FuNGI

A0A1C7LXW2

Protein Details

Accession

A0A1C7LXW2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
267-290	EHASKEKQEDRKDKQRRAGKRLSS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-314	DRKDKQRRAGKRLSSAVQSEVAKAKEKENEREGRKVKQK

Subcellular Location(s)

mito 10, cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MRVVATFHPPSSVTRSLKCHLTTDPAVEHLVVARINRLEVHSLQPDGLRHECSLEVWGRIVALRSIPTNDNDRSNILVMTDHPDPKLIVLAYVVEAGLGNLVTKGQQSLFDRASRHAEFITDVQVDPSGEVAVACCYVGKLKVVKLKDGEFEQPFDVSTPELNLLAFTFLHAERGMYTLAILHLDHQQRLQLLSRDVNTSDPELSALHSTLLPSTMIPSSTLPLVDIPPILIAIPPYTSSPQAEEASPADHLGGLLVVGGRKVLFFEHASKEKQEDRKDKQRRAGKRLSSAVQSEVAKAKEKENEREGRKVKQKASVKWPWSEVTAWCSVDDEGRRFFLGDAYGRLAMLAFDDRPGLTLLPLGETSAATCMTYLSSQVLYLGSHVGDSQLLRIHPTPISNFEADTLPISNSITTVPPSSLSSSKGKEKADTTNLKAGKDGRIVSMTGNYVEVLESYQNIAPILDAVLADLDGSGQPQIVTCSGGRNTGALKIIRTGADFQELAVVNGIPGVTNMWPVRSRYKDSVDTHLVTSTLYETYVFSFDAADTMTRLEPSTAGFTTRLPTLALTNIPRRQTVTNGARTTSSYVDSSLVVQVTPEGVKLLEYDPALRLFSSVDEWSPEKHNPLWAGREIVAAGVNPSQFVLGLSGGRLVLLNLDVNGQLQFVKSCDFTDLKTGPKEIAAISCAPFDPSKEYSTYIALSFWGINKVTIISLASPDLTPVCETSALPSLPHSILLYNFGTGRRPKDLDYHPHVLVGLTDGTAVSYTFKDNQLKEHKVFSLGIAPVSLSTCVIDGKTGVFASGSRASVLYWGRQRVHQSPIMLKDSVQGASLSTSAFPSCLILATSSSLLIGNVRGVDKMQITTIPMGLENPHRIAHHSGLKMFGVACSRTAPVRIGDFENTFSSFQLLDDSSFKRLDSFTCDADEEVSAVLALPADASGPSFCLGTVRFQQEEQEPSEGRIIVLGVNSTSSLSSTPSKLQILASETVNGCVYALACVRGMIAVAVNSAVVLFQMSQTDGTSETLKKVASWNHNYCVTTLVADGDTLVVGDAISSVSILKVEAGPRLQAVARDYGPLWPVAVGSLGHGGVIGANSDCNLFTFVLQRNDNRPVLERDGDYHLGDVVNKFLPGGVVSGELSGDELLKQNHLFFTSTGRIGTVLDMADEMSLHMTALQRNMAKFIIGPGDTHHAKWRAPSSSKGHSDAEASFGFLDGDFLEQFLTYPHPDEILQGEVEAERITLPTNHIHDVLEKIQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.46
3	0.48
4	0.54
5	0.53
6	0.49
7	0.43
8	0.46
9	0.43
10	0.42
11	0.4
12	0.34
13	0.33
14	0.29
15	0.27
16	0.2
17	0.2
18	0.16
19	0.15
20	0.17
21	0.17
22	0.18
23	0.19
24	0.2
25	0.22
26	0.23
27	0.28
28	0.28
29	0.28
30	0.28
31	0.3
32	0.29
33	0.3
34	0.31
35	0.28
36	0.25
37	0.26
38	0.25
39	0.23
40	0.27
41	0.24
42	0.22
43	0.2
44	0.2
45	0.18
46	0.19
47	0.19
48	0.15
49	0.15
50	0.16
51	0.17
52	0.21
53	0.23
54	0.25
55	0.3
56	0.32
57	0.34
58	0.35
59	0.35
60	0.33
61	0.32
62	0.29
63	0.22
64	0.2
65	0.17
66	0.2
67	0.23
68	0.22
69	0.21
70	0.22
71	0.22
72	0.21
73	0.24
74	0.19
75	0.14
76	0.13
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.12
81	0.08
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.05
89	0.06
90	0.07
91	0.09
92	0.09
93	0.15
94	0.19
95	0.26
96	0.29
97	0.32
98	0.34
99	0.36
100	0.43
101	0.38
102	0.36
103	0.3
104	0.27
105	0.26
106	0.25
107	0.27
108	0.21
109	0.19
110	0.18
111	0.19
112	0.18
113	0.15
114	0.14
115	0.09
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.06
123	0.06
124	0.09
125	0.1
126	0.14
127	0.17
128	0.22
129	0.29
130	0.32
131	0.37
132	0.39
133	0.41
134	0.42
135	0.42
136	0.44
137	0.39
138	0.39
139	0.34
140	0.3
141	0.27
142	0.23
143	0.2
144	0.14
145	0.12
146	0.11
147	0.11
148	0.11
149	0.11
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.11
161	0.13
162	0.12
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.16
171	0.19
172	0.2
173	0.19
174	0.21
