Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7M8C6

Protein Details
Accession A0A1C7M8C6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-267AKKCSYCKNKGHTKDECRKRKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-245KAKSGKFKSDGKG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MTDPKTAPPTAPTATTAASTTHAHQSSRLFDVTHLKDDGSNFQTWKYRIMKILDQRGLWDIASGAEKDPGVGDVTLQASWVNRDKEALIQITLTLDDEPLSGVIHVSHAAEAWDKLNARYEGKGKQTIAYLIGELFRDTLSDDSPLEPQLNAMVHKSHILTSLGQKLDDSLIAIAMVISLPSSYSTLRTILMSTQDKLSSDNVVTQVLNEEKSRRDASPQSAFFTKTSGTKQKAKSGKFKSDGKGAKKCSYCKNKGHTKDECRKRKADTASKEDPPKEKSGDLAAKVTTVRDSDDESIQLFVAEALHKRKTMLMRWIVDSGASSPMSSQRDWFIHYTSLSSPKRVWLGDERFILAVGIGQISATVHLDDGKTRTVIIPGVYHVPDLNGNLLSVSHLTRRGYSVNFGDAGCRILSPTGELAAVAREAEGLYILKVSPRIPEQTYIAELDYGLEDSMDPGPTPPITALVAKATESKADLATWHRRLGHISVDSVIKMVRKGMVKGMSIVGSLTKPKTVCKPCLEGKQHRNPIPKLSEVEYPEVNFRTHSDLCGPMQTTARGGYRYFCTFVEGYSGNVTVKLLKSKDDEVVQFVAYARRSKLETGKPLKILRTDGGGEYVNKKLEAICIVEGIHHEQTNAYTPQENGKAERMNRTLMEMARTLLKESGLPNSYWGDAVLYAAYIVNRTPSSAVKPGPMSHLTRPTQATNPPSHTFVHSAARLTSMYRMKSDANSMRNHSSASSLDMQQIKRRTGSYIAPQARSSSRETSYSMRALPLSRTGYPSASILSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.23
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.2
8 0.27
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.34
13 0.35
14 0.37
15 0.35
16 0.27
17 0.28
18 0.37
19 0.38
20 0.38
21 0.35
22 0.31
23 0.32
24 0.34
25 0.38
26 0.32
27 0.32
28 0.27
29 0.31
30 0.38
31 0.36
32 0.42
33 0.4
34 0.41
35 0.43
36 0.48
37 0.53
38 0.55
39 0.64
40 0.6
41 0.55
42 0.53
43 0.5
44 0.45
45 0.36
46 0.28
47 0.17
48 0.14
49 0.16
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.15
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.22
71 0.23
72 0.27
73 0.31
74 0.28
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.19
80 0.15
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.22
104 0.24
105 0.24
106 0.28
107 0.32
108 0.35
109 0.4
110 0.45
111 0.39
112 0.39
113 0.39
114 0.36
115 0.33
116 0.28
117 0.22
118 0.16
119 0.17
120 0.15
121 0.13
122 0.11
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.17
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.21
149 0.28
150 0.26
151 0.25
152 0.24
153 0.23
154 0.22
155 0.2
156 0.15
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.22
186 0.18
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.14
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.22
200 0.25
201 0.22
202 0.26
203 0.3
204 0.36
205 0.43
206 0.43
207 0.41
208 0.41
209 0.42
210 0.36
211 0.32
212 0.26
213 0.21
214 0.26
215 0.3
216 0.34
217 0.4
218 0.44
219 0.51
220 0.58
221 0.6
222 0.64
223 0.64
224 0.68
225 0.66
226 0.69
227 0.64
228 0.65
229 0.67
230 0.65
231 0.65
232 0.61
233 0.62
234 0.6
235 0.62
236 0.62
237 0.65
238 0.66
239 0.66
240 0.7
241 0.73
242 0.76
243 0.79
244 0.79
245 0.78
246 0.8
247 0.83
248 0.84
249 0.79
250 0.74
251 0.71
252 0.69
253 0.69
254 0.68
255 0.65
256 0.64
257 0.64
258 0.66
259 0.67
260 0.63
261 0.57
262 0.52
263 0.48
264 0.41
265 0.35
266 0.31
267 0.32
268 0.33
269 0.3
270 0.27
271 0.23
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.15
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.08
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.09
292 0.12
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.18
297 0.22
298 0.25
299 0.31
300 0.34
301 0.35
302 0.36
303 0.37
304 0.33
305 0.29
306 0.24
307 0.17
308 0.13
309 0.11
310 0.09
311 0.08
312 0.13
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.16
