0.63
37 0.55
38 0.45
39 0.34
40 0.24
41 0.21
42 0.25
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.24
47 0.25
48 0.28
49 0.29
50 0.28
51 0.34
52 0.33
53 0.38
54 0.41
55 0.44
56 0.45
57 0.48
58 0.48
59 0.48
60 0.51
61 0.49
62 0.51
63 0.5
64 0.51
65 0.49
66 0.44
67 0.37
68 0.37
69 0.34
70 0.29
71 0.25
72 0.19
73 0.15
74 0.13
75 0.11
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.08
81 0.09
82 0.12
83 0.17
84 0.2
85 0.28
86 0.38
87 0.47
88 0.54
89 0.64
90 0.72
91 0.78
92 0.87
93 0.89
94 0.9
95 0.9
96 0.85
97 0.82
98 0.77
99 0.74
100 0.68
101 0.59
102 0.5
103 0.42
104 0.37
105 0.29
106 0.23
107 0.16
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.11
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.06
145 0.08
146 0.12
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.24
151 0.27
152 0.28
153 0.27
154 0.24
155 0.22
156 0.2
157 0.19
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.21
173 0.26
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.22
178 0.2
179 0.19
180 0.21
181 0.18
182 0.17
183 0.2
184 0.19
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.13
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.17
235 0.19
236 0.22
237 0.28
238 0.3
239 0.32
240 0.34
241 0.36
242 0.33
243 0.31
244 0.3
245 0.24
246 0.23
247 0.23
248 0.2
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.14
254 0.11
255 0.1
256 0.14
257 0.18
258 0.2
259 0.25
260 0.32
261 0.4
262 0.46
263 0.53
264 0.55
265 0.58
266 0.63
267 0.67
268 0.69
269 0.67
270 0.62
271 0.57
272 0.58
273 0.57
274 0.58
275 0.57
276 0.53
277 0.48
278 0.47
279 0.45
280 0.39
281 0.33
282 0.26
283 0.2
284 0.18
285 0.19
286 0.19
287 0.21
288 0.22
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.24
293 0.21
294 0.21
295 0.19
296 0.18
297 0.2
298 0.21
299 0.27
300 0.23
301 0.3