175	0.21
176	0.23
177	0.27
178	0.24
179	0.25
180	0.29
181	0.3
182	0.3
183	0.3
184	0.3
185	0.27
186	0.25
187	0.22
188	0.17
189	0.16
190	0.14
191	0.15
192	0.14
193	0.13
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.08
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.11
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.11
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.1
224	0.12
225	0.14
226	0.14
227	0.16
228	0.2
229	0.2
230	0.2
231	0.2
232	0.19
233	0.19
234	0.18
235	0.15
236	0.11
237	0.1
238	0.09
239	0.07
240	0.06
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.11
253	0.16
254	0.23
255	0.27
256	0.3
257	0.31
258	0.35
259	0.4
260	0.46
261	0.5
262	0.53
263	0.58
264	0.66
265	0.75
266	0.78
267	0.8
268	0.81
269	0.81
270	0.81
271	0.82
272	0.78
273	0.76
274	0.75
275	0.69
276	0.64
277	0.56
278	0.49
279	0.43
280	0.36
281	0.3
282	0.28
283	0.26
284	0.28
285	0.27
286	0.29
287	0.32
288	0.37
289	0.41
290	0.45
291	0.53
292	0.52
293	0.6
294	0.6
295	0.62
296	0.66
297	0.67
298	0.63
299	0.63
300	0.67
301	0.65
302	0.71
303	0.71
304	0.67
305	0.62
306	0.61
307	0.53
308	0.47
309	0.41
310	0.32
311	0.27
312	0.27
313	0.24
314	0.21
315	0.2
316	0.18
317	0.2
318	0.23
319	0.21
320	0.19
321	0.19
322	0.2
323	0.19
324	0.19
325	0.16
326	0.16
327	0.14
328	0.15
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.15
333	0.13
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.09
377	0.09
378	0.12
379	0.13
380	0.14
381	0.15
382	0.17
383	0.17
384	0.19
385	0.22
386	0.2
387	0.2
388	0.19
389	0.18
390	0.17
391	0.16
392	0.12
393	0.09
394	0.09
395	0.1
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.14
406	0.14
407	0.17
408	0.21
409	0.23
410	0.29
411	0.34
412	0.33
413	0.34
414	0.35
415	0.39
416	0.43
417	0.45
418	0.42
419	0.44
420	0.45
421	0.42
422	0.41
423	0.36
424	0.31
425	0.3
426	0.27
427	0.2
428	0.2
429	0.2
430	0.19
431	0.19
432	0.15
433	0.12
434	0.11
435	0.1
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.07
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.04
464	0.05
465	0.05
466	0.07
467	0.07
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.13
475	0.17
476	0.14
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.12
484	0.14
485	0.13
486	0.12
487	0.15
488	0.15
489	0.14
490	0.12
491	0.11
492	0.08
493	0.09
494	0.09
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.04
499	0.08
500	0.08
501	0.1
502	0.12
503	0.14
504	0.21
505	0.24
506	0.29
507	0.3
508	0.36
509	0.42
510	0.43
511	0.47
512	0.45
513	0.42
514	0.38
515	0.33
516	0.28
517	0.2
518	0.17
519	0.12
520	0.07
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.08
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.04
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.07
541	0.1
542	0.09
543	0.1
544	0.1
545	0.1
546	0.12
547	0.12
548	0.11
549	0.08
550	0.09
551	0.08
552	0.09
553	0.11
554	0.13
555	0.19
556	0.22
557	0.23
558	0.23
559	0.25
560	0.24
561	0.25
562	0.31
563	0.32
564	0.36
565	0.35
566	0.35
567	0.33
568	0.33
569	0.32
570	0.24
571	0.19
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.1
578	0.09