317 0.17
318 0.2
319 0.2
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.16
325 0.25
326 0.23
327 0.23
328 0.22
329 0.23
330 0.25
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.28
335 0.32
336 0.32
337 0.3
338 0.28
339 0.27
340 0.24
341 0.15
342 0.1
343 0.05
344 0.04
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.1
385 0.12
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.08
423 0.1
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.19
430 0.17
431 0.15
432 0.12
433 0.11
434 0.09
435 0.08
436 0.06
437 0.05
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.11
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.1
464 0.14
465 0.22
466 0.24
467 0.26
468 0.26
469 0.26
470 0.28
471 0.28
472 0.29
473 0.22
474 0.2
475 0.19
476 0.19
477 0.18
478 0.16
479 0.15
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.19
487 0.22
488 0.21
489 0.22
490 0.23
491 0.19
492 0.17
493 0.16
494 0.12
495 0.09
496 0.11
497 0.1
498 0.12
499 0.12
500 0.15
501 0.25
502 0.3
503 0.36
504 0.38
505 0.44
506 0.47
507 0.57
508 0.63
509 0.63
510 0.67
511 0.71
512 0.75
513 0.74
514 0.76
515 0.68
516 0.68
517 0.62
518 0.55
519 0.47
520 0.42
521 0.41
522 0.35
523 0.36
524 0.29
525 0.26
526 0.25
527 0.24
528 0.21
529 0.17
530 0.16
531 0.19
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.2
536 0.21
537 0.24
538 0.23
539 0.19
540 0.2
541 0.19
542 0.18
543 0.18
544 0.19
545 0.17
546 0.17
547 0.17
548 0.2
549 0.22
550 0.22
551 0.19
552 0.21
553 0.2
554 0.19
555 0.21
556 0.17
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.12
565 0.17
566 0.16
567 0.18
568 0.22
569 0.24
570 0.27
571 0.28
572 0.28
573 0.26
574 0.27
575 0.23
576 0.21
577 0.19
578 0.19
579 0.17
580 0.19
581 0.17
582 0.18
583 0.19
584 0.23
585 0.31
586 0.35
587 0.43
588 0.48
589 0.52
590 0.56
591 0.58
592 0.57
593 0.52
594 0.47
595 0.38
596 0.35
597 0.31
598 0.26
599 0.25
600 0.23
601 0.22
602 0.21
603 0.23
604 0.2
605 0.19
606 0.18
607 0.16
608 0.17
609 0.17
610 0.17
611 0.14
612 0.14
613 0.14
614 0.14
615 0.15
616 0.17
617 0.18
618 0.15
619 0.15
620 0.14
621 0.16
622 0.2
623 0.2
624 0.17
625 0.16
626 0.17
627 0.23
628 0.28
629 0.28
630 0.26
631 0.3
632 0.35
633 0.36
634 0.44
635 0.4
636 0.38
637 0.37
638 0.38
639 0.37
640 0.32
641 0.32
642 0.24
643 0.23
644 0.24
645 0.24
646 0.22
647 0.19
648 0.18
649 0.17
650 0.18
651 0.24
652 0.21
653 0.21
654 0.22
655 0.22
656 0.22
657 0.2
658 0.19
659 0.13
660 0.1
661 0.11
662 0.09
663 0.07
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.06
668 0.07
669 0.1
670 0.1
671 0.11
672 0.13
673 0.15
674 0.2
675 0.26
676 0.27
677 0.28
678 0.32
679 0.32
680 0.36
681 0.38
682 0.38
683 0.39
684 0.46
685 0.44
686 0.46
687 0.48
688 0.46
689 0.47
690 0.48
691 0.48
692 0.46
693 0.5
694 0.48
695 0.47
696 0.44
697 0.42
698 0.39
699 0.36
700 0.37
701 0.32
702 0.31
703 0.29
704 0.3
705 0.27
706 0.24
707 0.29
708 0.27
709 0.27
710 0.27
711 0.29
712 0.3
713 0.32
714 0.4
715 0.41
716 0.41
717 0.44
718 0.48
719 0.5
720 0.48
721 0.47
722 0.38
723 0.33
724 0.28
725 0.28
726 0.27
727 0.24
728 0.29
729 0.34
730 0.36
731 0.4
732 0.45
733 0.43
734 0.42
735 0.42
736 0.39
737 0.38
738 0.43
739 0.45
740 0.5
741 0.53
742 0.52
743 0.52
744 0.53
745 0.52
746 0.48
747 0.44
748 0.39
749 0.36
750 0.36
751 0.38
752 0.39
753 0.42
754 0.42
755 0.39
756 0.35
757 0.34
758 0.33
759 0.33
760 0.35
761 0.34
762 0.33
763 0.35
764 0.35
765 0.34
766 0.34
767 0.31