Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C7YLJ1

Protein Details
Accession C7YLJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63NPPDQSSPERPLKRRRAGTRGRAAVTHydrophilic
604-624EIPVKWLPKKARPKNPLDEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-59PLKRRRAGTRGR
160-172KKAAEKRRPITKE
608-616KWLPKKARP
Subcellular Location(s) mito 20, cyto_mito 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG nhe:NECHADRAFT_91713  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MTGRKRIATRSSTRRGAAAAAPTGGEIYRDMLAEAGVNPPDQSSPERPLKRRRAGTRGRAAVTEKSPEPVPPQSAPAHNDDDDEEDEDDDEDIEFQDVILPEPTMQTMELESDDEDDEDEDIIFEDVDFTAPIQESAPSQEPKTLELNLTAHQSSAAQGKKAAEKRRPITKEERILRKDVHKAHLLCLLSHVARRNHWCNDGKVQDYLRPHLTDKMVNYLNPGANLPQFGRTESLKNGLKQAEGVWKTKFEITERGLRRALWAEEPDHLKDYEPPSDMESCLDRQDFREAAKKLQGSRDVGAQLYCALLRSVGVRARLVCSLQPLACTSGAPTLQKPKPSKASAKAAKNEQVKATMAKYQDMANAGYGSPSGGSSARRRLGHPNATAYNFTPKAAPSRPQPTFETRKKIKESSYPVYWVEILDVGHQKWQPVDAVVTNTFWKPKALEPPITDKENFLSYVVAFDADGTAKDVTRRYAKAYTAKTRRSRIEIASEDGEAWWRKVMKLYRPRRRTDLDQIEDNELAGIEAREPMPRNVQDFKDHPVYALTRHLRRHEVLVPDATPSGTVATSSRGKLEKVYRRKDVRIARTADKWFRLGREVKPLEIPVKWLPKKARPKNPLDEEDEDDAQGDAGTPIYTEEQTELYVPEPVRNGRVPKNKFGNIDVYVPSMVPPGGAHIIHEYATRAAFLAGVDYAPALTGFQFKGRHGTAVLSGVVIAKEYEEGVRAIIDGLGDLEQQVEDERRKHRAFRAWRKFMMGLRIREQIWSGVDADERRAADDKAAREAQLDQEIEDAPSDVTEEFDMADDDDMGGGFLVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.55
3 0.5
4 0.44
5 0.39
6 0.32
7 0.26
8 0.25
9 0.23
10 0.22
11 0.18
12 0.15
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.2
30 0.22
31 0.29
32 0.39
33 0.48
34 0.55
35 0.66
36 0.74
37 0.78
38 0.83
39 0.84
40 0.85
41 0.86
42 0.89
43 0.88
44 0.85
45 0.77
46 0.71
47 0.65
48 0.61
49 0.54
50 0.5
51 0.4
52 0.35
53 0.34
54 0.33
55 0.35
56 0.33
57 0.35
58 0.31
59 0.34
60 0.36
61 0.4
62 0.41
63 0.41
64 0.41
65 0.36
66 0.35
67 0.32
68 0.31
69 0.27
70 0.27
71 0.22
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.11
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.1
84 0.09
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.14
124 0.2
125 0.2
126 0.21
127 0.25
128 0.25
129 0.27
130 0.3
131 0.26
132 0.21
133 0.23
134 0.24
135 0.22
136 0.25
137 0.22
138 0.19
139 0.17
140 0.17
141 0.15
142 0.2
143 0.2
144 0.17
145 0.19
146 0.22
147 0.31
148 0.38
149 0.45
150 0.46
151 0.53
152 0.59
153 0.67
154 0.68
155 0.67
156 0.69
157 0.7
158 0.72
159 0.72
160 0.75
161 0.68
162 0.69
163 0.67
164 0.64
165 0.63
166 0.59
167 0.56
168 0.53
169 0.51
170 0.49
171 0.5
172 0.43
173 0.34
174 0.31
175 0.29
176 0.22
177 0.24
178 0.28
179 0.25
180 0.29
181 0.37
182 0.41
183 0.42
184 0.49
185 0.5
186 0.48
187 0.54
188 0.54
189 0.49
190 0.47
191 0.44
192 0.4
193 0.39
194 0.39
195 0.34
196 0.31
197 0.3
198 0.31
199 0.32
200 0.31
201 0.29
202 0.32
203 0.3
204 0.28
205 0.29
206 0.28
207 0.27
208 0.24
209 0.23
210 0.17
211 0.16
212 0.18
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.18
219 0.21
220 0.21
221 0.28
222 0.27
223 0.28
224 0.32
225 0.3
226 0.28
227 0.26
228 0.27
229 0.28
230 0.27
231 0.29
232 0.25
233 0.25
234 0.26
235 0.28
236 0.27
237 0.2
238 0.24
239 0.25
240 0.33
241 0.35
242 0.38
243 0.37
244 0.35
245 0.35
246 0.32
247 0.31
248 0.25
249 0.24
250 0.21
251 0.24
252 0.27
253 0.26
254 0.24
255 0.22
256 0.19
257 0.21
258 0.23
259 0.24
260 0.22
261 0.21
262 0.22
263 0.23
264 0.23
265 0.19
266 0.18
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.14
271 0.15
272 0.19
273 0.19
274 0.19
275 0.26
276 0.25
277 0.27
278 0.32
279 0.33
280 0.31
281 0.35
282 0.38
283 0.33
284 0.32
285 0.33
286 0.28
287 0.26
288 0.23
289 0.18
290 0.13
291 0.1
292 0.09
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.09
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.14
320 0.21
321 0.24
322 0.31
323 0.33
324 0.36
325 0.42
326 0.46
327 0.52
328 0.49
329 0.57
330 0.58
331 0.62
332 0.6
333 0.57
334 0.59
335 0.56
336 0.51
337 0.42
338 0.37
339 0.31
340 0.28
341 0.25
342 0.22
