Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1C7LZC0

Protein Details
Accession A0A1C7LZC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-31ESIEDRSTPPPRKRLRVEATNALQHydrophilic
801-822VIQQRNKPKEPPKQPEKAPFFLHydrophilic
837-860KKEDDAKSKKSTKRLQKATASSDSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 20, nucl 3, E.R. 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR007319  SSU_processome_Utp21  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
Gene Ontology GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04192  Utp21  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAATIVTESIEDRSTPPPRKRLRVEATNALQSTREPRLFAPFRALGLITNHVPFVLQTRSHKGATEGPRIHLLTCLGRAWAMWEGERWAYYLSVRPDAPELIHCMAMDGNAVWVSSGPHAIKYLRGKEVGRFTNPLETNLANLLVFGSQLLALTEDGGRMFIWDSTNGDLQGTIEFDPGFTATMILHPATYLNKVLVSSSQGSMQLWNTRTQTRIHSIPPKSLLTSSAQSSSSNGITALAQSPAIDVIGVGFSSGEISVYDVRADERLMRMFMQDGGVRSLSFRTGYPDGHPILASASSAGHIALWDLNSGGRLLHLMRGAHDGAVTSVEWVPGQPLLISSGEDNSVKQWLFDSPTDAPRLLKFRSGHHAPPHLIRYYGEDGKQLLTASRDRSLRCTSVVRDSRSFELSQGKICLVFPVFGSSVKLCIVSGSLAKKATSLSIPIASLKLPPVTSMSYSSTRAKDWDDILTAHADEAVAHTWTMKDKKLGKYTFKLAGERSKWATEGFVKAVCVSACGNFGIASSTSGVIHMYNMQSGILRKSFSVGPCPPEVTNKYRPSGTSKKKLEERCVTGLASDALNRLVVASTLDGTINFFDFHSANLEHTLILPSSAISITLHRDSGLLAVICDDLVVRIIDIETRRIVRELRGCSGRVLDLTFSPDSRWLVTTSMDSIIRTFDVPTGRLIDAFRTSSVATSVSFSPTNDFLATAHTDSVGVYLWANRAQYSEISFQSIVENDIVDVSLPSMQGVAEDEALEALSALTMQDQPADVFVTPPQLDGDLVTFTLLPRTRWQTLLNLEVIQQRNKPKEPPKQPEKAPFFLPTLPGVEPRFDVNAKKEDDAKSKKSTKRLQKATASSDSIFYTKLFEDGSHDGYESFFSYAKTLSPAAMDLELRSLVTLDALQTFLHVLTQRLRSHRDFEAVQTFQNVFLRMHGDVLAANLELLQDLETLQQVQHKESEQLLELLASSLGTLGFVRDTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.4
3 0.47
4 0.55
5 0.63
6 0.73
7 0.78
8 0.81
9 0.82
10 0.82
11 0.81
12 0.81
13 0.78
14 0.75
15 0.68
16 0.57
17 0.48
18 0.4
19 0.39
20 0.37
21 0.34
22 0.28
23 0.29
24 0.39
25 0.42
26 0.42
27 0.44
28 0.37
29 0.36
30 0.36
31 0.35
32 0.27
33 0.26
34 0.29
35 0.23
36 0.22
37 0.21
38 0.18
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.34
46 0.38
47 0.39
48 0.4
49 0.39
50 0.42
51 0.46
52 0.51
53 0.46
54 0.44
55 0.49
56 0.49
57 0.46
58 0.39
59 0.34
60 0.27
61 0.27
62 0.25
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.18
69 0.16
70 0.17
71 0.19
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.2
79 0.21
80 0.25
81 0.24
82 0.25
83 0.26
84 0.27
85 0.27
86 0.23
87 0.25
88 0.22
89 0.23
90 0.21
91 0.19
92 0.18
93 0.17
94 0.15
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.17
108 0.24
109 0.31
110 0.36
111 0.36
112 0.4
113 0.4
114 0.44
115 0.53
116 0.52
117 0.48
118 0.45
119 0.42
120 0.47
121 0.46
122 0.42
123 0.36
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.25
128 0.15
129 0.14
130 0.12
131 0.08
132 0.08
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.2
192 0.22
193 0.21
194 0.25
195 0.26
196 0.28
197 0.29
198 0.3
199 0.33
200 0.33
201 0.35
202 0.38
203 0.44
204 0.44
205 0.48
206 0.5
207 0.46
208 0.42
209 0.38
210 0.33
211 0.28
212 0.29
213 0.25
214 0.23
215 0.22
216 0.2
217 0.21
218 0.22
219 0.18
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.19
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.22
279 0.17
280 0.15
281 0.14
282 0.12
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.08
303 0.11
304 0.1
305 0.12
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.14
339 0.14
340 0.18
341 0.18
342 0.21
343 0.23
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.25
348 0.21
349 0.25
350 0.23
351 0.25
352 0.33
353 0.36
354 0.39
355 0.4
356 0.45
357 0.4
358 0.43
359 0.43
360 0.36
361 0.32
362 0.27
363 0.27
364 0.27
365 0.28
366 0.24
367 0.21
368 0.21
369 0.21
370 0.22
371 0.16
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.15
376 0.19
377 0.21
378 0.21
379 0.26
380 0.29
381 0.28
382 0.27
383 0.28
384 0.26
385 0.33
386 0.39
387 0.38
388 0.36
389 0.37
390 0.37
391 0.36
392 0.34
393 0.26
394 0.27
395 0.24
396 0.23
397 0.22
398 0.19
399 0.17
400 0.17
401 0.16
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.13
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.13
442 0.15
443 0.16
444 0.19
445 0.22
446 0.21
447 0.21
448 0.21
449 0.21
450 0.2
451 0.19
452 0.17
453 0.15
454 0.14
455 0.15
456 0.14
457 0.12
458 0.09
459 0.08
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.09
469 0.11
470 0.11
471 0.16
472 0.22
473 0.29
474 0.37
475 0.42
476 0.44
477 0.45
478 0.49
479 0.49
480 0.45
481 0.4
482 0.34
483 0.37
484 0.33
485 0.32
486 0.3
487 0.25
488 0.23
489 0.21
490 0.21
491 0.15
492 0.16
493 0.14
494 0.12
495 0.12
496 0.11
497 0.12
498 0.1
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.07
504 0.08
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.05
516 0.06
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.1
525 0.09
526 0.1
527 0.09
528 0.11
529 0.14
530 0.14
531 0.2
532 0.2
533 0.21
534 0.22
535 0.24
536 0.22
537 0.25
538 0.28
539 0.28
540 0.35
541 0.36
542 0.37
543 0.36
544 0.37
545 0.4
546 0.46
547 0.48
548 0.49
549 0.5
550 0.55
551 0.62
552 0.66
553 0.66
554 0.63
555 0.6
556 0.54
557 0.51
558 0.44
559 0.36
560 0.32
561 0.24
562 0.17
563 0.11
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.06
602 0.09
603 0.1
604 0.11
605 0.1
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.11
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.03
618 0.04
619 0.04
620 0.03
621 0.04
622 0.04
623 0.07
624 0.08
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.13
629 0.15
630 0.16
631 0.19
632 0.25
633 0.27
634 0.3
635 0.32
636 0.32
637 0.31
638 0.32
639 0.27
640 0.2
641 0.18
642 0.13
643 0.11
644 0.14
645 0.14
646 0.13
647 0.13
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.15
652 0.12
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.13
657 0.15
658 0.14
659 0.13
660 0.12
661 0.12
662 0.11
663 0.11
664 0.1
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.13
669 0.16
670 0.16
671 0.17
672 0.16
673 0.16
674 0.16
675 0.17
676 0.16
677 0.14
678 0.14
679 0.13
680 0.13
681 0.12
682 0.09
683 0.11
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.15
689 0.15
690 0.16
691 0.14
692 0.13
693 0.1
694 0.13
695 0.15
696 0.13
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.1
701 0.11
702 0.07
703 0.06
704 0.05
705 0.07
706 0.08
707 0.1
708 0.1
709 0.1
710 0.11
711 0.12
712 0.13
713 0.16
714 0.18
715 0.17
716 0.2
717 0.19
718 0.19
719 0.19
720 0.18
721 0.15
722 0.12
723 0.11
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.06
728 0.06
729 0.05
730 0.06
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.07
737 0.08
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.05
745 0.04
746 0.03
747 0.03
748 0.03
749 0.04
750 0.05
751 0.05
752 0.06
753 0.06
754 0.07
755 0.08
756 0.09
757 0.08
758 0.08
759 0.09
760 0.14
761 0.13
762 0.14
763 0.13
764 0.13
765 0.13
766 0.12
767 0.13
768 0.08
769 0.08
770 0.08
771 0.08
772 0.07
773 0.14
774 0.14
775 0.15
776 0.2
777 0.27
778 0.29
779 0.32
780 0.34
781 0.34
782 0.37
783 0.39
784 0.35
785 0.29
786 0.29
787 0.33
788 0.35
789 0.32
790 0.33
791 0.37
792 0.42
793 0.45
794 0.52
795 0.55
796 0.63
797 0.7
798 0.75
799 0.77
800 0.79
801 0.83
802 0.84
803 0.82
804 0.75
805 0.67
806 0.6
807 0.54
808 0.47
809 0.41
810 0.32
811 0.28
812 0.25
813 0.26
814 0.24
815 0.22
816 0.21
817 0.21
818 0.23
819 0.22
820 0.25
821 0.26
822 0.32
823 0.33
824 0.34
825 0.38
826 0.4
827 0.48
828 0.52
829 0.53
830 0.56
831 0.63
832 0.67
833 0.71
834 0.75
835 0.76
836 0.79
837 0.82
838 0.82
839 0.82
840 0.83
841 0.8
842 0.77
843 0.7
844 0.6
845 0.52
846 0.45
847 0.36
848 0.29
849 0.22
850 0.18
851 0.14
852 0.15
853 0.13
854 0.12
855 0.17
856 0.2
857 0.23
858 0.2
859 0.2
860 0.19
861 0.19
862 0.2
863 0.15
864 0.13
865 0.11
866 0.11
867 0.12
868 0.12
869 0.13
870 0.15
871 0.14
872 0.13
873 0.13
874 0.14
875 0.14
876 0.16
877 0.15
878 0.12
879 0.14
880 0.13
881 0.12
882 0.11
883 0.1
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.08
889 0.09
890 0.08
891 0.08
892 0.09
893 0.08
894 0.11
895 0.12
896 0.13
897 0.19
898 0.27
899 0.32
900 0.37
901 0.44
902 0.44
903 0.48
904 0.49
905 0.49
906 0.43
907 0.44
908 0.47
909 0.41
910 0.39
911 0.37
912 0.34
913 0.31
914 0.32
915 0.28
916 0.2
917 0.2
918 0.23
919 0.19
920 0.2
921 0.18
922 0.15
923 0.13
924 0.14
925 0.13
926 0.1
927 0.09
928 0.08
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.06
933 0.05
934 0.06
935 0.07
936 0.08
937 0.09
938 0.1
939 0.14
940 0.15
941 0.18
942 0.21
943 0.22
944 0.25
945 0.26
946 0.29
947 0.26
948 0.25
949 0.23
950 0.19
951 0.17
952 0.15
953 0.13
954 0.09
955 0.07
956 0.06
957 0.06
958 0.06
959 0.06
960 0.06