579	0.07
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.09
597	0.08
598	0.06
599	0.07
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.13
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.17
611	0.17
612	0.19
613	0.2
614	0.18
615	0.19
616	0.17
617	0.17
618	0.14
619	0.12
620	0.1
621	0.07
622	0.07
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.04
638	0.04
639	0.03
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.09
656	0.1
657	0.1
658	0.16
659	0.17
660	0.19
661	0.19
662	0.19
663	0.17
664	0.16
665	0.17
666	0.11
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.1
674	0.09
675	0.09
676	0.12
677	0.13
678	0.14
679	0.15
680	0.16
681	0.16
682	0.18
683	0.18
684	0.13
685	0.11
686	0.1
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.07
698	0.05
699	0.05
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.08
712	0.12
713	0.12
714	0.12
715	0.12
716	0.14
717	0.13
718	0.14
719	0.12
720	0.09
721	0.09
722	0.12
723	0.12
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.14
728	0.16
729	0.19
730	0.2
731	0.21
732	0.22
733	0.28
734	0.34
735	0.38
736	0.43
737	0.45
738	0.41
739	0.4
740	0.38
741	0.3
742	0.24
743	0.17
744	0.1
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.07
754	0.09
755	0.13
756	0.18
757	0.19
758	0.27
759	0.34
760	0.39
761	0.39
762	0.4
763	0.37
764	0.34
765	0.34
766	0.27
767	0.24
768	0.19
769	0.17
770	0.14
771	0.13
772	0.11
773	0.11
774	0.11
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.07
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.06
788	0.1
789	0.12
790	0.12
791	0.11
792	0.11
793	0.11
794	0.16
795	0.17
796	0.17
797	0.19
798	0.23
799	0.24
800	0.27
801	0.33
802	0.33
803	0.37
804	0.35
805	0.33
806	0.33
807	0.37
808	0.38
809	0.32
810	0.28
811	0.26
812	0.24
813	0.22
814	0.17
815	0.12
816	0.09
817	0.1
818	0.1
819	0.08
820	0.07
821	0.07
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.06
828	0.06
829	0.06
830	0.06
831	0.08
832	0.08
833	0.07
834	0.07
835	0.07
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.06
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.09
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.1
850	0.11
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.09
855	0.1
856	0.14
857	0.15
858	0.16
859	0.16
860	0.16
861	0.19
862	0.22
863	0.25
864	0.29
865	0.28
866	0.27
867	0.27
868	0.27
869	0.25
870	0.21
871	0.18
872	0.14
873	0.12
874	0.12
875	0.12
876	0.13
877	0.13
878	0.14
879	0.14
880	0.13
881	0.15
882	0.17
883	0.18
884	0.2
885	0.2
886	0.21
887	0.21
888	0.21
889	0.19
890	0.17
891	0.15
892	0.12
893	0.11
894	0.12
895	0.11
896	0.1
897	0.14
898	0.15
899	0.17
900	0.17
901	0.17
902	0.16
903	0.16
904	0.16
905	0.2
906	0.22
907	0.2
908	0.22
909	0.22
910	0.21
911	0.21
912	0.19
913	0.12
914	0.09
915	0.07
916	0.05
917	0.05
918	0.05
919	0.04
920	0.03
921	0.03
922	0.03
923	0.03
924	0.03
925	0.04
926	0.04
927	0.05
928	0.06
929	0.06
930	0.06
931	0.07
932	0.08
933	0.12
934	0.18
935	0.22
936	0.22
937	0.23
938	0.26
939	0.29
940	0.31
941	0.3
942	0.28
943	0.24
944	0.25
945	0.27
946	0.24
947	0.19
948	0.16
949	0.14