343 0.18
344 0.17
345 0.17
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.08
361 0.11
362 0.17
363 0.22
364 0.23
365 0.26
366 0.33
367 0.4
368 0.44
369 0.43
370 0.42
371 0.4
372 0.4
373 0.39
374 0.31
375 0.3
376 0.23
377 0.21
378 0.17
379 0.15
380 0.19
381 0.2
382 0.23
383 0.22
384 0.3
385 0.32
386 0.34
387 0.37
388 0.39
389 0.46
390 0.49
391 0.53
392 0.49
393 0.54
394 0.55
395 0.55
396 0.51
397 0.5
398 0.52
399 0.48
400 0.45
401 0.41
402 0.37
403 0.34
404 0.31
405 0.23
406 0.16
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.12
416 0.13
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.13
431 0.22
432 0.25
433 0.29
434 0.31
435 0.39
436 0.41
437 0.43
438 0.39
439 0.31
440 0.28
441 0.24
442 0.22
443 0.14
444 0.11
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.08
458 0.09
459 0.12
460 0.16
461 0.17
462 0.2
463 0.23
464 0.27
465 0.33
466 0.39
467 0.46
468 0.5
469 0.58
470 0.6
471 0.62
472 0.62
473 0.6
474 0.58
475 0.51
476 0.5
477 0.44
478 0.41
479 0.36
480 0.32
481 0.26
482 0.22
483 0.22
484 0.15
485 0.13
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.17
490 0.22
491 0.29
492 0.39
493 0.49
494 0.58
495 0.65
496 0.69
497 0.69
498 0.7
499 0.68
500 0.68
501 0.67
502 0.61
503 0.58
504 0.56
505 0.52
506 0.46
507 0.38
508 0.27
509 0.17
510 0.13
511 0.08
512 0.06
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.08
517 0.1
518 0.12
519 0.18
520 0.2
521 0.24
522 0.27
523 0.29
524 0.32
525 0.32
526 0.35
527 0.35
528 0.33
529 0.3
530 0.28
531 0.27
532 0.23
533 0.3
534 0.31
535 0.29
536 0.34
537 0.37
538 0.38
539 0.39
540 0.42
541 0.39
542 0.37
543 0.34
544 0.33
545 0.29
546 0.26
547 0.25
548 0.2
549 0.15
550 0.11
551 0.09
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.1
556 0.13
557 0.14
558 0.17
559 0.18
560 0.18
561 0.24
562 0.33
563 0.39
564 0.46
565 0.53
566 0.59
567 0.64
568 0.67
569 0.7
570 0.7
571 0.69
572 0.67
573 0.65
574 0.6
575 0.61
576 0.64
577 0.61
578 0.53
579 0.48
580 0.42
581 0.38
582 0.41
583 0.39
584 0.36
585 0.41
586 0.4
587 0.38
588 0.39
589 0.39
590 0.35
591 0.3
592 0.31
593 0.27
594 0.36
595 0.36
596 0.4
597 0.44
598 0.51
599 0.62
600 0.67
601 0.72
602 0.7
603 0.77
604 0.81
605 0.84
606 0.79
607 0.75
608 0.69
609 0.63
610 0.58
611 0.5
612 0.39
613 0.31
614 0.25
615 0.18
616 0.14
617 0.09
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.04
622 0.05
623 0.07
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.11
630 0.1
631 0.09
632 0.14
633 0.13
634 0.15
635 0.17
636 0.18
637 0.22
638 0.26
639 0.31
640 0.36
641 0.46
642 0.48
643 0.55
644 0.62
645 0.63
646 0.61
647 0.59
648 0.56
649 0.49
650 0.47
651 0.39
652 0.32
653 0.27
654 0.24
655 0.21
656 0.15
657 0.12
658 0.09
659 0.08
660 0.09
661 0.12
662 0.12
663 0.12
664 0.13
665 0.15
666 0.15
667 0.16
668 0.14
669 0.12
670 0.13
671 0.12
672 0.1
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.07
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.05
686 0.08
687 0.09
688 0.14
689 0.17
690 0.17
691 0.25
692 0.25
693 0.26
694 0.24
695 0.25
696 0.23
697 0.23
698 0.22
699 0.15
700 0.14
701 0.14
702 0.13
703 0.11
704 0.09
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.07
717 0.06
718 0.06
719 0.07
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.09
726 0.12
727 0.16
728 0.22
729 0.27
730 0.36
731 0.4
732 0.46
733 0.52
734 0.58
735 0.65
736 0.71
737 0.77
738 0.77
739 0.76
740 0.76
741 0.72
742 0.66
743 0.65
744 0.62
745 0.57
746 0.52
747 0.55
748 0.49
749 0.46
750 0.43
751 0.36
752 0.29
753 0.25
754 0.22
755 0.18
756 0.22
757 0.21
758 0.23
759 0.23
760 0.22
761 0.22
762 0.24
763 0.23
764 0.26
765 0.31
766 0.3
767 0.34
768 0.35
769 0.33
770 0.32
771 0.34
772 0.32
773 0.33
774 0.31
775 0.23
776 0.23
777 0.24
778 0.23
779 0.21
780 0.17
781 0.1
782 0.09
783 0.1
784 0.08
785 0.09
786 0.09
787 0.08
788 0.08
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.07
797 0.07