Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M8R9

Protein Details
Accession A0A1C7M8R9    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-68DEDQPRRSSKAMKKERKRGGGRASQABasic
301-321LGPNKNSKKKCPASGCNQYLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-64RRSSKAMKKERKRGGGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MPVSTSSRRTRTLRREPSDAIEEDGPSQLQRQEEEDVEDDEEDEDQPRRSSKAMKKERKRGGGRASQAEAVGDDPLKSFGDQPLDKNHAPKIAGMAKDWGTIKDELHKPWYGLIKDIAASHAEFTEGEQGEQVSYSINYHILYEVNGDVKELLEIDHIMRELIDTENEFAAHQRTLEGINQRLVEREEISGIIDVYEEMSNRNWKNIRARQPDRNMPRMICTYSSDKQSSFEVQNPNVAMPPVTDFIPHEDGDDSDDDDDVQVGGVTQDYKCPLTLTTLIDPLTSSVCGHSFSAGAIREFLGPNKNSKKKCPASGCNQYLNIGDLHPDKELARRARDAARREQAREEDSDEEEVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.73
4 0.73
5 0.69
6 0.59
7 0.52
8 0.43
9 0.37
10 0.31
11 0.28
12 0.22
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.22
21 0.26
22 0.25
23 0.24
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.15
28 0.15
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.17
35 0.18
36 0.2
37 0.3
38 0.36
39 0.45
40 0.55
41 0.64
42 0.72
43 0.81
44 0.88
45 0.88
46 0.87
47 0.85
48 0.84
49 0.82
50 0.78
51 0.73
52 0.66
53 0.57
54 0.5
55 0.41
56 0.31
57 0.23
58 0.18
59 0.12
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.2
68 0.21
69 0.23
70 0.29
71 0.35
72 0.36
73 0.37
74 0.37
75 0.33
76 0.32
77 0.3
78 0.29
79 0.29
80 0.28
81 0.26
82 0.28
83 0.24
84 0.27
85 0.27
86 0.21
87 0.19
88 0.19
89 0.19
90 0.24
91 0.27
92 0.26
93 0.29
94 0.3
95 0.26
96 0.29
97 0.35
98 0.27
99 0.25
100 0.24
101 0.21
102 0.21
103 0.2
104 0.17
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.13
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.14
188 0.14
189 0.19
190 0.2
191 0.23
192 0.34
193 0.41
194 0.5
195 0.54
196 0.6
197 0.65
198 0.7
199 0.76
200 0.72
201 0.7
202 0.63
203 0.53
204 0.51
205 0.45
206 0.39
207 0.31
208 0.28
209 0.28
210 0.28
211 0.32
212 0.3
213 0.27
214 0.27
215 0.28
216 0.28
217 0.24
218 0.27
219 0.27
220 0.26
221 0.29
222 0.28
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.15
227 0.1
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.14
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.13
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.04
252 0.04
253 0.06
254 0.05
255 0.08
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.15
262 0.18
263 0.2
264 0.21
265 0.23
266 0.23
267 0.22
268 0.21
269 0.18
270 0.16
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.19
288 0.22
289 0.22
290 0.31
291 0.4
292 0.48
293 0.5
294 0.58
295 0.66
296 0.67
297 0.75
298 0.76
299 0.75
300 0.76
301 0.83
302 0.8
303 0.76
304 0.69
305 0.61
306 0.52
307 0.44
308 0.35
309 0.24
310 0.22
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.22
317 0.3
318 0.33
319 0.37
320 0.39
321 0.43
322 0.51
323 0.58
324 0.58
325 0.6
326 0.63
327 0.64
328 0.64
329 0.67
330 0.64
331 0.6
332 0.57
333 0.51
334 0.44
335 0.41
336 0.39