950	0.1
951	0.1
952	0.09
953	0.06
954	0.06
955	0.07
956	0.07
957	0.06
958	0.06
959	0.06
960	0.09
961	0.11
962	0.13
963	0.16
964	0.19
965	0.2
966	0.21
967	0.21
968	0.21
969	0.23
970	0.23
971	0.21
972	0.21
973	0.2
974	0.2
975	0.2
976	0.17
977	0.12
978	0.1
979	0.1
980	0.08
981	0.09
982	0.09
983	0.08
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.08
988	0.06
989	0.06
990	0.05
991	0.05
992	0.05
993	0.05
994	0.05
995	0.04
996	0.04
997	0.03
998	0.04
999	0.04
1000	0.04
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.09
1007	0.1
1008	0.13
1009	0.14
1010	0.15
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.16
1014	0.2
1015	0.27
1016	0.33
1017	0.41
1018	0.45
1019	0.48
1020	0.53
1021	0.52
1022	0.47
1023	0.42
1024	0.33
1025	0.24
1026	0.19
1027	0.15
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.1
1031	0.07
1032	0.07
1033	0.06
1034	0.05
1035	0.04
1036	0.03
1037	0.03
1038	0.03
1039	0.03
1040	0.03
1041	0.03
1042	0.04
1043	0.04
1044	0.04
1045	0.04
1046	0.05
1047	0.08
1048	0.09
1049	0.13
1050	0.14
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.17
1054	0.16
1055	0.17
1056	0.18
1057	0.19
1058	0.19
1059	0.2
1060	0.2
1061	0.21
1062	0.21
1063	0.19
1064	0.17
1065	0.12
1066	0.11
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.09
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.07
1079	0.05
1080	0.05
1081	0.06
1082	0.06
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.09
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.15
1089	0.21
1090	0.28
1091	0.31
1092	0.35
1093	0.39
1094	0.45
1095	0.47
1096	0.43
1097	0.42
1098	0.4
1099	0.43
1100	0.42
1101	0.37
1102	0.34
1103	0.38
1104	0.38
1105	0.34
1106	0.28
1107	0.23
1108	0.2
1109	0.21
1110	0.18
1111	0.14
1112	0.13
1113	0.13
1114	0.12
1115	0.11
1116	0.11
1117	0.1
1118	0.1
1119	0.08
1120	0.08
1121	0.08
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.08
1126	0.07
1127	0.07
1128	0.06
1129	0.09
1130	0.1
1131	0.13
1132	0.14
1133	0.15
1134	0.17
1135	0.18
1136	0.19
1137	0.16
1138	0.23
1139	0.24
1140	0.25
1141	0.23
1142	0.22
1143	0.21
1144	0.2
1145	0.2
1146	0.15
1147	0.1
1148	0.09
1149	0.09
1150	0.09
1151	0.08
1152	0.08
1153	0.07
1154	0.06
1155	0.06
1156	0.06
1157	0.08
1158	0.1
1159	0.12
1160	0.14
1161	0.19
1162	0.21
1163	0.22
1164	0.25
1165	0.23
1166	0.22
1167	0.2
1168	0.21
1169	0.22
1170	0.19
1171	0.19
1172	0.19
1173	0.27
1174	0.28
1175	0.29
1176	0.34
1177	0.32
1178	0.32
1179	0.39
1180	0.43
1181	0.45
1182	0.47
1183	0.54
1184	0.53
1185	0.59
1186	0.63
1187	0.61
1188	0.55
1189	0.48
1190	0.47
1191	0.39
1192	0.37
1193	0.27
1194	0.23
1195	0.18
1196	0.16
1197	0.15
1198	0.11
1199	0.12
1200	0.07
1201	0.09
1202	0.08
1203	0.08
1204	0.08
1205	0.08
1206	0.08
1207	0.08
1208	0.12
1209	0.11
1210	0.14
1211	0.15
1212	0.16
1213	0.16
1214	0.18
1215	0.2
1216	0.19
1217	0.17
1218	0.14
1219	0.15
1220	0.13
1221	0.14
1222	0.12
1223	0.09
1224	0.07
1225	0.07
1226	0.09
1227	0.1
1228	0.13
1229	0.19
1230	0.23
1231	0.25
1232	0.26
1233	0.27
1234	0.27
1235	0.31
1236	0.32
1237	0.29

A0A1C7LXW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer