Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7LYD1

Protein Details
Accession A0A1C7LYD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-221GPDGQPTNKRPRGRPKGSKNAKSKGKTPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-220KRPRGRPKGSKNAKSKGKT
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MASAASGSSAAPAAGSSNPPILATGDWTKNLVHLAKTAELKKHALTLQLHTAHILSAHASLEQKNKAIQDLKEQKNKLESERSRLLNCLREADLLEATLNKESAELRQKIQVITDGDYAIAKQDVDKLRQELGQPPLPSLQSTLEEKSAESASPFSVGIRSGLPELCRYLKALRLQAESASASVGNKRNAEEYGPDGQPTNKRPRGRPKGSKNAKSKGKTPAPSDGTAGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.11
4 0.13
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.16
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.23
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.23
19 0.18
20 0.18
21 0.2
22 0.24
23 0.3
24 0.32
25 0.33
26 0.34
27 0.35
28 0.33
29 0.35
30 0.31
31 0.32
32 0.3
33 0.3
34 0.35
35 0.35
36 0.34
37 0.29
38 0.28
39 0.22
40 0.2
41 0.16
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.2
52 0.2
53 0.23
54 0.27
55 0.26
56 0.31
57 0.4
58 0.46
59 0.52
60 0.52
61 0.5
62 0.52
63 0.52
64 0.46
65 0.46
66 0.41
67 0.41
68 0.47
69 0.47
70 0.42
71 0.43
72 0.42
73 0.37
74 0.36
75 0.31
76 0.25
77 0.23
78 0.23
79 0.21
80 0.18
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.1
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.23
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.04
110 0.1
111 0.12
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.22
118 0.21
119 0.24
120 0.27
121 0.25
122 0.24
123 0.25
124 0.23
125 0.22
126 0.18
127 0.15
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.18
157 0.22
158 0.26
159 0.31
160 0.32
161 0.33
162 0.33
163 0.32
164 0.32
165 0.27
166 0.22
167 0.17
168 0.13
169 0.1
170 0.16
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.24
175 0.25
176 0.26
177 0.27
178 0.24
179 0.23
180 0.26
181 0.25
182 0.24
183 0.23
184 0.27
185 0.32
186 0.36
187 0.42
188 0.44
189 0.5
190 0.58
191 0.69
192 0.75
193 0.8
194 0.83
195 0.83
196 0.87
197 0.92
198 0.92
199 0.9
200 0.89
201 0.89
202 0.83
203 0.79
204 0.78
205 0.77
206 0.74
207 0.7
208 0.7
209 0.66
210 0.62